Protein–RNA interactions for Protein: P40992

RRN7, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN7, yeastyeast

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRN7P40992 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.64□□□□□ -1.99
RRN7P40992 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.64□□□□□ -1.99
RRN7P40992 COA6YMR244C-A 315 nt2.64□□□□□ -1.99
RRN7P40992 SSD1YDR293C 3753 nt2.64□□□□□ -1.99
RRN7P40992 PDR1YGL013C 3207 nt2.64□□□□□ -1.99
RRN7P40992 SAP1YER047C 2694 nt2.64□□□□□ -1.99
RRN7P40992 SEY1YOR165W 2331 nt2.63□□□□□ -1.99
RRN7P40992 SEC21YNL287W 2808 nt2.63□□□□□ -1.99
RRN7P40992 YDR209CYDR209C 414 nt2.63□□□□□ -1.99
RRN7P40992 TDA9YML081W 3756 nt2.62□□□□□ -1.99
RRN7P40992 FKS3YMR306W 5358 nt2.62□□□□□ -1.99
RRN7P40992 PAN2YGL094C 3348 nt2.61□□□□□ -1.99
RRN7P40992 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt2.6□□□□□ -1.99
RRN7P40992 LCL1YPL056C 306 nt2.6□□□□□ -1.99
RRN7P40992 ROM2YLR371W 4071 nt2.59□□□□□ -1.99
RRN7P40992 NOP9YJL010C 2001 nt2.59□□□□□ -2
RRN7P40992 TRL1YJL087C 2484 nt2.58□□□□□ -2
RRN7P40992 TIM9YEL020W-A 264 nt2.58□□□□□ -2
RRN7P40992 YPR097WYPR097W 3222 nt2.57□□□□□ -2
RRN7P40992 RGA1YOR127W 3024 nt2.57□□□□□ -2
RRN7P40992 ESC1YMR219W 4977 nt2.57□□□□□ -2
RRN7P40992 snR75snR75 89 nt2.57□□□□□ -2
RRN7P40992 IRE1YHR079C 3348 nt2.57□□□□□ -2
RRN7P40992 BNR1YIL159W 4128 nt2.57□□□□□ -2
RRN7P40992 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.56□□□□□ -2
RRN7P40992 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.56□□□□□ -2
RRN7P40992 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.56□□□□□ -2
RRN7P40992 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.56□□□□□ -2
RRN7P40992 YER138CYER138C 5268 nt2.56□□□□□ -2
RRN7P40992 YER160CYER160C 5268 nt2.56□□□□□ -2
RRN7P40992 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.56□□□□□ -2
RRN7P40992 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.56□□□□□ -2
RRN7P40992 YJR027WYJR027W 5268 nt2.56□□□□□ -2
RRN7P40992 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.56□□□□□ -2
RRN7P40992 YML039WYML039W 5268 nt2.56□□□□□ -2
RRN7P40992 YML045WYML045W 5268 nt2.56□□□□□ -2
RRN7P40992 YMR050CYMR050C 5268 nt2.56□□□□□ -2
RRN7P40992 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.56□□□□□ -2
RRN7P40992 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.56□□□□□ -2
RRN7P40992 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.56□□□□□ -2
RRN7P40992 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.56□□□□□ -2
RRN7P40992 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.56□□□□□ -2
RRN7P40992 TRA1YHR099W 11235 nt2.56□□□□□ -2
RRN7P40992 SEC10YLR166C 2616 nt2.55□□□□□ -2
RRN7P40992 YDL073WYDL073W 2955 nt2.55□□□□□ -2
RRN7P40992 NUT1YGL151W 3399 nt2.55□□□□□ -2
RRN7P40992 SYH1YPL105C 2550 nt2.55□□□□□ -2
RRN7P40992 TOP2YNL088W 4287 nt2.55□□□□□ -2
RRN7P40992 NUP157YER105C 4176 nt2.55□□□□□ -2
RRN7P40992 UFD4YKL010C 4452 nt2.54□□□□□ -2
RRN7P40992 UBP3YER151C 2739 nt2.54□□□□□ -2
RRN7P40992 ARP8YOR141C 2646 nt2.54□□□□□ -2
RRN7P40992 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.54□□□□□ -2
RRN7P40992 YOR055WYOR055W 435 nt2.53□□□□□ -2
RRN7P40992 WAR1YML076C 2835 nt2.53□□□□□ -2
RRN7P40992 SGS1YMR190C 4344 nt2.52□□□□□ -2.01
RRN7P40992 RPS29AYLR388W 171 nt2.52□□□□□ -2.01
RRN7P40992 SPO24YPR036W-A 204 nt2.52□□□□□ -2.01
RRN7P40992 UBR1YGR184C 5853 nt2.52□□□□□ -2.01
RRN7P40992 TOF1YNL273W 3717 nt2.52□□□□□ -2.01
RRN7P40992 PET309YLR067C 2898 nt2.51□□□□□ -2.01
RRN7P40992 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt2.51□□□□□ -2.01
RRN7P40992 MMS4YBR098W 2076 nt2.49□□□□□ -2.01
RRN7P40992 SFB2YNL049C 2631 nt2.49□□□□□ -2.01
RRN7P40992 YKL225WYKL225W 348 nt2.49□□□□□ -2.01
RRN7P40992 NUM1YDR150W 8247 nt2.49□□□□□ -2.01
RRN7P40992 FAR11YNL127W 2862 nt2.48□□□□□ -2.01
RRN7P40992 AZF1YOR113W 2745 nt2.48□□□□□ -2.01
RRN7P40992 RPL26BYGR034W 384 nt2.47□□□□□ -2.01
RRN7P40992 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt2.47□□□□□ -2.01
RRN7P40992 YEF3YLR249W 3135 nt2.46□□□□□ -2.01
RRN7P40992 GYP5YPL249C 2685 nt2.46□□□□□ -2.01
RRN7P40992 KRE33YNL132W 3171 nt2.45□□□□□ -2.02
RRN7P40992 VPS13YLL040C 9435 nt2.45□□□□□ -2.02
RRN7P40992 YAR009CYAR009C 3591 nt2.45□□□□□ -2.02
RRN7P40992 SMC1YFL008W 3678 nt2.45□□□□□ -2.02
RRN7P40992 TOR1YJR066W 7413 nt2.45□□□□□ -2.02
RRN7P40992 PDR11YIL013C 4236 nt2.44□□□□□ -2.02
RRN7P40992 MSB1YOR188W 3414 nt2.44□□□□□ -2.02
RRN7P40992 snR190snR190 190 nt2.43□□□□□ -2.02
RRN7P40992 HIR3YJR140C 4947 nt2.43□□□□□ -2.02
RRN7P40992 PSD2YGR170W 3417 nt2.42□□□□□ -2.02
RRN7P40992 NUP170YBL079W 4509 nt2.42□□□□□ -2.02
RRN7P40992 MSH6YDR097C 3729 nt2.42□□□□□ -2.02
RRN7P40992 SCD5YOR329C 2619 nt2.42□□□□□ -2.02
RRN7P40992 INO80YGL150C 4470 nt2.41□□□□□ -2.02
RRN7P40992 UTP21YLR409C 2820 nt2.4□□□□□ -2.03
RRN7P40992 CHC1YGL206C 4962 nt2.39□□□□□ -2.03
RRN7P40992 NNF2YGR089W 2811 nt2.39□□□□□ -2.03
RRN7P40992 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt2.38□□□□□ -2.03
RRN7P40992 SPF1YEL031W 3648 nt2.37□□□□□ -2.03
RRN7P40992 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt2.37□□□□□ -2.03
RRN7P40992 PIK1YNL267W 3201 nt2.37□□□□□ -2.03
RRN7P40992 CHS1YNL192W 3396 nt2.36□□□□□ -2.03
RRN7P40992 YLR422WYLR422W 5799 nt2.36□□□□□ -2.03
RRN7P40992 GIP3YPL137C 3831 nt2.36□□□□□ -2.03
RRN7P40992 RTT101YJL047C 2529 nt2.36□□□□□ -2.03
RRN7P40992 EMC5YIL027C 426 nt2.35□□□□□ -2.03
RRN7P40992 SEC16YPL085W 6588 nt2.34□□□□□ -2.03
RRN7P40992 YCS4YLR272C 3531 nt2.34□□□□□ -2.03
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