Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TAF1CQ15572 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAF1CQ15572 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAF1CQ15572 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAF1CQ15572 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAF1CQ15572 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAF1CQ15572 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAF1CQ15572 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAF1CQ15572 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAF1CQ15572 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAF1CQ15572 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAF1CQ15572 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAF1CQ15572 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAF1CQ15572 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAF1CQ15572 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAF1CQ15572 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAF1CQ15572 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAF1CQ15572 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TAF1CQ15572 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAF1CQ15572 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAF1CQ15572 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAF1CQ15572 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAF1CQ15572 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAF1CQ15572 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAF1CQ15572 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAF1CQ15572 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAF1CQ15572 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAF1CQ15572 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAF1CQ15572 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAF1CQ15572 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAF1CQ15572 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAF1CQ15572 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAF1CQ15572 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAF1CQ15572 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAF1CQ15572 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAF1CQ15572 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF1CQ15572 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF1CQ15572 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF1CQ15572 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF1CQ15572 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF1CQ15572 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF1CQ15572 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF1CQ15572 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF1CQ15572 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF1CQ15572 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF1CQ15572 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF1CQ15572 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF1CQ15572 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF1CQ15572 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF1CQ15572 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF1CQ15572 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF1CQ15572 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF1CQ15572 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF1CQ15572 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF1CQ15572 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TAF1CQ15572 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TAF1CQ15572 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TAF1CQ15572 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TAF1CQ15572 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TAF1CQ15572 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TAF1CQ15572 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TAF1CQ15572 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TAF1CQ15572 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TAF1CQ15572 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TAF1CQ15572 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TAF1CQ15572 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TAF1CQ15572 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TAF1CQ15572 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TAF1CQ15572 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TAF1CQ15572 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TAF1CQ15572 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TAF1CQ15572 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TAF1CQ15572 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TAF1CQ15572 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TAF1CQ15572 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TAF1CQ15572 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAF1CQ15572 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAF1CQ15572 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAF1CQ15572 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAF1CQ15572 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAF1CQ15572 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TAF1CQ15572 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAF1CQ15572 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAF1CQ15572 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TAF1CQ15572 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
TAF1CQ15572 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TAF1CQ15572 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TAF1CQ15572 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TAF1CQ15572 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
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