Protein–RNA interactions for Protein: P38202

YBL028C, UPF0642 protein YBL028C, yeastyeast

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YBL028CP38202 HTB2YBL002W 396 nt0.81□□□□□ -2.28
YBL028CP38202 DBP6YNR038W 1890 nt0.81□□□□□ -2.28
YBL028CP38202 BIL1YOR304C-A 231 nt0.8□□□□□ -2.28
YBL028CP38202 SPO21YOL091W 1830 nt0.8□□□□□ -2.28
YBL028CP38202 RPS25BYLR333C 327 nt0.79□□□□□ -2.28
YBL028CP38202 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.78□□□□□ -2.28
YBL028CP38202 ECM12YHR021W-A 456 nt0.78□□□□□ -2.28
YBL028CP38202 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt0.78□□□□□ -2.28
YBL028CP38202 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt0.78□□□□□ -2.28
YBL028CP38202 HMRA2YCR096C 360 nt0.77□□□□□ -2.29
YBL028CP38202 SSS1YDR086C 243 nt0.77□□□□□ -2.29
YBL028CP38202 TAR1YLR154W-C 375 nt0.77□□□□□ -2.29
YBL028CP38202 YPL225WYPL225W 441 nt0.77□□□□□ -2.29
YBL028CP38202 YOR282WYOR282W 321 nt0.76□□□□□ -2.29
YBL028CP38202 YPL044CYPL044C 549 nt0.76□□□□□ -2.29
YBL028CP38202 YPR012WYPR012W 255 nt0.76□□□□□ -2.29
YBL028CP38202 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.76□□□□□ -2.29
YBL028CP38202 YNL211CYNL211C 261 nt0.75□□□□□ -2.29
YBL028CP38202 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt0.75□□□□□ -2.29
YBL028CP38202 IES4YOR189W 351 nt0.75□□□□□ -2.29
YBL028CP38202 YDR048CYDR048C 315 nt0.74□□□□□ -2.29
YBL028CP38202 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt0.74□□□□□ -2.29
YBL028CP38202 YOR218CYOR218C 420 nt0.74□□□□□ -2.29
YBL028CP38202 LTE1YAL024C 4308 nt0.74□□□□□ -2.29
YBL028CP38202 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.73□□□□□ -2.29
YBL028CP38202 CHS6YJL099W 2241 nt0.73□□□□□ -2.29
YBL028CP38202 YMR321CYMR321C 318 nt0.72□□□□□ -2.29
YBL028CP38202 YAF9YNL107W 681 nt0.72□□□□□ -2.29
YBL028CP38202 SGF11YPL047W 300 nt0.71□□□□□ -2.3
YBL028CP38202 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt0.71□□□□□ -2.3
YBL028CP38202 TRS65YGR166W 1683 nt0.7□□□□□ -2.3
YBL028CP38202 COG8YML071C 1824 nt0.69□□□□□ -2.3
YBL028CP38202 YDR102CYDR102C 333 nt0.69□□□□□ -2.3
YBL028CP38202 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.69□□□□□ -2.3
YBL028CP38202 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt0.68□□□□□ -2.3
YBL028CP38202 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.68□□□□□ -2.3
YBL028CP38202 NPR2YEL062W 1848 nt0.67□□□□□ -2.3
YBL028CP38202 PAA1YDR071C 576 nt0.67□□□□□ -2.3
YBL028CP38202 ULP2YIL031W 3105 nt0.67□□□□□ -2.3
YBL028CP38202 UTP10YJL109C 5310 nt0.65□□□□□ -2.31
YBL028CP38202 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt0.65□□□□□ -2.31
YBL028CP38202 FYV10YIL097W 1551 nt0.65□□□□□ -2.31
YBL028CP38202 RPL26BYGR034W 384 nt0.64□□□□□ -2.31
YBL028CP38202 HTL1YCR020W-B 237 nt0.63□□□□□ -2.31
YBL028CP38202 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.63□□□□□ -2.31
YBL028CP38202 FMP27YLR454W 7887 nt0.63□□□□□ -2.31
YBL028CP38202 PRP5YBR237W 2550 nt0.63□□□□□ -2.31
YBL028CP38202 YPR197CYPR197C 564 nt0.62□□□□□ -2.31
YBL028CP38202 YML002WYML002W 2214 nt0.62□□□□□ -2.31
YBL028CP38202 HAL9YOL089C 3093 nt0.62□□□□□ -2.31
YBL028CP38202 YSP1YHR155W 3687 nt0.62□□□□□ -2.31
YBL028CP38202 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt0.61□□□□□ -2.31
YBL028CP38202 AI1Q0050 2505 nt0.61□□□□□ -2.31
YBL028CP38202 BIR1YJR089W 2865 nt0.6□□□□□ -2.31
YBL028CP38202 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt0.6□□□□□ -2.31
YBL028CP38202 RPS27BYHR021C 249 nt0.6□□□□□ -2.31
YBL028CP38202 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt0.6□□□□□ -2.31
YBL028CP38202 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt0.58□□□□□ -2.32
YBL028CP38202 VIK1YPL253C 1944 nt0.58□□□□□ -2.32
YBL028CP38202 SEC8YPR055W 3198 nt0.57□□□□□ -2.32
YBL028CP38202 snR60snR60 104 nt0.56□□□□□ -2.32
YBL028CP38202 YIL032CYIL032C 357 nt0.56□□□□□ -2.32
YBL028CP38202 OST4YDL232W 111 nt0.55□□□□□ -2.32
YBL028CP38202 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.55□□□□□ -2.32
YBL028CP38202 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.55□□□□□ -2.32
YBL028CP38202 snR190snR190 190 nt0.55□□□□□ -2.32
YBL028CP38202 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt0.54□□□□□ -2.32
YBL028CP38202 YFL063WYFL063W 456 nt0.54□□□□□ -2.32
YBL028CP38202 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.54□□□□□ -2.32
YBL028CP38202 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt0.54□□□□□ -2.32
YBL028CP38202 ATP6Q0085 780 nt0.53□□□□□ -2.32
YBL028CP38202 YOR345CYOR345C 351 nt0.53□□□□□ -2.32
YBL028CP38202 snR36snR36 182 nt0.53□□□□□ -2.32
YBL028CP38202 YOR015WYOR015W 360 nt0.52□□□□□ -2.33
YBL028CP38202 BEM3YPL115C 3387 nt0.51□□□□□ -2.33
YBL028CP38202 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt0.51□□□□□ -2.33
YBL028CP38202 COX5BYIL111W 456 nt0.51□□□□□ -2.33
YBL028CP38202 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt0.51□□□□□ -2.33
YBL028CP38202 PRP42YDR235W 1635 nt0.5□□□□□ -2.33
YBL028CP38202 GIM4YEL003W 336 nt0.5□□□□□ -2.33
YBL028CP38202 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt0.5□□□□□ -2.33
YBL028CP38202 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt0.5□□□□□ -2.33
YBL028CP38202 YFL032WYFL032W 321 nt0.49□□□□□ -2.33
YBL028CP38202 CSE2YNR010W 450 nt0.49□□□□□ -2.33
YBL028CP38202 UTP8YGR128C 2142 nt0.49□□□□□ -2.33
YBL028CP38202 HMRA1YCR097W 381 nt0.48□□□□□ -2.33
YBL028CP38202 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.47□□□□□ -2.33
YBL028CP38202 ULI1YFR026C 510 nt0.47□□□□□ -2.33
YBL028CP38202 YLR282CYLR282C 342 nt0.47□□□□□ -2.33
YBL028CP38202 IQG1YPL242C 4488 nt0.47□□□□□ -2.33
YBL028CP38202 YCR022CYCR022C 345 nt0.46□□□□□ -2.34
YBL028CP38202 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt0.46□□□□□ -2.34
YBL028CP38202 YER097WYER097W 330 nt0.46□□□□□ -2.34
YBL028CP38202 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt0.46□□□□□ -2.34
YBL028CP38202 YPR092WYPR092W 306 nt0.46□□□□□ -2.34
YBL028CP38202 COY1YKL179C 2040 nt0.45□□□□□ -2.34
YBL028CP38202 SBH1YER087C-B 249 nt0.45□□□□□ -2.34
YBL028CP38202 YGR069WYGR069W 336 nt0.45□□□□□ -2.34
YBL028CP38202 YKL136WYKL136W 399 nt0.45□□□□□ -2.34
YBL028CP38202 YGL149WYGL149W 306 nt0.44□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 28.7 ms