Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYNE4Q8N205 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYNE4Q8N205 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYNE4Q8N205 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYNE4Q8N205 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYNE4Q8N205 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYNE4Q8N205 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYNE4Q8N205 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYNE4Q8N205 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYNE4Q8N205 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYNE4Q8N205 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYNE4Q8N205 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYNE4Q8N205 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYNE4Q8N205 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYNE4Q8N205 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYNE4Q8N205 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYNE4Q8N205 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYNE4Q8N205 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYNE4Q8N205 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SYNE4Q8N205 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYNE4Q8N205 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYNE4Q8N205 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYNE4Q8N205 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYNE4Q8N205 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNE4Q8N205 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNE4Q8N205 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNE4Q8N205 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNE4Q8N205 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNE4Q8N205 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNE4Q8N205 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNE4Q8N205 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNE4Q8N205 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNE4Q8N205 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNE4Q8N205 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNE4Q8N205 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNE4Q8N205 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNE4Q8N205 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNE4Q8N205 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNE4Q8N205 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNE4Q8N205 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNE4Q8N205 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNE4Q8N205 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNE4Q8N205 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNE4Q8N205 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNE4Q8N205 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNE4Q8N205 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNE4Q8N205 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNE4Q8N205 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNE4Q8N205 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNE4Q8N205 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNE4Q8N205 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNE4Q8N205 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNE4Q8N205 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNE4Q8N205 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNE4Q8N205 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNE4Q8N205 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNE4Q8N205 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNE4Q8N205 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNE4Q8N205 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNE4Q8N205 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNE4Q8N205 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNE4Q8N205 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNE4Q8N205 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNE4Q8N205 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNE4Q8N205 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNE4Q8N205 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNE4Q8N205 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNE4Q8N205 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNE4Q8N205 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNE4Q8N205 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNE4Q8N205 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNE4Q8N205 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNE4Q8N205 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYNE4Q8N205 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYNE4Q8N205 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYNE4Q8N205 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYNE4Q8N205 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYNE4Q8N205 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYNE4Q8N205 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYNE4Q8N205 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYNE4Q8N205 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYNE4Q8N205 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYNE4Q8N205 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYNE4Q8N205 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYNE4Q8N205 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYNE4Q8N205 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYNE4Q8N205 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYNE4Q8N205 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
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