Protein–RNA interactions for Protein: P23506

Pcmt1, Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcmt1P23506 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
Pcmt1P23506 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Pcmt1P23506 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Pcmt1P23506 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Pcmt1P23506 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Pcmt1P23506 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Pcmt1P23506 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Pcmt1P23506 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Pcmt1P23506 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Pcmt1P23506 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Pcmt1P23506 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Pcmt1P23506 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pcmt1P23506 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Pcmt1P23506 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pcmt1P23506 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pcmt1P23506 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pcmt1P23506 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Pcmt1P23506 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Pcmt1P23506 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Pcmt1P23506 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Pcmt1P23506 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pcmt1P23506 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Pcmt1P23506 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pcmt1P23506 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pcmt1P23506 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pcmt1P23506 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Pcmt1P23506 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pcmt1P23506 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pcmt1P23506 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pcmt1P23506 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pcmt1P23506 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Pcmt1P23506 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Pcmt1P23506 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pcmt1P23506 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pcmt1P23506 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Pcmt1P23506 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Pcmt1P23506 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pcmt1P23506 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pcmt1P23506 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pcmt1P23506 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Pcmt1P23506 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pcmt1P23506 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pcmt1P23506 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pcmt1P23506 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pcmt1P23506 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pcmt1P23506 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pcmt1P23506 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pcmt1P23506 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pcmt1P23506 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pcmt1P23506 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pcmt1P23506 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pcmt1P23506 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pcmt1P23506 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pcmt1P23506 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pcmt1P23506 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pcmt1P23506 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pcmt1P23506 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pcmt1P23506 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
Pcmt1P23506 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pcmt1P23506 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pcmt1P23506 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pcmt1P23506 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Pcmt1P23506 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pcmt1P23506 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pcmt1P23506 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pcmt1P23506 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pcmt1P23506 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Pcmt1P23506 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pcmt1P23506 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pcmt1P23506 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pcmt1P23506 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pcmt1P23506 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pcmt1P23506 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pcmt1P23506 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pcmt1P23506 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pcmt1P23506 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pcmt1P23506 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pcmt1P23506 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pcmt1P23506 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pcmt1P23506 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pcmt1P23506 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pcmt1P23506 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pcmt1P23506 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pcmt1P23506 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pcmt1P23506 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pcmt1P23506 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pcmt1P23506 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pcmt1P23506 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Pcmt1P23506 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Pcmt1P23506 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pcmt1P23506 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pcmt1P23506 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pcmt1P23506 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pcmt1P23506 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pcmt1P23506 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pcmt1P23506 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pcmt1P23506 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pcmt1P23506 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Pcmt1P23506 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Pcmt1P23506 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms