Protein–RNA interactions for Protein: Q12089

AEP3, ATPase expression protein 3, yeastyeast

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Length 606 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AEP3Q12089 YAR009CYAR009C 3591 nt1.11□□□□□ -2.23
AEP3Q12089 RPL33BYOR234C 324 nt1.1□□□□□ -2.23
AEP3Q12089 ROM2YLR371W 4071 nt1.1□□□□□ -2.23
AEP3Q12089 RPL35AYDL191W 363 nt1.09□□□□□ -2.23
AEP3Q12089 YHL042WYHL042W 453 nt1.09□□□□□ -2.23
AEP3Q12089 YLR334CYLR334C 381 nt1.09□□□□□ -2.23
AEP3Q12089 LAA1YJL207C 6045 nt1.08□□□□□ -2.24
AEP3Q12089 YDR521WYDR521W 336 nt1.08□□□□□ -2.24
AEP3Q12089 RPL34BYIL052C 366 nt1.08□□□□□ -2.24
AEP3Q12089 YLL007CYLL007C 1998 nt1.08□□□□□ -2.24
AEP3Q12089 VAM6YDL077C 3150 nt1.07□□□□□ -2.24
AEP3Q12089 PTP2YOR208W 2253 nt1.07□□□□□ -2.24
AEP3Q12089 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.06□□□□□ -2.24
AEP3Q12089 WAR1YML076C 2835 nt1.06□□□□□ -2.24
AEP3Q12089 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.06□□□□□ -2.24
AEP3Q12089 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.06□□□□□ -2.24
AEP3Q12089 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.06□□□□□ -2.24
AEP3Q12089 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.06□□□□□ -2.24
AEP3Q12089 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.06□□□□□ -2.24
AEP3Q12089 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.06□□□□□ -2.24
AEP3Q12089 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.06□□□□□ -2.24
AEP3Q12089 ANS1YHR126C 480 nt1.06□□□□□ -2.24
AEP3Q12089 HTB2YBL002W 396 nt1.06□□□□□ -2.24
AEP3Q12089 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt1.05□□□□□ -2.24
AEP3Q12089 YOR029WYOR029W 336 nt1.05□□□□□ -2.24
AEP3Q12089 OST1YJL002C 1431 nt1.05□□□□□ -2.24
AEP3Q12089 YAR029WYAR029W 225 nt1.04□□□□□ -2.24
AEP3Q12089 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt1.04□□□□□ -2.24
AEP3Q12089 YBR206WYBR206W 324 nt1.04□□□□□ -2.24
AEP3Q12089 MSH3YCR092C 3057 nt1.02□□□□□ -2.25
AEP3Q12089 YCK3YER123W 1575 nt1.02□□□□□ -2.25
AEP3Q12089 EMT1tM(CAU)D 73 nt1.02□□□□□ -2.25
AEP3Q12089 EMT5tM(CAU)J1 73 nt1.02□□□□□ -2.25
AEP3Q12089 EMT3tM(CAU)J2 73 nt1.02□□□□□ -2.25
AEP3Q12089 EMT4tM(CAU)M 73 nt1.02□□□□□ -2.25
AEP3Q12089 EMT2tM(CAU)O2 73 nt1.02□□□□□ -2.25
AEP3Q12089 KAP120YPL125W 3099 nt1.02□□□□□ -2.25
AEP3Q12089 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt1.01□□□□□ -2.25
AEP3Q12089 TAR1YLR154W-C 375 nt1□□□□□ -2.25
AEP3Q12089 YBR064WYBR064W 429 nt1□□□□□ -2.25
AEP3Q12089 SCC2YDR180W 4482 nt1□□□□□ -2.25
AEP3Q12089 SPO75YLL005C 2607 nt0.99□□□□□ -2.25
AEP3Q12089 DOP1YDR141C 5097 nt0.99□□□□□ -2.25
AEP3Q12089 HMRA2YCR096C 360 nt0.98□□□□□ -2.25
AEP3Q12089 YDL196WYDL196W 330 nt0.98□□□□□ -2.25
AEP3Q12089 YPR197CYPR197C 564 nt0.98□□□□□ -2.25
AEP3Q12089 TTI1YKL033W 3117 nt0.98□□□□□ -2.25
AEP3Q12089 SPT7YBR081C 3999 nt0.97□□□□□ -2.25
AEP3Q12089 YJL120WYJL120W 324 nt0.97□□□□□ -2.25
AEP3Q12089 YAF9YNL107W 681 nt0.96□□□□□ -2.26
AEP3Q12089 BEM2YER155C 6504 nt0.96□□□□□ -2.26
AEP3Q12089 YDL073WYDL073W 2955 nt0.95□□□□□ -2.26
AEP3Q12089 HMRA1YCR097W 381 nt0.95□□□□□ -2.26
AEP3Q12089 YDR048CYDR048C 315 nt0.95□□□□□ -2.26
AEP3Q12089 YDR102CYDR102C 333 nt0.95□□□□□ -2.26
AEP3Q12089 ISD11YER048W-A 285 nt0.95□□□□□ -2.26
AEP3Q12089 RPS25BYLR333C 327 nt0.95□□□□□ -2.26
AEP3Q12089 BUD3YCL014W 4911 nt0.95□□□□□ -2.26
AEP3Q12089 YJR029WYJR029W 5268 nt0.95□□□□□ -2.26
AEP3Q12089 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt0.95□□□□□ -2.26
AEP3Q12089 GEA2YEL022W 4380 nt0.94□□□□□ -2.26
AEP3Q12089 OLI1Q0130 231 nt0.93□□□□□ -2.26
AEP3Q12089 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt0.92□□□□□ -2.26
AEP3Q12089 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt0.92□□□□□ -2.26
AEP3Q12089 SPO21YOL091W 1830 nt0.92□□□□□ -2.26
AEP3Q12089 PRP16YKR086W 3216 nt0.91□□□□□ -2.26
AEP3Q12089 SSS1YDR086C 243 nt0.91□□□□□ -2.26
AEP3Q12089 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt0.91□□□□□ -2.26
AEP3Q12089 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt0.91□□□□□ -2.26
AEP3Q12089 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt0.91□□□□□ -2.26
AEP3Q12089 MCM10YIL150C 1716 nt0.91□□□□□ -2.26
AEP3Q12089 GIM4YEL003W 336 nt0.9□□□□□ -2.27
AEP3Q12089 ALG13YGL047W 609 nt0.9□□□□□ -2.27
AEP3Q12089 YGR130CYGR130C 2451 nt0.9□□□□□ -2.27
AEP3Q12089 SIP4YJL089W 2490 nt0.9□□□□□ -2.27
AEP3Q12089 SMC1YFL008W 3678 nt0.89□□□□□ -2.27
AEP3Q12089 DBP6YNR038W 1890 nt0.89□□□□□ -2.27
AEP3Q12089 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt0.89□□□□□ -2.27
AEP3Q12089 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt0.89□□□□□ -2.27
AEP3Q12089 YPL225WYPL225W 441 nt0.89□□□□□ -2.27
AEP3Q12089 NOP9YJL010C 2001 nt0.88□□□□□ -2.27
AEP3Q12089 snR56snR56 88 nt0.88□□□□□ -2.27
AEP3Q12089 HTL1YCR020W-B 237 nt0.88□□□□□ -2.27
AEP3Q12089 PMP1YCR024C-A 123 nt0.88□□□□□ -2.27
AEP3Q12089 ECM12YHR021W-A 456 nt0.88□□□□□ -2.27
AEP3Q12089 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt0.88□□□□□ -2.27
AEP3Q12089 YMR321CYMR321C 318 nt0.88□□□□□ -2.27
AEP3Q12089 YOR282WYOR282W 321 nt0.88□□□□□ -2.27
AEP3Q12089 YPL044CYPL044C 549 nt0.88□□□□□ -2.27
AEP3Q12089 BFR2YDR299W 1605 nt0.87□□□□□ -2.27
AEP3Q12089 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt0.87□□□□□ -2.27
AEP3Q12089 CMC4YMR194C-B 222 nt0.87□□□□□ -2.27
AEP3Q12089 YDR344CYDR344C 444 nt0.86□□□□□ -2.27
AEP3Q12089 IML1YJR138W 4755 nt0.85□□□□□ -2.27
AEP3Q12089 YPR117WYPR117W 7470 nt0.85□□□□□ -2.27
AEP3Q12089 INA22YIR024C 651 nt0.85□□□□□ -2.27
AEP3Q12089 RKR1YMR247C 4689 nt0.85□□□□□ -2.27
AEP3Q12089 COG8YML071C 1824 nt0.85□□□□□ -2.27
AEP3Q12089 ASE1YOR058C 2658 nt0.84□□□□□ -2.27
AEP3Q12089 ATP6Q0085 780 nt0.84□□□□□ -2.27
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