Protein–RNA interactions for Protein: P36164

TVP38, Golgi apparatus membrane protein TVP38, yeastyeast

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TVP38P36164 OCA6YDR067C 675 nt0.87□□□□□ -2.27
TVP38P36164 YGL217CYGL217C 342 nt0.87□□□□□ -2.27
TVP38P36164 YKL123WYKL123W 381 nt0.87□□□□□ -2.27
TVP38P36164 AFB1YLR040C 675 nt0.87□□□□□ -2.27
TVP38P36164 RPS18BYML026C 441 nt0.87□□□□□ -2.27
TVP38P36164 DDR48YMR173W 1293 nt0.87□□□□□ -2.27
TVP38P36164 SPR3YGR059W 1539 nt0.87□□□□□ -2.27
TVP38P36164 RAD50YNL250W 3939 nt0.87□□□□□ -2.27
TVP38P36164 YCK3YER123W 1575 nt0.86□□□□□ -2.27
TVP38P36164 CDC39YCR093W 6327 nt0.85□□□□□ -2.27
TVP38P36164 YER135CYER135C 393 nt0.85□□□□□ -2.27
TVP38P36164 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt0.85□□□□□ -2.27
TVP38P36164 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt0.85□□□□□ -2.27
TVP38P36164 snR14snR14 160 nt0.85□□□□□ -2.27
TVP38P36164 FMP23YBR047W 528 nt0.85□□□□□ -2.27
TVP38P36164 SLX4YLR135W 2247 nt0.85□□□□□ -2.27
TVP38P36164 PPN1YDR452W 2025 nt0.84□□□□□ -2.27
TVP38P36164 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt0.84□□□□□ -2.27
TVP38P36164 RCN2YOR220W 798 nt0.84□□□□□ -2.27
TVP38P36164 YPR099CYPR099C 357 nt0.84□□□□□ -2.27
TVP38P36164 SLM6YBR266C 453 nt0.84□□□□□ -2.27
TVP38P36164 SEC3YER008C 4011 nt0.83□□□□□ -2.28
TVP38P36164 YDR509WYDR509W 348 nt0.83□□□□□ -2.28
TVP38P36164 YDR521WYDR521W 336 nt0.83□□□□□ -2.28
TVP38P36164 YGR265WYGR265W 411 nt0.83□□□□□ -2.28
TVP38P36164 BER1YLR412W 825 nt0.83□□□□□ -2.28
TVP38P36164 ISF1YMR081C 1017 nt0.83□□□□□ -2.28
TVP38P36164 SMC1YFL008W 3678 nt0.83□□□□□ -2.28
TVP38P36164 HNT1YDL125C 477 nt0.82□□□□□ -2.28
TVP38P36164 snR84snR84 550 nt0.82□□□□□ -2.28
TVP38P36164 NHP2YDL208W 471 nt0.82□□□□□ -2.28
TVP38P36164 RTR1YER139C 681 nt0.82□□□□□ -2.28
TVP38P36164 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.82□□□□□ -2.28
TVP38P36164 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.82□□□□□ -2.28
TVP38P36164 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.82□□□□□ -2.28
TVP38P36164 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.82□□□□□ -2.28
TVP38P36164 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.82□□□□□ -2.28
TVP38P36164 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.82□□□□□ -2.28
TVP38P36164 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.82□□□□□ -2.28
TVP38P36164 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.82□□□□□ -2.28
TVP38P36164 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.82□□□□□ -2.28
TVP38P36164 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.82□□□□□ -2.28
TVP38P36164 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.82□□□□□ -2.28
TVP38P36164 CMC4YMR194C-B 222 nt0.82□□□□□ -2.28
TVP38P36164 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt0.82□□□□□ -2.28
TVP38P36164 YPR039WYPR039W 336 nt0.82□□□□□ -2.28
TVP38P36164 HDA3YPR179C 1968 nt0.82□□□□□ -2.28
TVP38P36164 PAN3YKL025C 2040 nt0.82□□□□□ -2.28
TVP38P36164 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt0.82□□□□□ -2.28
TVP38P36164 YLL054CYLL054C 2532 nt0.81□□□□□ -2.28
TVP38P36164 HUR1YGL168W 333 nt0.81□□□□□ -2.28
TVP38P36164 YBR032WYBR032W 303 nt0.81□□□□□ -2.28
TVP38P36164 YOP1YPR028W 543 nt0.81□□□□□ -2.28
TVP38P36164 STB6YKL072W 2301 nt0.8□□□□□ -2.28
TVP38P36164 YDR008CYDR008C 351 nt0.8□□□□□ -2.28
TVP38P36164 YOR248WYOR248W 303 nt0.8□□□□□ -2.28
TVP38P36164 SVS1YPL163C 783 nt0.8□□□□□ -2.28
TVP38P36164 SWI4YER111C 3282 nt0.8□□□□□ -2.28
TVP38P36164 SWI5YDR146C 2130 nt0.8□□□□□ -2.28
TVP38P36164 SGO1YOR073W 1773 nt0.8□□□□□ -2.28
TVP38P36164 ILM1YJR118C 612 nt0.79□□□□□ -2.28
TVP38P36164 YBL073WYBL073W 312 nt0.79□□□□□ -2.28
TVP38P36164 YGR025WYGR025W 303 nt0.78□□□□□ -2.28
TVP38P36164 RPL16AYIL133C 600 nt0.78□□□□□ -2.28
TVP38P36164 RPL9BYNL067W 576 nt0.78□□□□□ -2.28
TVP38P36164 YOL014WYOL014W 375 nt0.78□□□□□ -2.28
TVP38P36164 GDS1YOR355W 1569 nt0.78□□□□□ -2.29
TVP38P36164 YDL073WYDL073W 2955 nt0.78□□□□□ -2.29
TVP38P36164 KAP120YPL125W 3099 nt0.78□□□□□ -2.29
TVP38P36164 YAP3YHL009C 993 nt0.77□□□□□ -2.29
TVP38P36164 IRC23YOR044W 474 nt0.77□□□□□ -2.29
TVP38P36164 SAS3YBL052C 2496 nt0.77□□□□□ -2.29
TVP38P36164 SEC1YDR164C 2175 nt0.76□□□□□ -2.29
TVP38P36164 APQ13YJL075C 417 nt0.76□□□□□ -2.29
TVP38P36164 snR13snR13 124 nt0.76□□□□□ -2.29
TVP38P36164 SPT21YMR179W 2277 nt0.76□□□□□ -2.29
TVP38P36164 SPO23YBR250W 1572 nt0.75□□□□□ -2.29
TVP38P36164 PXA2YKL188C 2562 nt0.75□□□□□ -2.29
TVP38P36164 MKT1YNL085W 2493 nt0.75□□□□□ -2.29
TVP38P36164 APL3YBL037W 3078 nt0.75□□□□□ -2.29
TVP38P36164 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt0.75□□□□□ -2.29
TVP38P36164 URM1YIL008W 300 nt0.75□□□□□ -2.29
TVP38P36164 RPL32YBL092W 393 nt0.75□□□□□ -2.29
TVP38P36164 RPL9AYGL147C 576 nt0.74□□□□□ -2.29
TVP38P36164 GPI15YNL038W 690 nt0.74□□□□□ -2.29
TVP38P36164 YCS4YLR272C 3531 nt0.74□□□□□ -2.29
TVP38P36164 NUT1YGL151W 3399 nt0.74□□□□□ -2.29
TVP38P36164 TOF2YKR010C 2316 nt0.73□□□□□ -2.29
TVP38P36164 MET32YDR253C 576 nt0.73□□□□□ -2.29
TVP38P36164 YER087C-AYER087C-A 552 nt0.73□□□□□ -2.29
TVP38P36164 RPF1YHR088W 888 nt0.73□□□□□ -2.29
TVP38P36164 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.73□□□□□ -2.29
TVP38P36164 SDH2YLL041C 801 nt0.73□□□□□ -2.29
TVP38P36164 RUF22RUF22 515 nt0.73□□□□□ -2.29
TVP38P36164 NUT2YPR168W 474 nt0.73□□□□□ -2.29
TVP38P36164 LYS14YDR034C 2373 nt0.72□□□□□ -2.29
TVP38P36164 ENV11YGR071C 2583 nt0.72□□□□□ -2.29
TVP38P36164 PIG1YLR273C 1947 nt0.72□□□□□ -2.29
TVP38P36164 NBL1YHR199C-A 222 nt0.72□□□□□ -2.29
TVP38P36164 STE18YJR086W 333 nt0.72□□□□□ -2.29
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 73.7 ms