Protein–RNA interactions for Protein: P47172

YJR141W, Uncharacterized protein YJR141W, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YJR141WP47172 SGF11YPL047W 300 nt0.63□□□□□ -2.31
YJR141WP47172 YPL225WYPL225W 441 nt0.63□□□□□ -2.31
YJR141WP47172 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.63□□□□□ -2.31
YJR141WP47172 DBP6YNR038W 1890 nt0.63□□□□□ -2.31
YJR141WP47172 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.62□□□□□ -2.31
YJR141WP47172 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.62□□□□□ -2.31
YJR141WP47172 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.62□□□□□ -2.31
YJR141WP47172 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.62□□□□□ -2.31
YJR141WP47172 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.62□□□□□ -2.31
YJR141WP47172 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.62□□□□□ -2.31
YJR141WP47172 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.62□□□□□ -2.31
YJR141WP47172 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.62□□□□□ -2.31
YJR141WP47172 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.62□□□□□ -2.31
YJR141WP47172 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.62□□□□□ -2.31
YJR141WP47172 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.62□□□□□ -2.31
YJR141WP47172 YNL211CYNL211C 261 nt0.62□□□□□ -2.31
YJR141WP47172 IES4YOR189W 351 nt0.62□□□□□ -2.31
YJR141WP47172 YMR160WYMR160W 2451 nt0.62□□□□□ -2.31
YJR141WP47172 HMRA2YCR096C 360 nt0.61□□□□□ -2.31
YJR141WP47172 HMRA1YCR097W 381 nt0.61□□□□□ -2.31
YJR141WP47172 GIM4YEL003W 336 nt0.61□□□□□ -2.31
YJR141WP47172 ISD11YER048W-A 285 nt0.61□□□□□ -2.31
YJR141WP47172 COG8YML071C 1824 nt0.61□□□□□ -2.31
YJR141WP47172 NOP9YJL010C 2001 nt0.6□□□□□ -2.31
YJR141WP47172 UTP10YJL109C 5310 nt0.59□□□□□ -2.31
YJR141WP47172 PMP1YCR024C-A 123 nt0.59□□□□□ -2.31
YJR141WP47172 YPL044CYPL044C 549 nt0.59□□□□□ -2.31
YJR141WP47172 snR56snR56 88 nt0.58□□□□□ -2.32
YJR141WP47172 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt0.58□□□□□ -2.32
YJR141WP47172 LTE1YAL024C 4308 nt0.58□□□□□ -2.32
YJR141WP47172 snR60snR60 104 nt0.57□□□□□ -2.32
YJR141WP47172 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt0.57□□□□□ -2.32
YJR141WP47172 snR36snR36 182 nt0.57□□□□□ -2.32
YJR141WP47172 YML002WYML002W 2214 nt0.56□□□□□ -2.32
YJR141WP47172 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt0.56□□□□□ -2.32
YJR141WP47172 YOR282WYOR282W 321 nt0.56□□□□□ -2.32
YJR141WP47172 PRP16YKR086W 3216 nt0.56□□□□□ -2.32
YJR141WP47172 CHS6YJL099W 2241 nt0.56□□□□□ -2.32
YJR141WP47172 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt0.55□□□□□ -2.32
YJR141WP47172 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt0.55□□□□□ -2.32
YJR141WP47172 YFL032WYFL032W 321 nt0.55□□□□□ -2.32
YJR141WP47172 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt0.55□□□□□ -2.32
YJR141WP47172 NPR2YEL062W 1848 nt0.54□□□□□ -2.32
YJR141WP47172 HTL1YCR020W-B 237 nt0.54□□□□□ -2.32
YJR141WP47172 YIL032CYIL032C 357 nt0.54□□□□□ -2.32
YJR141WP47172 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.54□□□□□ -2.32
YJR141WP47172 YMR321CYMR321C 318 nt0.54□□□□□ -2.32
YJR141WP47172 VIK1YPL253C 1944 nt0.54□□□□□ -2.32
YJR141WP47172 UTP20YBL004W 7482 nt0.53□□□□□ -2.32
YJR141WP47172 RPS27BYHR021C 249 nt0.53□□□□□ -2.32
YJR141WP47172 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.53□□□□□ -2.32
YJR141WP47172 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt0.52□□□□□ -2.33
YJR141WP47172 YFL063WYFL063W 456 nt0.52□□□□□ -2.33
YJR141WP47172 YDR413CYDR413C 576 nt0.51□□□□□ -2.33
YJR141WP47172 ATP6Q0085 780 nt0.51□□□□□ -2.33
YJR141WP47172 QCR9YGR183C 201 nt0.51□□□□□ -2.33
YJR141WP47172 PAU12YGR294W 363 nt0.51□□□□□ -2.33
YJR141WP47172 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt0.51□□□□□ -2.33
YJR141WP47172 YOR015WYOR015W 360 nt0.51□□□□□ -2.33
YJR141WP47172 PAA1YDR071C 576 nt0.5□□□□□ -2.33
YJR141WP47172 YER097WYER097W 330 nt0.5□□□□□ -2.33
YJR141WP47172 RPL26BYGR034W 384 nt0.5□□□□□ -2.33
YJR141WP47172 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt0.5□□□□□ -2.33
YJR141WP47172 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt0.49□□□□□ -2.33
YJR141WP47172 YOR218CYOR218C 420 nt0.49□□□□□ -2.33
YJR141WP47172 FYV10YIL097W 1551 nt0.49□□□□□ -2.33
YJR141WP47172 YKL118WYKL118W 312 nt0.48□□□□□ -2.33
YJR141WP47172 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt0.48□□□□□ -2.33
YJR141WP47172 PRP5YBR237W 2550 nt0.47□□□□□ -2.33
YJR141WP47172 YGL149WYGL149W 306 nt0.47□□□□□ -2.33
YJR141WP47172 CSE2YNR010W 450 nt0.47□□□□□ -2.33
YJR141WP47172 YOL014WYOL014W 375 nt0.47□□□□□ -2.33
YJR141WP47172 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.47□□□□□ -2.33
YJR141WP47172 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt0.46□□□□□ -2.34
YJR141WP47172 snR190snR190 190 nt0.46□□□□□ -2.34
YJR141WP47172 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.46□□□□□ -2.34
YJR141WP47172 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt0.45□□□□□ -2.34
YJR141WP47172 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt0.44□□□□□ -2.34
YJR141WP47172 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.44□□□□□ -2.34
YJR141WP47172 COY1YKL179C 2040 nt0.43□□□□□ -2.34
YJR141WP47172 OST4YDL232W 111 nt0.43□□□□□ -2.34
YJR141WP47172 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.43□□□□□ -2.34
YJR141WP47172 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt0.43□□□□□ -2.34
YJR141WP47172 YOR345CYOR345C 351 nt0.43□□□□□ -2.34
YJR141WP47172 YPR092WYPR092W 306 nt0.43□□□□□ -2.34
YJR141WP47172 STE5YDR103W 2754 nt0.43□□□□□ -2.34
YJR141WP47172 RAD61YDR014W 1944 nt0.42□□□□□ -2.34
YJR141WP47172 SEC8YPR055W 3198 nt0.42□□□□□ -2.34
YJR141WP47172 snR74snR74 88 nt0.42□□□□□ -2.34
YJR141WP47172 ULI1YFR026C 510 nt0.42□□□□□ -2.34
YJR141WP47172 COX5BYIL111W 456 nt0.42□□□□□ -2.34
YJR141WP47172 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt0.42□□□□□ -2.34
YJR141WP47172 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt0.42□□□□□ -2.34
YJR141WP47172 YNL028WYNL028W 318 nt0.42□□□□□ -2.34
YJR141WP47172 TRS65YGR166W 1683 nt0.42□□□□□ -2.34
YJR141WP47172 YGR069WYGR069W 336 nt0.41□□□□□ -2.34
YJR141WP47172 YKL136WYKL136W 399 nt0.41□□□□□ -2.34
YJR141WP47172 YLR282CYLR282C 342 nt0.41□□□□□ -2.34
YJR141WP47172 ULP2YIL031W 3105 nt0.4□□□□□ -2.34
YJR141WP47172 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.4□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 28.1 ms