Protein–RNA interactions for Protein: P0C0W1

RPS22A, 40S ribosomal protein S22-A, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPS22AP0C0W1 TSC3YBR058C-A 243 nt0.05□□□□□ -2.4
RPS22AP0C0W1 YPL261CYPL261C 309 nt0.05□□□□□ -2.4
RPS22AP0C0W1 BIR1YJR089W 2865 nt0.05□□□□□ -2.4
RPS22AP0C0W1 VIK1YPL253C 1944 nt0.05□□□□□ -2.4
RPS22AP0C0W1 AI1Q0050 2505 nt0.04□□□□□ -2.4
RPS22AP0C0W1 YCR001WYCR001W 315 nt0.04□□□□□ -2.4
RPS22AP0C0W1 YKL202WYKL202W 582 nt0.04□□□□□ -2.4
RPS22AP0C0W1 snR51snR51 107 nt0.04□□□□□ -2.4
RPS22AP0C0W1 IQG1YPL242C 4488 nt0.04□□□□□ -2.4
RPS22AP0C0W1 HMLALPHA2YCL067C 633 nt0.03□□□□□ -2.4
RPS22AP0C0W1 MATALPHA2YCR039C 633 nt0.03□□□□□ -2.4
RPS22AP0C0W1 YJR011CYJR011C 786 nt0.03□□□□□ -2.4
RPS22AP0C0W1 PRP5YBR237W 2550 nt0.03□□□□□ -2.4
RPS22AP0C0W1 ORC3YLL004W 1851 nt0.03□□□□□ -2.41
RPS22AP0C0W1 Q0255Q0255 1419 nt0.03□□□□□ -2.41
RPS22AP0C0W1 YAP6YDR259C 1152 nt0.02□□□□□ -2.41
RPS22AP0C0W1 TIM13YGR181W 318 nt0.02□□□□□ -2.41
RPS22AP0C0W1 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.02□□□□□ -2.41
RPS22AP0C0W1 RPS27AYKL156W 249 nt0.02□□□□□ -2.41
RPS22AP0C0W1 RPS30BYOR182C 192 nt0.02□□□□□ -2.41
RPS22AP0C0W1 YPL182CYPL182C 384 nt0.02□□□□□ -2.41
RPS22AP0C0W1 OST4YDL232W 111 nt0.01□□□□□ -2.41
RPS22AP0C0W1 SDH7YDR511W 402 nt0.01□□□□□ -2.41
RPS22AP0C0W1 COX12YLR038C 252 nt0.01□□□□□ -2.41
RPS22AP0C0W1 YLR269CYLR269C 351 nt0.01□□□□□ -2.41
RPS22AP0C0W1 YML108WYML108W 318 nt0.01□□□□□ -2.41
RPS22AP0C0W1 RCO1YMR075W 2055 nt0.01□□□□□ -2.41
RPS22AP0C0W1 CUL3YGR003W 2235 nt0□□□□□ -2.41
RPS22AP0C0W1 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt0□□□□□ -2.41
RPS22AP0C0W1 LEE1YPL054W 906 nt0□□□□□ -2.41
RPS22AP0C0W1 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0□□□□□ -2.41
RPS22AP0C0W1 YHL041WYHL041W 450 nt-0.01□□□□□ -2.41
RPS22AP0C0W1 MAM33YIL070C 801 nt-0.01□□□□□ -2.41
RPS22AP0C0W1 COX5BYIL111W 456 nt-0.01□□□□□ -2.41
RPS22AP0C0W1 YMR321CYMR321C 318 nt-0.01□□□□□ -2.41
RPS22AP0C0W1 YPL185WYPL185W 396 nt-0.01□□□□□ -2.41
RPS22AP0C0W1 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt-0.02□□□□□ -2.41
RPS22AP0C0W1 RPF1YHR088W 888 nt-0.02□□□□□ -2.41
RPS22AP0C0W1 YIR044CYIR044C 186 nt-0.02□□□□□ -2.41
RPS22AP0C0W1 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt-0.02□□□□□ -2.41
RPS22AP0C0W1 PBI2YNL015W 228 nt-0.02□□□□□ -2.41
RPS22AP0C0W1 YNL211CYNL211C 261 nt-0.02□□□□□ -2.41
RPS22AP0C0W1 YOR053WYOR053W 342 nt-0.02□□□□□ -2.41
RPS22AP0C0W1 YOR345CYOR345C 351 nt-0.02□□□□□ -2.41
RPS22AP0C0W1 PRP42YDR235W 1635 nt-0.02□□□□□ -2.41
RPS22AP0C0W1 RPS20YHL015W 366 nt-0.03□□□□□ -2.41
RPS22AP0C0W1 NIP100YPL174C 2607 nt-0.03□□□□□ -2.41
RPS22AP0C0W1 YDL011CYDL011C 324 nt-0.04□□□□□ -2.42
RPS22AP0C0W1 YLR171WYLR171W 390 nt-0.04□□□□□ -2.42
RPS22AP0C0W1 GPI15YNL038W 690 nt-0.04□□□□□ -2.42
RPS22AP0C0W1 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt-0.04□□□□□ -2.42
RPS22AP0C0W1 STE5YDR103W 2754 nt-0.04□□□□□ -2.42
RPS22AP0C0W1 SEC8YPR055W 3198 nt-0.04□□□□□ -2.42
RPS22AP0C0W1 HAL9YOL089C 3093 nt-0.05□□□□□ -2.42
RPS22AP0C0W1 RPS26AYGL189C 360 nt-0.05□□□□□ -2.42
RPS22AP0C0W1 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt-0.05□□□□□ -2.42
RPS22AP0C0W1 YBL071CYBL071C 309 nt-0.05□□□□□ -2.42
RPS22AP0C0W1 snR190snR190 190 nt-0.05□□□□□ -2.42
RPS22AP0C0W1 PAA1YDR071C 576 nt-0.06□□□□□ -2.42
RPS22AP0C0W1 SPO21YOL091W 1830 nt-0.06□□□□□ -2.42
RPS22AP0C0W1 MLP1YKR095W 5628 nt-0.07□□□□□ -2.42
RPS22AP0C0W1 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt-0.07□□□□□ -2.42
RPS22AP0C0W1 YFL012WYFL012W 447 nt-0.07□□□□□ -2.42
RPS22AP0C0W1 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt-0.07□□□□□ -2.42
RPS22AP0C0W1 PTP2YOR208W 2253 nt-0.08□□□□□ -2.42
RPS22AP0C0W1 YER084W-AYER084W-A 513 nt-0.08□□□□□ -2.42
RPS22AP0C0W1 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt-0.08□□□□□ -2.42
RPS22AP0C0W1 YLR232WYLR232W 348 nt-0.08□□□□□ -2.42
RPS22AP0C0W1 YNL146WYNL146W 303 nt-0.08□□□□□ -2.42
RPS22AP0C0W1 COY1YKL179C 2040 nt-0.09□□□□□ -2.42
RPS22AP0C0W1 ATG31YDR022C 591 nt-0.09□□□□□ -2.42
RPS22AP0C0W1 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt-0.09□□□□□ -2.42
RPS22AP0C0W1 SSS1YDR086C 243 nt-0.1□□□□□ -2.43
RPS22AP0C0W1 ULI1YFR026C 510 nt-0.11□□□□□ -2.43
RPS22AP0C0W1 YNL058CYNL058C 951 nt-0.11□□□□□ -2.43
RPS22AP0C0W1 ZEO1YOL109W 342 nt-0.11□□□□□ -2.43
RPS22AP0C0W1 SGF11YPL047W 300 nt-0.11□□□□□ -2.43
RPS22AP0C0W1 YPL229WYPL229W 621 nt-0.11□□□□□ -2.43
RPS22AP0C0W1 NNF2YGR089W 2811 nt-0.11□□□□□ -2.43
RPS22AP0C0W1 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt-0.12□□□□□ -2.43
RPS22AP0C0W1 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt-0.12□□□□□ -2.43
RPS22AP0C0W1 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt-0.12□□□□□ -2.43
RPS22AP0C0W1 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt-0.12□□□□□ -2.43
RPS22AP0C0W1 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt-0.12□□□□□ -2.43
RPS22AP0C0W1 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt-0.12□□□□□ -2.43
RPS22AP0C0W1 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt-0.12□□□□□ -2.43
RPS22AP0C0W1 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt-0.12□□□□□ -2.43
RPS22AP0C0W1 TAR1YLR154W-C 375 nt-0.12□□□□□ -2.43
RPS22AP0C0W1 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt-0.12□□□□□ -2.43
RPS22AP0C0W1 SOV1YMR066W 2697 nt-0.12□□□□□ -2.43
RPS22AP0C0W1 COG8YML071C 1824 nt-0.13□□□□□ -2.43
RPS22AP0C0W1 YKL083WYKL083W 615 nt-0.13□□□□□ -2.43
RPS22AP0C0W1 AIM29YKR074W 468 nt-0.13□□□□□ -2.43
RPS22AP0C0W1 YLR287CYLR287C 1068 nt-0.13□□□□□ -2.43
RPS22AP0C0W1 NIP1YMR309C 2439 nt-0.14□□□□□ -2.43
RPS22AP0C0W1 MRPL50YNR022C 420 nt-0.14□□□□□ -2.43
RPS22AP0C0W1 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt-0.14□□□□□ -2.43
RPS22AP0C0W1 THO2YNL139C 4794 nt-0.14□□□□□ -2.43
RPS22AP0C0W1 RPL35AYDL191W 363 nt-0.15□□□□□ -2.43
RPS22AP0C0W1 STF2YGR008C 255 nt-0.15□□□□□ -2.43
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 575.7 ms