Protein–RNA interactions for Protein: Q04398

SPG3, Stationary phase protein 3, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPG3Q04398 YPL261CYPL261C 309 nt0.58□□□□□ -2.32
SPG3Q04398 SWF1YDR126W 1011 nt0.57□□□□□ -2.32
SPG3Q04398 WIP1YDR374W-A 270 nt0.57□□□□□ -2.32
SPG3Q04398 YER006C-AYER006C-A 318 nt0.57□□□□□ -2.32
SPG3Q04398 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt0.57□□□□□ -2.32
SPG3Q04398 snR189snR189 189 nt0.57□□□□□ -2.32
SPG3Q04398 snR51snR51 107 nt0.57□□□□□ -2.32
SPG3Q04398 CUL3YGR003W 2235 nt0.56□□□□□ -2.32
SPG3Q04398 YGR042WYGR042W 816 nt0.56□□□□□ -2.32
SPG3Q04398 YIR044CYIR044C 186 nt0.55□□□□□ -2.32
SPG3Q04398 FYV7YLR068W 456 nt0.55□□□□□ -2.32
SPG3Q04398 YNL058CYNL058C 951 nt0.55□□□□□ -2.32
SPG3Q04398 YOR282WYOR282W 321 nt0.55□□□□□ -2.32
SPG3Q04398 LOA1YPR139C 903 nt0.55□□□□□ -2.32
SPG3Q04398 RAD34YDR314C 2079 nt0.55□□□□□ -2.32
SPG3Q04398 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.54□□□□□ -2.32
SPG3Q04398 GEA2YEL022W 4380 nt0.54□□□□□ -2.32
SPG3Q04398 snR72snR72 98 nt0.53□□□□□ -2.32
SPG3Q04398 SDH7YDR511W 402 nt0.53□□□□□ -2.32
SPG3Q04398 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt0.53□□□□□ -2.32
SPG3Q04398 INP2YMR163C 2118 nt0.53□□□□□ -2.32
SPG3Q04398 UTP10YJL109C 5310 nt0.52□□□□□ -2.33
SPG3Q04398 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt0.52□□□□□ -2.33
SPG3Q04398 YHL042WYHL042W 453 nt0.52□□□□□ -2.33
SPG3Q04398 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.52□□□□□ -2.33
SPG3Q04398 YKL083WYKL083W 615 nt0.52□□□□□ -2.33
SPG3Q04398 YLR101CYLR101C 396 nt0.52□□□□□ -2.33
SPG3Q04398 YAR047CYAR047C 321 nt0.52□□□□□ -2.33
SPG3Q04398 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.52□□□□□ -2.33
SPG3Q04398 YHL041WYHL041W 450 nt0.51□□□□□ -2.33
SPG3Q04398 snR41snR41 95 nt0.51□□□□□ -2.33
SPG3Q04398 PRP16YKR086W 3216 nt0.5□□□□□ -2.33
SPG3Q04398 CBS1YDL069C 690 nt0.5□□□□□ -2.33
SPG3Q04398 YNL303WYNL303W 348 nt0.5□□□□□ -2.33
SPG3Q04398 LTE1YAL024C 4308 nt0.49□□□□□ -2.33
SPG3Q04398 ECM12YHR021W-A 456 nt0.49□□□□□ -2.33
SPG3Q04398 TOM22YNL131W 459 nt0.49□□□□□ -2.33
SPG3Q04398 PTP2YOR208W 2253 nt0.49□□□□□ -2.33
SPG3Q04398 YLL007CYLL007C 1998 nt0.48□□□□□ -2.33
SPG3Q04398 PCF11YDR228C 1881 nt0.48□□□□□ -2.33
SPG3Q04398 ULP2YIL031W 3105 nt0.47□□□□□ -2.33
SPG3Q04398 TRS65YGR166W 1683 nt0.47□□□□□ -2.33
SPG3Q04398 YAP6YDR259C 1152 nt0.47□□□□□ -2.33
SPG3Q04398 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt0.47□□□□□ -2.33
SPG3Q04398 ISF1YMR081C 1017 nt0.47□□□□□ -2.33
SPG3Q04398 FMP27YLR454W 7887 nt0.47□□□□□ -2.33
SPG3Q04398 BFR2YDR299W 1605 nt0.46□□□□□ -2.34
SPG3Q04398 MAM33YIL070C 801 nt0.46□□□□□ -2.34
SPG3Q04398 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt0.46□□□□□ -2.34
SPG3Q04398 MRPL50YNR022C 420 nt0.46□□□□□ -2.34
SPG3Q04398 PMP1YCR024C-A 123 nt0.45□□□□□ -2.34
SPG3Q04398 ATG31YDR022C 591 nt0.45□□□□□ -2.34
SPG3Q04398 YDR344CYDR344C 444 nt0.45□□□□□ -2.34
SPG3Q04398 RPS20YHL015W 366 nt0.45□□□□□ -2.34
SPG3Q04398 RPL38YLR325C 237 nt0.45□□□□□ -2.34
SPG3Q04398 RPL26AYLR344W 384 nt0.45□□□□□ -2.34
SPG3Q04398 YPL044CYPL044C 549 nt0.45□□□□□ -2.34
SPG3Q04398 NPR2YEL062W 1848 nt0.45□□□□□ -2.34
SPG3Q04398 YML002WYML002W 2214 nt0.44□□□□□ -2.34
SPG3Q04398 NOP9YJL010C 2001 nt0.43□□□□□ -2.34
SPG3Q04398 YML007C-AYML007C-A 111 nt0.43□□□□□ -2.34
SPG3Q04398 UBC7YMR022W 498 nt0.43□□□□□ -2.34
SPG3Q04398 YPL185WYPL185W 396 nt0.43□□□□□ -2.34
SPG3Q04398 OLI1Q0130 231 nt0.42□□□□□ -2.34
SPG3Q04398 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt0.42□□□□□ -2.34
SPG3Q04398 RPS24BYIL069C 408 nt0.41□□□□□ -2.34
SPG3Q04398 YJR011CYJR011C 786 nt0.41□□□□□ -2.34
SPG3Q04398 YBR064WYBR064W 429 nt0.41□□□□□ -2.34
SPG3Q04398 NIP100YPL174C 2607 nt0.41□□□□□ -2.34
SPG3Q04398 CHS6YJL099W 2241 nt0.4□□□□□ -2.35
SPG3Q04398 PAA1YDR071C 576 nt0.4□□□□□ -2.35
SPG3Q04398 ATP19YOL077W-A 207 nt0.4□□□□□ -2.35
SPG3Q04398 SPO21YOL091W 1830 nt0.4□□□□□ -2.35
SPG3Q04398 AI1Q0050 2505 nt0.39□□□□□ -2.35
SPG3Q04398 YLR456WYLR456W 615 nt0.39□□□□□ -2.35
SPG3Q04398 YBR206WYBR206W 324 nt0.39□□□□□ -2.35
SPG3Q04398 YDR426CYDR426C 378 nt0.38□□□□□ -2.35
SPG3Q04398 BSC3YLR465C 309 nt0.38□□□□□ -2.35
SPG3Q04398 PCC1YKR095W-A 267 nt0.37□□□□□ -2.35
SPG3Q04398 MCM10YIL150C 1716 nt0.36□□□□□ -2.35
SPG3Q04398 HMRA2YCR096C 360 nt0.36□□□□□ -2.35
SPG3Q04398 RPL26BYGR034W 384 nt0.36□□□□□ -2.35
SPG3Q04398 YKL063CYKL063C 504 nt0.36□□□□□ -2.35
SPG3Q04398 YMR321CYMR321C 318 nt0.36□□□□□ -2.35
SPG3Q04398 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.35□□□□□ -2.35
SPG3Q04398 YJL007CYJL007C 315 nt0.34□□□□□ -2.36
SPG3Q04398 MLP1YKR095W 5628 nt0.33□□□□□ -2.36
SPG3Q04398 BIR1YJR089W 2865 nt0.33□□□□□ -2.36
SPG3Q04398 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.32□□□□□ -2.36
SPG3Q04398 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt0.32□□□□□ -2.36
SPG3Q04398 YOR053WYOR053W 342 nt0.32□□□□□ -2.36
SPG3Q04398 YSP1YHR155W 3687 nt0.32□□□□□ -2.36
SPG3Q04398 SEC8YPR055W 3198 nt0.31□□□□□ -2.36
SPG3Q04398 PET111YMR257C 2403 nt0.31□□□□□ -2.36
SPG3Q04398 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt0.31□□□□□ -2.36
SPG3Q04398 YPL068CYPL068C 882 nt0.31□□□□□ -2.36
SPG3Q04398 FYV10YIL097W 1551 nt0.31□□□□□ -2.36
SPG3Q04398 COX5BYIL111W 456 nt0.3□□□□□ -2.36
SPG3Q04398 ABF2YMR072W 552 nt0.3□□□□□ -2.36
SPG3Q04398 VPS20YMR077C 666 nt0.3□□□□□ -2.36
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 27.2 ms