Protein–RNA interactions for Protein: Q12378

RTR2, RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RTR2, yeastyeast

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTR2Q12378 IRC2YDR112W 309 nt-0.23□□□□□ -2.45
RTR2Q12378 RPC10YHR143W-A 213 nt-0.23□□□□□ -2.45
RTR2Q12378 YKL136WYKL136W 399 nt-0.23□□□□□ -2.45
RTR2Q12378 DAD1YDR016C 285 nt-0.24□□□□□ -2.45
RTR2Q12378 YDR210WYDR210W 228 nt-0.24□□□□□ -2.45
RTR2Q12378 QCR7YDR529C 384 nt-0.24□□□□□ -2.45
RTR2Q12378 YFR057WYFR057W 456 nt-0.24□□□□□ -2.45
RTR2Q12378 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt-0.24□□□□□ -2.45
RTR2Q12378 YPR099CYPR099C 357 nt-0.24□□□□□ -2.45
RTR2Q12378 NPC2YDL046W 522 nt-0.25□□□□□ -2.45
RTR2Q12378 ATG16YMR159C 453 nt-0.25□□□□□ -2.45
RTR2Q12378 YLL032CYLL032C 2478 nt-0.25□□□□□ -2.45
RTR2Q12378 YJL113WYJL113W 4647 nt-0.27□□□□□ -2.45
RTR2Q12378 YGR164WYGR164W 336 nt-0.27□□□□□ -2.45
RTR2Q12378 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt-0.27□□□□□ -2.45
RTR2Q12378 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt-0.27□□□□□ -2.45
RTR2Q12378 RPS27AYKL156W 249 nt-0.27□□□□□ -2.45
RTR2Q12378 RPS30AYLR287C-A 192 nt-0.27□□□□□ -2.45
RTR2Q12378 CDC33YOL139C 642 nt-0.27□□□□□ -2.45
RTR2Q12378 RCO1YMR075W 2055 nt-0.28□□□□□ -2.45
RTR2Q12378 YER158W-AYER158W-A 216 nt-0.28□□□□□ -2.45
RTR2Q12378 GPG1YGL121C 381 nt-0.28□□□□□ -2.45
RTR2Q12378 CSM4YPL200W 471 nt-0.28□□□□□ -2.45
RTR2Q12378 YBR071WYBR071W 636 nt-0.28□□□□□ -2.45
RTR2Q12378 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt-0.29□□□□□ -2.46
RTR2Q12378 MRPL31YKL138C 396 nt-0.29□□□□□ -2.46
RTR2Q12378 YNL050CYNL050C 813 nt-0.3□□□□□ -2.46
RTR2Q12378 RPB10YOR210W 213 nt-0.3□□□□□ -2.46
RTR2Q12378 YPL119C-AYPL119C-A 264 nt-0.3□□□□□ -2.46
RTR2Q12378 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt-0.3□□□□□ -2.46
RTR2Q12378 YHR054CYHR054C 1065 nt-0.31□□□□□ -2.46
RTR2Q12378 COX3Q0275 810 nt-0.31□□□□□ -2.46
RTR2Q12378 TIM10YHR005C-A 282 nt-0.32□□□□□ -2.46
RTR2Q12378 YOL106WYOL106W 354 nt-0.32□□□□□ -2.46
RTR2Q12378 TFB6YOR352W 1032 nt-0.32□□□□□ -2.46
RTR2Q12378 YOR364WYOR364W 369 nt-0.32□□□□□ -2.46
RTR2Q12378 ORC3YLL004W 1851 nt-0.33□□□□□ -2.46
RTR2Q12378 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt-0.33□□□□□ -2.46
RTR2Q12378 YPL044CYPL044C 549 nt-0.33□□□□□ -2.46
RTR2Q12378 YCL002CYCL002C 792 nt-0.33□□□□□ -2.46
RTR2Q12378 INP2YMR163C 2118 nt-0.34□□□□□ -2.46
RTR2Q12378 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt-0.34□□□□□ -2.46
RTR2Q12378 CUL3YGR003W 2235 nt-0.35□□□□□ -2.47
RTR2Q12378 YER076W-AYER076W-A 348 nt-0.35□□□□□ -2.47
RTR2Q12378 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt-0.35□□□□□ -2.47
RTR2Q12378 URB1YKL014C 5295 nt-0.35□□□□□ -2.47
RTR2Q12378 RAD34YDR314C 2079 nt-0.36□□□□□ -2.47
RTR2Q12378 YDL187CYDL187C 330 nt-0.36□□□□□ -2.47
RTR2Q12378 ACF4YJR083C 930 nt-0.36□□□□□ -2.47
RTR2Q12378 snR34snR34 203 nt-0.36□□□□□ -2.47
RTR2Q12378 RFX1YLR176C 2436 nt-0.36□□□□□ -2.47
RTR2Q12378 BI4Q0120 1917 nt-0.36□□□□□ -2.47
RTR2Q12378 GLG1YKR058W 1851 nt-0.37□□□□□ -2.47
RTR2Q12378 YHR050W-AYHR050W-A 171 nt-0.37□□□□□ -2.47
RTR2Q12378 YJR079WYJR079W 330 nt-0.37□□□□□ -2.47
RTR2Q12378 snR46snR46 197 nt-0.37□□□□□ -2.47
RTR2Q12378 TDA2YER071C 381 nt-0.38□□□□□ -2.47
RTR2Q12378 YER138W-AYER138W-A 105 nt-0.38□□□□□ -2.47
RTR2Q12378 YKL111CYKL111C 336 nt-0.38□□□□□ -2.47
RTR2Q12378 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt-0.39□□□□□ -2.47
RTR2Q12378 LRP1YHR081W 555 nt-0.39□□□□□ -2.47
RTR2Q12378 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt-0.39□□□□□ -2.47
RTR2Q12378 YPL197CYPL197C 414 nt-0.39□□□□□ -2.47
RTR2Q12378 YDR029WYDR029W 315 nt-0.4□□□□□ -2.47
RTR2Q12378 RPL22BYFL034C-A 369 nt-0.4□□□□□ -2.47
RTR2Q12378 YNL150WYNL150W 408 nt-0.4□□□□□ -2.47
RTR2Q12378 ZIP2YGL249W 2115 nt-0.4□□□□□ -2.47
RTR2Q12378 OST4YDL232W 111 nt-0.41□□□□□ -2.48
RTR2Q12378 LEE1YPL054W 906 nt-0.41□□□□□ -2.48
RTR2Q12378 RRI2YOL117W 1938 nt-0.42□□□□□ -2.48
RTR2Q12378 LIN1YHR156C 1023 nt-0.42□□□□□ -2.48
RTR2Q12378 SDS22YKL193C 1017 nt-0.42□□□□□ -2.48
RTR2Q12378 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt-0.42□□□□□ -2.48
RTR2Q12378 MCM10YIL150C 1716 nt-0.42□□□□□ -2.48
RTR2Q12378 EFR3YMR212C 2349 nt-0.42□□□□□ -2.48
RTR2Q12378 SEC10YLR166C 2616 nt-0.42□□□□□ -2.48
RTR2Q12378 RAD61YDR014W 1944 nt-0.42□□□□□ -2.48
RTR2Q12378 LOC1YFR001W 615 nt-0.43□□□□□ -2.48
RTR2Q12378 COX5BYIL111W 456 nt-0.43□□□□□ -2.48
RTR2Q12378 RPS26AYGL189C 360 nt-0.44□□□□□ -2.48
RTR2Q12378 PRP21YJL203W 843 nt-0.44□□□□□ -2.48
RTR2Q12378 snR8snR8 190 nt-0.45□□□□□ -2.48
RTR2Q12378 SRB7YDR308C 423 nt-0.45□□□□□ -2.48
RTR2Q12378 SBH2YER019C-A 267 nt-0.45□□□□□ -2.48
RTR2Q12378 YLR101CYLR101C 396 nt-0.45□□□□□ -2.48
RTR2Q12378 ASE1YOR058C 2658 nt-0.45□□□□□ -2.48
RTR2Q12378 YLR271WYLR271W 825 nt-0.46□□□□□ -2.48
RTR2Q12378 YBR064WYBR064W 429 nt-0.46□□□□□ -2.48
RTR2Q12378 SOV1YMR066W 2697 nt-0.47□□□□□ -2.48
RTR2Q12378 YJL135WYJL135W 318 nt-0.47□□□□□ -2.48
RTR2Q12378 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt-0.47□□□□□ -2.48
RTR2Q12378 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt-0.47□□□□□ -2.48
RTR2Q12378 POL32YJR043C 1053 nt-0.48□□□□□ -2.49
RTR2Q12378 YLR198CYLR198C 360 nt-0.48□□□□□ -2.49
RTR2Q12378 YPL185WYPL185W 396 nt-0.48□□□□□ -2.49
RTR2Q12378 OLI1Q0130 231 nt-0.49□□□□□ -2.49
RTR2Q12378 NFU1YKL040C 771 nt-0.49□□□□□ -2.49
RTR2Q12378 AFB1YLR040C 675 nt-0.49□□□□□ -2.49
RTR2Q12378 YMR075C-AYMR075C-A 366 nt-0.49□□□□□ -2.49
RTR2Q12378 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt-0.49□□□□□ -2.49
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