Protein–RNA interactions for Protein: P53063

RAI1, Decapping nuclease RAI1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RAI1P53063 NUP170YBL079W 4509 nt1.84□□□□□ -2.11
RAI1P53063 PAN2YGL094C 3348 nt1.84□□□□□ -2.12
RAI1P53063 DNA2YHR164C 4569 nt1.84□□□□□ -2.12
RAI1P53063 UFD2YDL190C 2886 nt1.84□□□□□ -2.12
RAI1P53063 TBS1YBR150C 3285 nt1.83□□□□□ -2.12
RAI1P53063 SLN1YIL147C 3663 nt1.83□□□□□ -2.12
RAI1P53063 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt1.83□□□□□ -2.12
RAI1P53063 MGA2YIR033W 3342 nt1.82□□□□□ -2.12
RAI1P53063 LHS1YKL073W 2646 nt1.82□□□□□ -2.12
RAI1P53063 MBB1YJL199C 327 nt1.82□□□□□ -2.12
RAI1P53063 COA6YMR244C-A 315 nt1.82□□□□□ -2.12
RAI1P53063 YLL054CYLL054C 2532 nt1.82□□□□□ -2.12
RAI1P53063 YOR019WYOR019W 2193 nt1.82□□□□□ -2.12
RAI1P53063 SKI3YPR189W 4299 nt1.81□□□□□ -2.12
RAI1P53063 MMS4YBR098W 2076 nt1.81□□□□□ -2.12
RAI1P53063 SLX4YLR135W 2247 nt1.81□□□□□ -2.12
RAI1P53063 KCS1YDR017C 3153 nt1.8□□□□□ -2.12
RAI1P53063 KIP1YBL063W 3336 nt1.8□□□□□ -2.12
RAI1P53063 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt1.8□□□□□ -2.12
RAI1P53063 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt1.8□□□□□ -2.12
RAI1P53063 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt1.8□□□□□ -2.12
RAI1P53063 YBR178WYBR178W 375 nt1.8□□□□□ -2.12
RAI1P53063 INO80YGL150C 4470 nt1.79□□□□□ -2.12
RAI1P53063 PDR3YBL005W 2931 nt1.79□□□□□ -2.12
RAI1P53063 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.79□□□□□ -2.12
RAI1P53063 MYO2YOR326W 4725 nt1.79□□□□□ -2.12
RAI1P53063 snR14snR14 160 nt1.78□□□□□ -2.12
RAI1P53063 YAR009CYAR009C 3591 nt1.78□□□□□ -2.13
RAI1P53063 RSM22YKL155C 1887 nt1.77□□□□□ -2.13
RAI1P53063 SMC4YLR086W 4257 nt1.77□□□□□ -2.13
RAI1P53063 YOL019W-AYOL019W-A 153 nt1.77□□□□□ -2.13
RAI1P53063 BFR2YDR299W 1605 nt1.77□□□□□ -2.13
RAI1P53063 YGL182CYGL182C 324 nt1.76□□□□□ -2.13
RAI1P53063 YCS4YLR272C 3531 nt1.76□□□□□ -2.13
RAI1P53063 RTP1YMR185W 2946 nt1.76□□□□□ -2.13
RAI1P53063 YOR093CYOR093C 4947 nt1.75□□□□□ -2.13
RAI1P53063 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt1.75□□□□□ -2.13
RAI1P53063 GYP5YPL249C 2685 nt1.75□□□□□ -2.13
RAI1P53063 MON2YNL297C 4911 nt1.74□□□□□ -2.13
RAI1P53063 CHS6YJL099W 2241 nt1.74□□□□□ -2.13
RAI1P53063 UTP8YGR128C 2142 nt1.74□□□□□ -2.13
RAI1P53063 YLL020CYLL020C 306 nt1.74□□□□□ -2.13
RAI1P53063 IRC20YLR247C 4671 nt1.73□□□□□ -2.13
RAI1P53063 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt1.73□□□□□ -2.13
RAI1P53063 COX5BYIL111W 456 nt1.73□□□□□ -2.13
RAI1P53063 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt1.73□□□□□ -2.13
RAI1P53063 YBL109WYBL109W 336 nt1.73□□□□□ -2.13
RAI1P53063 KAP122YGL016W 3246 nt1.73□□□□□ -2.13
RAI1P53063 snR70snR70 164 nt1.72□□□□□ -2.13
RAI1P53063 CMC4YMR194C-B 222 nt1.72□□□□□ -2.13
RAI1P53063 OST4YDL232W 111 nt1.71□□□□□ -2.14
RAI1P53063 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt1.71□□□□□ -2.14
RAI1P53063 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt1.71□□□□□ -2.14
RAI1P53063 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt1.71□□□□□ -2.14
RAI1P53063 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt1.71□□□□□ -2.14
RAI1P53063 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt1.71□□□□□ -2.14
RAI1P53063 YBR099CYBR099C 384 nt1.71□□□□□ -2.14
RAI1P53063 EAF1YDR359C 2949 nt1.71□□□□□ -2.14
RAI1P53063 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt1.7□□□□□ -2.14
RAI1P53063 SMC1YFL008W 3678 nt1.7□□□□□ -2.14
RAI1P53063 STB6YKL072W 2301 nt1.7□□□□□ -2.14
RAI1P53063 YLR282CYLR282C 342 nt1.7□□□□□ -2.14
RAI1P53063 YLR422WYLR422W 5799 nt1.7□□□□□ -2.14
RAI1P53063 VPS15YBR097W 4365 nt1.69□□□□□ -2.14
RAI1P53063 STO1YMR125W 2586 nt1.68□□□□□ -2.14
RAI1P53063 SAC3YDR159W 3906 nt1.68□□□□□ -2.14
RAI1P53063 SET3YKR029C 2256 nt1.68□□□□□ -2.14
RAI1P53063 NUP157YER105C 4176 nt1.67□□□□□ -2.14
RAI1P53063 YDR544CYDR544C 429 nt1.67□□□□□ -2.14
RAI1P53063 FAB1YFR019W 6837 nt1.66□□□□□ -2.14
RAI1P53063 TFB5YDR079C-A 219 nt1.66□□□□□ -2.14
RAI1P53063 PMP2YEL017C-A 132 nt1.66□□□□□ -2.14
RAI1P53063 NOP9YJL010C 2001 nt1.66□□□□□ -2.14
RAI1P53063 PEP1YBL017C 4740 nt1.65□□□□□ -2.15
RAI1P53063 YML002WYML002W 2214 nt1.65□□□□□ -2.15
RAI1P53063 TAH1YCR060W 336 nt1.65□□□□□ -2.15
RAI1P53063 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt1.65□□□□□ -2.15
RAI1P53063 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt1.65□□□□□ -2.15
RAI1P53063 PKH3YDR466W 2697 nt1.65□□□□□ -2.15
RAI1P53063 DNF3YMR162C 4971 nt1.65□□□□□ -2.15
RAI1P53063 SOM1YEL059C-A 225 nt1.64□□□□□ -2.15
RAI1P53063 YPP1YGR198W 2454 nt1.64□□□□□ -2.15
RAI1P53063 TRM732YMR259C 4263 nt1.64□□□□□ -2.15
RAI1P53063 QCR9YGR183C 201 nt1.63□□□□□ -2.15
RAI1P53063 YMR326CYMR326C 309 nt1.63□□□□□ -2.15
RAI1P53063 WAR1YML076C 2835 nt1.62□□□□□ -2.15
RAI1P53063 YLR041WYLR041W 321 nt1.62□□□□□ -2.15
RAI1P53063 PMD1YER132C 5262 nt1.62□□□□□ -2.15
RAI1P53063 SWI4YER111C 3282 nt1.61□□□□□ -2.15
RAI1P53063 APL3YBL037W 3078 nt1.6□□□□□ -2.15
RAI1P53063 snR39BsnR39B 96 nt1.6□□□□□ -2.15
RAI1P53063 FYV10YIL097W 1551 nt1.59□□□□□ -2.15
RAI1P53063 SEC21YNL287W 2808 nt1.59□□□□□ -2.15
RAI1P53063 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt1.59□□□□□ -2.15
RAI1P53063 snR190snR190 190 nt1.59□□□□□ -2.15
RAI1P53063 ASE1YOR058C 2658 nt1.58□□□□□ -2.16
RAI1P53063 REV3YPL167C 4515 nt1.58□□□□□ -2.16
RAI1P53063 FIG2YCR089W 4830 nt1.57□□□□□ -2.16
RAI1P53063 BST1YFL025C 3090 nt1.57□□□□□ -2.16
RAI1P53063 RPL26BYGR034W 384 nt1.57□□□□□ -2.16
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