Protein–RNA interactions for Protein: P23506

Pcmt1, Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcmt1P23506 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcmt1P23506 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcmt1P23506 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcmt1P23506 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcmt1P23506 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcmt1P23506 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcmt1P23506 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcmt1P23506 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcmt1P23506 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcmt1P23506 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcmt1P23506 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcmt1P23506 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcmt1P23506 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcmt1P23506 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcmt1P23506 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcmt1P23506 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcmt1P23506 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcmt1P23506 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcmt1P23506 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcmt1P23506 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcmt1P23506 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcmt1P23506 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcmt1P23506 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcmt1P23506 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcmt1P23506 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcmt1P23506 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcmt1P23506 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcmt1P23506 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcmt1P23506 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcmt1P23506 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcmt1P23506 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcmt1P23506 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcmt1P23506 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcmt1P23506 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcmt1P23506 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcmt1P23506 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcmt1P23506 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcmt1P23506 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcmt1P23506 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcmt1P23506 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcmt1P23506 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcmt1P23506 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcmt1P23506 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcmt1P23506 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcmt1P23506 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcmt1P23506 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcmt1P23506 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcmt1P23506 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcmt1P23506 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcmt1P23506 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcmt1P23506 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcmt1P23506 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcmt1P23506 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcmt1P23506 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcmt1P23506 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcmt1P23506 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcmt1P23506 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcmt1P23506 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcmt1P23506 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcmt1P23506 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcmt1P23506 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcmt1P23506 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcmt1P23506 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcmt1P23506 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcmt1P23506 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcmt1P23506 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcmt1P23506 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcmt1P23506 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcmt1P23506 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcmt1P23506 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcmt1P23506 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcmt1P23506 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcmt1P23506 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcmt1P23506 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcmt1P23506 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcmt1P23506 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcmt1P23506 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcmt1P23506 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcmt1P23506 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcmt1P23506 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcmt1P23506 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcmt1P23506 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcmt1P23506 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcmt1P23506 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcmt1P23506 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcmt1P23506 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcmt1P23506 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcmt1P23506 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcmt1P23506 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcmt1P23506 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcmt1P23506 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcmt1P23506 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcmt1P23506 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcmt1P23506 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcmt1P23506 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcmt1P23506 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcmt1P23506 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcmt1P23506 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcmt1P23506 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcmt1P23506 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms