Protein–RNA interactions for Protein: P53080

EDC1, Enhancer of mRNA-decapping protein 1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
EDC1P53080 SPC24YMR117C 642 nt-1.1□□□□□ -2.59
EDC1P53080 YOL029CYOL029C 606 nt-1.1□□□□□ -2.59
EDC1P53080 snR5snR5 204 nt-1.11□□□□□ -2.59
EDC1P53080 YER135CYER135C 393 nt-1.11□□□□□ -2.59
EDC1P53080 RPL22BYFL034C-A 369 nt-1.11□□□□□ -2.59
EDC1P53080 ATG16YMR159C 453 nt-1.11□□□□□ -2.59
EDC1P53080 YBL107W-AYBL107W-A 105 nt-1.12□□□□□ -2.59
EDC1P53080 SGF11YPL047W 300 nt-1.12□□□□□ -2.59
EDC1P53080 snR51snR51 107 nt-1.12□□□□□ -2.59
EDC1P53080 BUD26YDR241W 288 nt-1.13□□□□□ -2.59
EDC1P53080 YER079WYER079W 633 nt-1.13□□□□□ -2.59
EDC1P53080 RPF1YHR088W 888 nt-1.13□□□□□ -2.59
EDC1P53080 APQ13YJL075C 417 nt-1.13□□□□□ -2.59
EDC1P53080 BLI1YKL061W 342 nt-1.13□□□□□ -2.59
EDC1P53080 YMR158W-BYMR158W-B 321 nt-1.13□□□□□ -2.59
EDC1P53080 YLR041WYLR041W 321 nt-1.14□□□□□ -2.59
EDC1P53080 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt-1.14□□□□□ -2.59
EDC1P53080 POP7YBR167C 423 nt-1.15□□□□□ -2.59
EDC1P53080 MRPL32YCR003W 552 nt-1.16□□□□□ -2.6
EDC1P53080 YGL015CYGL015C 393 nt-1.16□□□□□ -2.6
EDC1P53080 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt-1.17□□□□□ -2.6
EDC1P53080 YPR039WYPR039W 336 nt-1.17□□□□□ -2.6
EDC1P53080 ILM1YJR118C 612 nt-1.18□□□□□ -2.6
EDC1P53080 SNU13YEL026W 381 nt-1.19□□□□□ -2.6
EDC1P53080 MND1YGL183C 660 nt-1.19□□□□□ -2.6
EDC1P53080 YLR282CYLR282C 342 nt-1.19□□□□□ -2.6
EDC1P53080 YNL058CYNL058C 951 nt-1.2□□□□□ -2.6
EDC1P53080 YML100W-AYML100W-A 174 nt-1.21□□□□□ -2.6
EDC1P53080 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt-1.21□□□□□ -2.6
EDC1P53080 YCR001WYCR001W 315 nt-1.22□□□□□ -2.6
EDC1P53080 YCR100CYCR100C 951 nt-1.22□□□□□ -2.6
EDC1P53080 YPT6YLR262C 648 nt-1.22□□□□□ -2.6
EDC1P53080 HUR1YGL168W 333 nt-1.23□□□□□ -2.61
EDC1P53080 YGL230CYGL230C 444 nt-1.23□□□□□ -2.61
EDC1P53080 YBL062WYBL062W 381 nt-1.23□□□□□ -2.61
EDC1P53080 YHL041WYHL041W 450 nt-1.24□□□□□ -2.61
EDC1P53080 YMR254CYMR254C 309 nt-1.24□□□□□ -2.61
EDC1P53080 AGA2YGL032C 264 nt-1.26□□□□□ -2.61
EDC1P53080 TAH1YCR060W 336 nt-1.27□□□□□ -2.61
EDC1P53080 FYV7YLR068W 456 nt-1.27□□□□□ -2.61
EDC1P53080 ZEO1YOL109W 342 nt-1.27□□□□□ -2.61
EDC1P53080 YPL182CYPL182C 384 nt-1.27□□□□□ -2.61
EDC1P53080 YJL182CYJL182C 318 nt-1.28□□□□□ -2.61
EDC1P53080 CMC1YKL137W 336 nt-1.28□□□□□ -2.61
EDC1P53080 CUP1-1YHR053C 186 nt-1.29□□□□□ -2.62
EDC1P53080 CUP1-2YHR055C 186 nt-1.29□□□□□ -2.62
EDC1P53080 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt-1.29□□□□□ -2.62
EDC1P53080 PAU9YBL108C-A 129 nt-1.29□□□□□ -2.62
EDC1P53080 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt-1.31□□□□□ -2.62
EDC1P53080 HMLALPHA2YCL067C 633 nt-1.32□□□□□ -2.62
EDC1P53080 MATALPHA2YCR039C 633 nt-1.32□□□□□ -2.62
EDC1P53080 HMRA2YCR096C 360 nt-1.32□□□□□ -2.62
EDC1P53080 YER084W-AYER084W-A 513 nt-1.32□□□□□ -2.62
EDC1P53080 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-1.33□□□□□ -2.62
EDC1P53080 YNR077CYNR077C 255 nt-1.33□□□□□ -2.62
EDC1P53080 YGR270C-AYGR270C-A 219 nt-1.34□□□□□ -2.62
EDC1P53080 YDR366CYDR366C 399 nt-1.35□□□□□ -2.63
EDC1P53080 YLR154W-FYLR154W-F 141 nt-1.35□□□□□ -2.63
EDC1P53080 YLR334CYLR334C 381 nt-1.35□□□□□ -2.63
EDC1P53080 YOR015WYOR015W 360 nt-1.35□□□□□ -2.63
EDC1P53080 YGR025WYGR025W 303 nt-1.36□□□□□ -2.63
EDC1P53080 YHR130CYHR130C 336 nt-1.36□□□□□ -2.63
EDC1P53080 YOR170WYOR170W 306 nt-1.37□□□□□ -2.63
EDC1P53080 snR34snR34 203 nt-1.37□□□□□ -2.63
EDC1P53080 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt-1.38□□□□□ -2.63
EDC1P53080 YLR217WYLR217W 324 nt-1.38□□□□□ -2.63
EDC1P53080 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt-1.4□□□□□ -2.63
EDC1P53080 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt-1.41□□□□□ -2.64
EDC1P53080 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt-1.41□□□□□ -2.64
EDC1P53080 SDH6YDR379C-A 240 nt-1.42□□□□□ -2.64
EDC1P53080 YGL182CYGL182C 324 nt-1.42□□□□□ -2.64
EDC1P53080 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt-1.42□□□□□ -2.64
EDC1P53080 YKL083WYKL083W 615 nt-1.42□□□□□ -2.64
EDC1P53080 SCEIQ0160 708 nt-1.43□□□□□ -2.64
EDC1P53080 YIL032CYIL032C 357 nt-1.43□□□□□ -2.64
EDC1P53080 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt-1.44□□□□□ -2.64
EDC1P53080 YDL011CYDL011C 324 nt-1.46□□□□□ -2.64
EDC1P53080 YJR087WYJR087W 351 nt-1.46□□□□□ -2.64
EDC1P53080 YNL303WYNL303W 348 nt-1.46□□□□□ -2.64
EDC1P53080 snR49snR49 165 nt-1.46□□□□□ -2.64
EDC1P53080 YDR426CYDR426C 378 nt-1.47□□□□□ -2.64
EDC1P53080 YER053C-AYER053C-A 114 nt-1.48□□□□□ -2.65
EDC1P53080 AIM29YKR074W 468 nt-1.48□□□□□ -2.65
EDC1P53080 YER175W-AYER175W-A 165 nt-1.49□□□□□ -2.65
EDC1P53080 snR9snR9 187 nt-1.5□□□□□ -2.65
EDC1P53080 APQ12YIL040W 417 nt-1.5□□□□□ -2.65
EDC1P53080 YPL068CYPL068C 882 nt-1.5□□□□□ -2.65
EDC1P53080 YPL229WYPL229W 621 nt-1.5□□□□□ -2.65
EDC1P53080 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt-1.52□□□□□ -2.65
EDC1P53080 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.53□□□□□ -2.65
EDC1P53080 YAR029WYAR029W 225 nt-1.53□□□□□ -2.65
EDC1P53080 YKL044WYKL044W 321 nt-1.54□□□□□ -2.66
EDC1P53080 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt-1.54□□□□□ -2.66
EDC1P53080 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt-1.55□□□□□ -2.66
EDC1P53080 TSC3YBR058C-A 243 nt-1.55□□□□□ -2.66
EDC1P53080 YGL052WYGL052W 306 nt-1.56□□□□□ -2.66
EDC1P53080 YBL071CYBL071C 309 nt-1.58□□□□□ -2.66
EDC1P53080 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt-1.59□□□□□ -2.66
EDC1P53080 SKI7YOR076C 2244 nt-1.6□□□□□ -2.67
EDC1P53080 YFL063WYFL063W 456 nt-1.6□□□□□ -2.67
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