Protein–RNA interactions for Protein: Q08235

BRX1, Ribosome biogenesis protein BRX1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BRX1Q08235 PDE2YOR360C 1581 nt0.6□□□□□ -2.31
BRX1Q08235 MKT1YNL085W 2493 nt0.6□□□□□ -2.31
BRX1Q08235 RKR1YMR247C 4689 nt0.59□□□□□ -2.31
BRX1Q08235 MRPL32YCR003W 552 nt0.59□□□□□ -2.31
BRX1Q08235 QCR7YDR529C 384 nt0.59□□□□□ -2.31
BRX1Q08235 MXR1YER042W 555 nt0.59□□□□□ -2.31
BRX1Q08235 YGR228WYGR228W 345 nt0.59□□□□□ -2.31
BRX1Q08235 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt0.59□□□□□ -2.31
BRX1Q08235 YPR096CYPR096C 303 nt0.59□□□□□ -2.31
BRX1Q08235 SLM6YBR266C 453 nt0.59□□□□□ -2.31
BRX1Q08235 MMS4YBR098W 2076 nt0.58□□□□□ -2.32
BRX1Q08235 SCW11YGL028C 1629 nt0.58□□□□□ -2.32
BRX1Q08235 HNT1YDL125C 477 nt0.58□□□□□ -2.32
BRX1Q08235 YDL196WYDL196W 330 nt0.58□□□□□ -2.32
BRX1Q08235 YDR509WYDR509W 348 nt0.58□□□□□ -2.32
BRX1Q08235 YER023C-AYER023C-A 213 nt0.58□□□□□ -2.32
BRX1Q08235 MPC1YGL080W 393 nt0.58□□□□□ -2.32
BRX1Q08235 HIT1YJR055W 495 nt0.58□□□□□ -2.32
BRX1Q08235 YBR032WYBR032W 303 nt0.58□□□□□ -2.32
BRX1Q08235 PAN3YKL025C 2040 nt0.58□□□□□ -2.32
BRX1Q08235 SPO23YBR250W 1572 nt0.57□□□□□ -2.32
BRX1Q08235 YML002WYML002W 2214 nt0.57□□□□□ -2.32
BRX1Q08235 RPC10YHR143W-A 213 nt0.57□□□□□ -2.32
BRX1Q08235 MYO1YHR023W 5787 nt0.57□□□□□ -2.32
BRX1Q08235 STO1YMR125W 2586 nt0.56□□□□□ -2.32
BRX1Q08235 LTE1YAL024C 4308 nt0.56□□□□□ -2.32
BRX1Q08235 YDR008CYDR008C 351 nt0.56□□□□□ -2.32
BRX1Q08235 SWF1YDR126W 1011 nt0.56□□□□□ -2.32
BRX1Q08235 YOR248WYOR248W 303 nt0.56□□□□□ -2.32
BRX1Q08235 YCL002CYCL002C 792 nt0.56□□□□□ -2.32
BRX1Q08235 YJR003CYJR003C 1560 nt0.56□□□□□ -2.32
BRX1Q08235 YMR160WYMR160W 2451 nt0.56□□□□□ -2.32
BRX1Q08235 snR5snR5 204 nt0.55□□□□□ -2.32
BRX1Q08235 YDR220CYDR220C 294 nt0.55□□□□□ -2.32
BRX1Q08235 BMT5YIL096C 1011 nt0.55□□□□□ -2.32
BRX1Q08235 SDH2YLL041C 801 nt0.55□□□□□ -2.32
BRX1Q08235 YLR271WYLR271W 825 nt0.55□□□□□ -2.32
BRX1Q08235 VAM3YOR106W 852 nt0.55□□□□□ -2.32
BRX1Q08235 PXA2YKL188C 2562 nt0.55□□□□□ -2.32
BRX1Q08235 FIG4YNL325C 2640 nt0.55□□□□□ -2.32
BRX1Q08235 SLD3YGL113W 2007 nt0.55□□□□□ -2.32
BRX1Q08235 LYS14YDR034C 2373 nt0.55□□□□□ -2.32
BRX1Q08235 SLY1YDR189W 2001 nt0.54□□□□□ -2.32
BRX1Q08235 YER188C-AYER188C-A 300 nt0.54□□□□□ -2.32
BRX1Q08235 RPL38YLR325C 237 nt0.54□□□□□ -2.32
BRX1Q08235 ENV11YGR071C 2583 nt0.54□□□□□ -2.32
BRX1Q08235 SWI6YLR182W 2412 nt0.53□□□□□ -2.32
BRX1Q08235 YIL059CYIL059C 366 nt0.53□□□□□ -2.32
BRX1Q08235 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt0.53□□□□□ -2.32
BRX1Q08235 UTP20YBL004W 7482 nt0.53□□□□□ -2.33
BRX1Q08235 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt0.52□□□□□ -2.33
BRX1Q08235 OCA6YDR067C 675 nt0.52□□□□□ -2.33
BRX1Q08235 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.52□□□□□ -2.33
BRX1Q08235 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.52□□□□□ -2.33
BRX1Q08235 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.52□□□□□ -2.33
BRX1Q08235 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.52□□□□□ -2.33
BRX1Q08235 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.52□□□□□ -2.33
BRX1Q08235 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.52□□□□□ -2.33
BRX1Q08235 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.52□□□□□ -2.33
BRX1Q08235 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.52□□□□□ -2.33
BRX1Q08235 YER087C-AYER087C-A 552 nt0.52□□□□□ -2.33
BRX1Q08235 ALG13YGL047W 609 nt0.52□□□□□ -2.33
BRX1Q08235 URM1YIL008W 300 nt0.52□□□□□ -2.33
BRX1Q08235 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt0.52□□□□□ -2.33
BRX1Q08235 UPS1YLR193C 528 nt0.52□□□□□ -2.33
BRX1Q08235 YLL007CYLL007C 1998 nt0.52□□□□□ -2.33
BRX1Q08235 UTP10YJL109C 5310 nt0.51□□□□□ -2.33
BRX1Q08235 snR84snR84 550 nt0.51□□□□□ -2.33
BRX1Q08235 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt0.51□□□□□ -2.33
BRX1Q08235 ISD11YER048W-A 285 nt0.51□□□□□ -2.33
BRX1Q08235 CSM4YPL200W 471 nt0.51□□□□□ -2.33
BRX1Q08235 LCD1YDR499W 2244 nt0.5□□□□□ -2.33
BRX1Q08235 snR9snR9 187 nt0.5□□□□□ -2.33
BRX1Q08235 PAN2YGL094C 3348 nt0.49□□□□□ -2.33
BRX1Q08235 SPO13YHR014W 876 nt0.49□□□□□ -2.33
BRX1Q08235 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt0.49□□□□□ -2.33
BRX1Q08235 RRT1YBL048W 312 nt0.49□□□□□ -2.33
BRX1Q08235 IES4YOR189W 351 nt0.49□□□□□ -2.33
BRX1Q08235 YPR153WYPR153W 423 nt0.49□□□□□ -2.33
BRX1Q08235 DBP6YNR038W 1890 nt0.49□□□□□ -2.33
BRX1Q08235 MND1YGL183C 660 nt0.48□□□□□ -2.33
BRX1Q08235 YOL038C-AYOL038C-A 96 nt0.48□□□□□ -2.33
BRX1Q08235 ECM12YHR021W-A 456 nt0.47□□□□□ -2.33
BRX1Q08235 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt0.47□□□□□ -2.33
BRX1Q08235 YJR079WYJR079W 330 nt0.47□□□□□ -2.33
BRX1Q08235 ECM9YKR004C 1134 nt0.47□□□□□ -2.33
BRX1Q08235 WAR1YML076C 2835 nt0.46□□□□□ -2.34
BRX1Q08235 YER175W-AYER175W-A 165 nt0.46□□□□□ -2.34
BRX1Q08235 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.46□□□□□ -2.34
BRX1Q08235 PHS1YJL097W 654 nt0.46□□□□□ -2.34
BRX1Q08235 GMC2YLR445W 567 nt0.46□□□□□ -2.34
BRX1Q08235 YBR063CYBR063C 1215 nt0.46□□□□□ -2.34
BRX1Q08235 YLL032CYLL032C 2478 nt0.46□□□□□ -2.34
BRX1Q08235 SLI15YBR156C 2097 nt0.45□□□□□ -2.34
BRX1Q08235 SCEIQ0160 708 nt0.45□□□□□ -2.34
BRX1Q08235 YOR218CYOR218C 420 nt0.45□□□□□ -2.34
BRX1Q08235 PPN1YDR452W 2025 nt0.44□□□□□ -2.34
BRX1Q08235 YAL066WYAL066W 309 nt0.44□□□□□ -2.34
BRX1Q08235 YLR252WYLR252W 306 nt0.44□□□□□ -2.34
BRX1Q08235 YOR282WYOR282W 321 nt0.44□□□□□ -2.34
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