Protein–RNA interactions for Protein: Q08920

CBC2, Nuclear cap-binding protein subunit 2, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CBC2Q08920 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt2.9□□□□□ -1.95
CBC2Q08920 YLR282CYLR282C 342 nt2.9□□□□□ -1.95
CBC2Q08920 APL2YKL135C 2181 nt2.9□□□□□ -1.95
CBC2Q08920 PAA1YDR071C 576 nt2.89□□□□□ -1.95
CBC2Q08920 YBR206WYBR206W 324 nt2.89□□□□□ -1.95
CBC2Q08920 SMC6YLR383W 3345 nt2.88□□□□□ -1.95
CBC2Q08920 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt2.87□□□□□ -1.95
CBC2Q08920 YNL211CYNL211C 261 nt2.87□□□□□ -1.95
CBC2Q08920 RPL33AYPL143W 324 nt2.87□□□□□ -1.95
CBC2Q08920 DGR2YKL121W 2559 nt2.87□□□□□ -1.95
CBC2Q08920 MRD1YPR112C 2664 nt2.86□□□□□ -1.95
CBC2Q08920 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt2.86□□□□□ -1.95
CBC2Q08920 MAK10YEL053C 2202 nt2.86□□□□□ -1.95
CBC2Q08920 OST4YDL232W 111 nt2.85□□□□□ -1.95
CBC2Q08920 IFH1YLR223C 3258 nt2.85□□□□□ -1.95
CBC2Q08920 YNL018CYNL018C 1839 nt2.84□□□□□ -1.95
CBC2Q08920 PHO91YNR013C 2685 nt2.84□□□□□ -1.95
CBC2Q08920 MET18YIL128W 3099 nt2.84□□□□□ -1.95
CBC2Q08920 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt2.84□□□□□ -1.95
CBC2Q08920 RSE1YML049C 4086 nt2.83□□□□□ -1.96
CBC2Q08920 TRS130YMR218C 3309 nt2.83□□□□□ -1.96
CBC2Q08920 YIL082W-AYIL082W-A 4497 nt2.82□□□□□ -1.96
CBC2Q08920 RPS30BYOR182C 192 nt2.82□□□□□ -1.96
CBC2Q08920 DBP10YDL031W 2988 nt2.82□□□□□ -1.96
CBC2Q08920 RPN1YHR027C 2982 nt2.82□□□□□ -1.96
CBC2Q08920 RAX2YLR084C 3663 nt2.81□□□□□ -1.96
CBC2Q08920 CMC4YMR194C-B 222 nt2.81□□□□□ -1.96 RIP-Chip
CBC2Q08920 CDC31YOR257W 486 nt2.81□□□□□ -1.96
CBC2Q08920 MLH3YPL164C 2148 nt2.8□□□□□ -1.96
CBC2Q08920 YDR521WYDR521W 336 nt2.8□□□□□ -1.96
CBC2Q08920 COX12YLR038C 252 nt2.8□□□□□ -1.96
CBC2Q08920 KAP104YBR017C 2757 nt2.8□□□□□ -1.96
CBC2Q08920 YPR203WYPR203W 309 nt2.79□□□□□ -1.96 RIP-Chip
CBC2Q08920 SAP190YKR028W 3102 nt2.78□□□□□ -1.96
CBC2Q08920 YPP1YGR198W 2454 nt2.78□□□□□ -1.96
CBC2Q08920 YPL216WYPL216W 3309 nt2.78□□□□□ -1.97
CBC2Q08920 ALK1YGL021W 2283 nt2.77□□□□□ -1.97
CBC2Q08920 BPT1YLL015W 4680 nt2.77□□□□□ -1.97
CBC2Q08920 DYN1YKR054C 12279 nt2.77□□□□□ -1.97
CBC2Q08920 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt2.77□□□□□ -1.97
CBC2Q08920 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt2.77□□□□□ -1.97
CBC2Q08920 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt2.77□□□□□ -1.97
CBC2Q08920 PRP5YBR237W 2550 nt2.77□□□□□ -1.97
CBC2Q08920 YOR019WYOR019W 2193 nt2.77□□□□□ -1.97
CBC2Q08920 SEC7YDR170C 6030 nt2.77□□□□□ -1.97
CBC2Q08920 ISW1YBR245C 3390 nt2.77□□□□□ -1.97
CBC2Q08920 NUP100YKL068W 2880 nt2.76□□□□□ -1.97
CBC2Q08920 BUD2YKL092C 3315 nt2.76□□□□□ -1.97
CBC2Q08920 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt2.76□□□□□ -1.97
CBC2Q08920 YDR239CYDR239C 2364 nt2.76□□□□□ -1.97
CBC2Q08920 SRO77YBL106C 3033 nt2.76□□□□□ -1.97
CBC2Q08920 MSH5YDL154W 2706 nt2.75□□□□□ -1.97
CBC2Q08920 ESL1YIL151C 3357 nt2.75□□□□□ -1.97
CBC2Q08920 NAB6YML117W 3405 nt2.75□□□□□ -1.97
CBC2Q08920 AXL1YPR122W 3627 nt2.74□□□□□ -1.97
CBC2Q08920 YPL150WYPL150W 2706 nt2.74□□□□□ -1.97
CBC2Q08920 JSN1YJR091C 3276 nt2.74□□□□□ -1.97
CBC2Q08920 TTI1YKL033W 3117 nt2.74□□□□□ -1.97
CBC2Q08920 ECM29YHL030W 5607 nt2.73□□□□□ -1.97
CBC2Q08920 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.73□□□□□ -1.97
CBC2Q08920 SOM1YEL059C-A 225 nt2.73□□□□□ -1.97
CBC2Q08920 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt2.73□□□□□ -1.97
CBC2Q08920 SCP160YJL080C 3669 nt2.73□□□□□ -1.97
CBC2Q08920 GEA1YJR031C 4227 nt2.73□□□□□ -1.97
CBC2Q08920 STF2YGR008C 255 nt2.72□□□□□ -1.97
CBC2Q08920 YIL174WYIL174W 228 nt2.72□□□□□ -1.97
CBC2Q08920 YJL222W-AYJL222W-A 228 nt2.72□□□□□ -1.97
CBC2Q08920 CHS6YJL099W 2241 nt2.72□□□□□ -1.97
CBC2Q08920 HMI1YOL095C 2121 nt2.71□□□□□ -1.98
CBC2Q08920 MOT1YPL082C 5604 nt2.71□□□□□ -1.98
CBC2Q08920 SAP185YJL098W 3177 nt2.7□□□□□ -1.98
CBC2Q08920 YDL118WYDL118W 381 nt2.7□□□□□ -1.98
CBC2Q08920 APL1YJR005W 2103 nt2.7□□□□□ -1.98
CBC2Q08920 RPS29AYLR388W 171 nt2.7□□□□□ -1.98 RIP-Chip
CBC2Q08920 SNQ2YDR011W 4506 nt2.7□□□□□ -1.98
CBC2Q08920 YLR278CYLR278C 4026 nt2.7□□□□□ -1.98
CBC2Q08920 PNC1YGL037C 651 nt2.69□□□□□ -1.98
CBC2Q08920 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.69□□□□□ -1.98
CBC2Q08920 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.69□□□□□ -1.98
CBC2Q08920 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.69□□□□□ -1.98
CBC2Q08920 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.69□□□□□ -1.98
CBC2Q08920 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.69□□□□□ -1.98
CBC2Q08920 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.69□□□□□ -1.98
CBC2Q08920 PKH2YOL100W 3246 nt2.69□□□□□ -1.98
CBC2Q08920 AGC1YPR021C 2709 nt2.68□□□□□ -1.98
CBC2Q08920 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt2.68□□□□□ -1.98
CBC2Q08920 NEW1YPL226W 3591 nt2.67□□□□□ -1.98
CBC2Q08920 SSD1YDR293C 3753 nt2.67□□□□□ -1.98
CBC2Q08920 FAR11YNL127W 2862 nt2.67□□□□□ -1.98
CBC2Q08920 CTR9YOL145C 3234 nt2.67□□□□□ -1.98
CBC2Q08920 snR70snR70 164 nt2.66□□□□□ -1.98
CBC2Q08920 SLI15YBR156C 2097 nt2.65□□□□□ -1.99
CBC2Q08920 TRL1YJL087C 2484 nt2.65□□□□□ -1.99
CBC2Q08920 TCB2YNL087W 3537 nt2.65□□□□□ -1.99
CBC2Q08920 DYN2YDR424C 279 nt2.64□□□□□ -1.99 RIP-Chip
CBC2Q08920 COG4YPR105C 2586 nt2.63□□□□□ -1.99
CBC2Q08920 CDC60YPL160W 3273 nt2.63□□□□□ -1.99
CBC2Q08920 BCK1YJL095W 4437 nt2.63□□□□□ -1.99
CBC2Q08920 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt2.63□□□□□ -1.99
CBC2Q08920 UBP15YMR304W 3693 nt2.63□□□□□ -1.99
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