Protein–RNA interactions for Protein: P53758

YNR077C, UPF0320 protein YNR077C, yeastyeast

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YNR077CP53758 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.44□□□□□ -2.34
YNR077CP53758 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.44□□□□□ -2.34
YNR077CP53758 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.44□□□□□ -2.34
YNR077CP53758 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.44□□□□□ -2.34
YNR077CP53758 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt0.44□□□□□ -2.34
YNR077CP53758 PCF11YDR228C 1881 nt0.44□□□□□ -2.34
YNR077CP53758 PMP1YCR024C-A 123 nt0.43□□□□□ -2.34
YNR077CP53758 YAP6YDR259C 1152 nt0.43□□□□□ -2.34
YNR077CP53758 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt0.43□□□□□ -2.34
YNR077CP53758 MAM33YIL070C 801 nt0.43□□□□□ -2.34
YNR077CP53758 RPL38YLR325C 237 nt0.43□□□□□ -2.34
YNR077CP53758 TOM22YNL131W 459 nt0.43□□□□□ -2.34
YNR077CP53758 NOP9YJL010C 2001 nt0.42□□□□□ -2.34
YNR077CP53758 YDR344CYDR344C 444 nt0.42□□□□□ -2.34
YNR077CP53758 RPS20YHL015W 366 nt0.42□□□□□ -2.34
YNR077CP53758 YHR052W-AYHR052W-A 195 nt0.42□□□□□ -2.34
YNR077CP53758 YHR054W-AYHR054W-A 195 nt0.42□□□□□ -2.34
YNR077CP53758 RPL26AYLR344W 384 nt0.42□□□□□ -2.34
YNR077CP53758 YNL303WYNL303W 348 nt0.42□□□□□ -2.34
YNR077CP53758 YML002WYML002W 2214 nt0.41□□□□□ -2.34
YNR077CP53758 NPR2YEL062W 1848 nt0.41□□□□□ -2.34
YNR077CP53758 ATG31YDR022C 591 nt0.41□□□□□ -2.34
YNR077CP53758 UBC7YMR022W 498 nt0.41□□□□□ -2.34
YNR077CP53758 MRPL50YNR022C 420 nt0.41□□□□□ -2.34
YNR077CP53758 YPL044CYPL044C 549 nt0.41□□□□□ -2.34
YNR077CP53758 YPL185WYPL185W 396 nt0.41□□□□□ -2.34
YNR077CP53758 LTE1YAL024C 4308 nt0.41□□□□□ -2.34
YNR077CP53758 UTP10YJL109C 5310 nt0.4□□□□□ -2.34
YNR077CP53758 UBP3YER151C 2739 nt0.4□□□□□ -2.35
YNR077CP53758 ISF1YMR081C 1017 nt0.4□□□□□ -2.35
YNR077CP53758 PRP16YKR086W 3216 nt0.39□□□□□ -2.35
YNR077CP53758 YJR011CYJR011C 786 nt0.39□□□□□ -2.35
YNR077CP53758 YML007C-AYML007C-A 111 nt0.39□□□□□ -2.35
YNR077CP53758 YBR064WYBR064W 429 nt0.39□□□□□ -2.35
YNR077CP53758 CHS6YJL099W 2241 nt0.39□□□□□ -2.35
YNR077CP53758 YCK3YER123W 1575 nt0.39□□□□□ -2.35
YNR077CP53758 OLI1Q0130 231 nt0.38□□□□□ -2.35
YNR077CP53758 YOR218CYOR218C 420 nt0.38□□□□□ -2.35
YNR077CP53758 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt0.38□□□□□ -2.35
YNR077CP53758 NIP100YPL174C 2607 nt0.38□□□□□ -2.35
YNR077CP53758 RPS24BYIL069C 408 nt0.37□□□□□ -2.35
YNR077CP53758 YBR206WYBR206W 324 nt0.37□□□□□ -2.35
YNR077CP53758 SPO21YOL091W 1830 nt0.36□□□□□ -2.35
YNR077CP53758 PAA1YDR071C 576 nt0.36□□□□□ -2.35
YNR077CP53758 BSC3YLR465C 309 nt0.36□□□□□ -2.35
YNR077CP53758 ATP19YOL077W-A 207 nt0.36□□□□□ -2.35
YNR077CP53758 MCM10YIL150C 1716 nt0.35□□□□□ -2.35
YNR077CP53758 YLR456WYLR456W 615 nt0.35□□□□□ -2.35
YNR077CP53758 YDR426CYDR426C 378 nt0.34□□□□□ -2.36
YNR077CP53758 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.33□□□□□ -2.36
YNR077CP53758 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.33□□□□□ -2.36
YNR077CP53758 PCC1YKR095W-A 267 nt0.33□□□□□ -2.36
YNR077CP53758 RPL26BYGR034W 384 nt0.32□□□□□ -2.36
YNR077CP53758 HMRA2YCR096C 360 nt0.31□□□□□ -2.36
YNR077CP53758 YDL032WYDL032W 312 nt0.3□□□□□ -2.36
YNR077CP53758 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.3□□□□□ -2.36
YNR077CP53758 FYV10YIL097W 1551 nt0.3□□□□□ -2.36
YNR077CP53758 YKL063CYKL063C 504 nt0.29□□□□□ -2.36
YNR077CP53758 YOR053WYOR053W 342 nt0.29□□□□□ -2.36
YNR077CP53758 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt0.29□□□□□ -2.36
YNR077CP53758 PET111YMR257C 2403 nt0.29□□□□□ -2.36
YNR077CP53758 MLP1YKR095W 5628 nt0.29□□□□□ -2.36
YNR077CP53758 SEC8YPR055W 3198 nt0.29□□□□□ -2.36
YNR077CP53758 COX5BYIL111W 456 nt0.28□□□□□ -2.36
YNR077CP53758 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt0.28□□□□□ -2.36
YNR077CP53758 YPL068CYPL068C 882 nt0.28□□□□□ -2.36
YNR077CP53758 BEM3YPL115C 3387 nt0.27□□□□□ -2.37
YNR077CP53758 YJL007CYJL007C 315 nt0.27□□□□□ -2.37
YNR077CP53758 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt0.27□□□□□ -2.37
YNR077CP53758 VPS20YMR077C 666 nt0.26□□□□□ -2.37
YNR077CP53758 YNL211CYNL211C 261 nt0.26□□□□□ -2.37
YNR077CP53758 VIK1YPL253C 1944 nt0.25□□□□□ -2.37
YNR077CP53758 SBH1YER087C-B 249 nt0.25□□□□□ -2.37
YNR077CP53758 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.25□□□□□ -2.37
YNR077CP53758 PAU12YGR294W 363 nt0.25□□□□□ -2.37
YNR077CP53758 YLR434CYLR434C 384 nt0.25□□□□□ -2.37
YNR077CP53758 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.25□□□□□ -2.37
YNR077CP53758 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt0.24□□□□□ -2.37
YNR077CP53758 YLR334CYLR334C 381 nt0.24□□□□□ -2.37
YNR077CP53758 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.24□□□□□ -2.37
YNR077CP53758 ASE1YOR058C 2658 nt0.24□□□□□ -2.37
YNR077CP53758 YSP1YHR155W 3687 nt0.23□□□□□ -2.37
YNR077CP53758 PAM16YJL104W 450 nt0.23□□□□□ -2.37
YNR077CP53758 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt0.23□□□□□ -2.37
YNR077CP53758 OST1YJL002C 1431 nt0.22□□□□□ -2.37
YNR077CP53758 YLR202CYLR202C 327 nt0.22□□□□□ -2.37
YNR077CP53758 RPS25BYLR333C 327 nt0.22□□□□□ -2.37
YNR077CP53758 ABF2YMR072W 552 nt0.22□□□□□ -2.37
YNR077CP53758 YPL205CYPL205C 345 nt0.22□□□□□ -2.37
YNR077CP53758 YPL225WYPL225W 441 nt0.22□□□□□ -2.37
YNR077CP53758 OST4YDL232W 111 nt0.21□□□□□ -2.38
YNR077CP53758 SGF11YPL047W 300 nt0.21□□□□□ -2.38
YNR077CP53758 FMP27YLR454W 7887 nt0.21□□□□□ -2.38
YNR077CP53758 PRP42YDR235W 1635 nt0.2□□□□□ -2.38
YNR077CP53758 HAL9YOL089C 3093 nt0.2□□□□□ -2.38
YNR077CP53758 PRP5YBR237W 2550 nt0.2□□□□□ -2.38
YNR077CP53758 MLP2YIL149C 5040 nt0.2□□□□□ -2.38
YNR077CP53758 YMR321CYMR321C 318 nt0.2□□□□□ -2.38
YNR077CP53758 UTP20YBL004W 7482 nt0.19□□□□□ -2.38
YNR077CP53758 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt0.19□□□□□ -2.38
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 29.5 ms