Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP8A1Q9Y2Q0 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP8A1Q9Y2Q0 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP8A1Q9Y2Q0 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP8A1Q9Y2Q0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP8A1Q9Y2Q0 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP8A1Q9Y2Q0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP8A1Q9Y2Q0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP8A1Q9Y2Q0 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP8A1Q9Y2Q0 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP8A1Q9Y2Q0 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP8A1Q9Y2Q0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP8A1Q9Y2Q0 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP8A1Q9Y2Q0 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP8A1Q9Y2Q0 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP8A1Q9Y2Q0 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP8A1Q9Y2Q0 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP8A1Q9Y2Q0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP8A1Q9Y2Q0 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP8A1Q9Y2Q0 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP8A1Q9Y2Q0 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP8A1Q9Y2Q0 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP8A1Q9Y2Q0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP8A1Q9Y2Q0 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP8A1Q9Y2Q0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP8A1Q9Y2Q0 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP8A1Q9Y2Q0 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP8A1Q9Y2Q0 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP8A1Q9Y2Q0 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP8A1Q9Y2Q0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP8A1Q9Y2Q0 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP8A1Q9Y2Q0 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP8A1Q9Y2Q0 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP8A1Q9Y2Q0 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP8A1Q9Y2Q0 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP8A1Q9Y2Q0 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP8A1Q9Y2Q0 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP8A1Q9Y2Q0 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP8A1Q9Y2Q0 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP8A1Q9Y2Q0 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP8A1Q9Y2Q0 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP8A1Q9Y2Q0 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP8A1Q9Y2Q0 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP8A1Q9Y2Q0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP8A1Q9Y2Q0 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP8A1Q9Y2Q0 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATP8A1Q9Y2Q0 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATP8A1Q9Y2Q0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATP8A1Q9Y2Q0 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATP8A1Q9Y2Q0 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP8A1Q9Y2Q0 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP8A1Q9Y2Q0 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP8A1Q9Y2Q0 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP8A1Q9Y2Q0 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP8A1Q9Y2Q0 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP8A1Q9Y2Q0 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP8A1Q9Y2Q0 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP8A1Q9Y2Q0 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP8A1Q9Y2Q0 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP8A1Q9Y2Q0 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP8A1Q9Y2Q0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP8A1Q9Y2Q0 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP8A1Q9Y2Q0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP8A1Q9Y2Q0 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP8A1Q9Y2Q0 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP8A1Q9Y2Q0 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP8A1Q9Y2Q0 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP8A1Q9Y2Q0 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP8A1Q9Y2Q0 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP8A1Q9Y2Q0 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP8A1Q9Y2Q0 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP8A1Q9Y2Q0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP8A1Q9Y2Q0 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP8A1Q9Y2Q0 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP8A1Q9Y2Q0 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP8A1Q9Y2Q0 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP8A1Q9Y2Q0 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP8A1Q9Y2Q0 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP8A1Q9Y2Q0 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP8A1Q9Y2Q0 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP8A1Q9Y2Q0 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP8A1Q9Y2Q0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP8A1Q9Y2Q0 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP8A1Q9Y2Q0 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP8A1Q9Y2Q0 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP8A1Q9Y2Q0 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP8A1Q9Y2Q0 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP8A1Q9Y2Q0 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP8A1Q9Y2Q0 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP8A1Q9Y2Q0 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP8A1Q9Y2Q0 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP8A1Q9Y2Q0 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms