Protein–RNA interactions for Protein: Q12244

YLL054C, Uncharacterized transcriptional regulatory protein YLL054C, yeastyeast

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Length 843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLL054CQ12244 PTC5YOR090C 1719 nt2.98□□□□□ -1.93
YLL054CQ12244 RRP12YPL012W 3687 nt2.98□□□□□ -1.93
YLL054CQ12244 INP2YMR163C 2118 nt2.98□□□□□ -1.93
YLL054CQ12244 SEC7YDR170C 6030 nt2.96□□□□□ -1.93
YLL054CQ12244 CLN3YAL040C 1743 nt2.96□□□□□ -1.93
YLL054CQ12244 snR76snR76 109 nt2.96□□□□□ -1.94
YLL054CQ12244 YHR210CYHR210C 1026 nt2.96□□□□□ -1.94
YLL054CQ12244 YOL019W-AYOL019W-A 153 nt2.96□□□□□ -1.94
YLL054CQ12244 ACM1YPL267W 630 nt2.96□□□□□ -1.94
YLL054CQ12244 AI2Q0055 2565 nt2.96□□□□□ -1.94
YLL054CQ12244 SEF1YBL066C 3447 nt2.96□□□□□ -1.94
YLL054CQ12244 MDM1YML104C 3384 nt2.95□□□□□ -1.94
YLL054CQ12244 RPL23BYER117W 414 nt2.95□□□□□ -1.94
YLL054CQ12244 ULI1YFR026C 510 nt2.95□□□□□ -1.94
YLL054CQ12244 tQ(UUG)BtQ(UUG)B 72 nt2.95□□□□□ -1.94
YLL054CQ12244 COX14YML129C 213 nt2.95□□□□□ -1.94
YLL054CQ12244 RPL20AYMR242C 519 nt2.95□□□□□ -1.94
YLL054CQ12244 YBR184WYBR184W 1572 nt2.95□□□□□ -1.94
YLL054CQ12244 PSY2YNL201C 2577 nt2.95□□□□□ -1.94
YLL054CQ12244 NET1YJL076W 3570 nt2.95□□□□□ -1.94
YLL054CQ12244 PMR1YGL167C 2853 nt2.94□□□□□ -1.94
YLL054CQ12244 HEH2YDR458C 1992 nt2.94□□□□□ -1.94
YLL054CQ12244 YLL007CYLL007C 1998 nt2.94□□□□□ -1.94
YLL054CQ12244 BPT1YLL015W 4680 nt2.94□□□□□ -1.94
YLL054CQ12244 BAS1YKR099W 2436 nt2.94□□□□□ -1.94
YLL054CQ12244 GRR1YJR090C 3456 nt2.94□□□□□ -1.94
YLL054CQ12244 DNL4YOR005C 2835 nt2.93□□□□□ -1.94
YLL054CQ12244 snR72snR72 98 nt2.93□□□□□ -1.94
YLL054CQ12244 ECM12YHR021W-A 456 nt2.93□□□□□ -1.94
YLL054CQ12244 YOR345CYOR345C 351 nt2.93□□□□□ -1.94
YLL054CQ12244 VPH1YOR270C 2523 nt2.93□□□□□ -1.94
YLL054CQ12244 SGM1YJR134C 2124 nt2.93□□□□□ -1.94
YLL054CQ12244 NMD2YHR077C 3270 nt2.92□□□□□ -1.94
YLL054CQ12244 YOR296WYOR296W 3870 nt2.92□□□□□ -1.94
YLL054CQ12244 ECM29YHL030W 5607 nt2.92□□□□□ -1.94
YLL054CQ12244 RPL33BYOR234C 324 nt2.92□□□□□ -1.94
YLL054CQ12244 SPO75YLL005C 2607 nt2.92□□□□□ -1.94
YLL054CQ12244 NIP100YPL174C 2607 nt2.92□□□□□ -1.94
YLL054CQ12244 GEA1YJR031C 4227 nt2.92□□□□□ -1.94
YLL054CQ12244 RGC1YPR115W 3252 nt2.92□□□□□ -1.94
YLL054CQ12244 DSE4YNR067C 3354 nt2.91□□□□□ -1.94
YLL054CQ12244 STB4YMR019W 2850 nt2.9□□□□□ -1.94
YLL054CQ12244 SPC98YNL126W 2541 nt2.9□□□□□ -1.94
YLL054CQ12244 SLH1YGR271W 5904 nt2.9□□□□□ -1.94
YLL054CQ12244 PRP6YBR055C 2700 nt2.9□□□□□ -1.95
YLL054CQ12244 ROG1YGL144C 2058 nt2.9□□□□□ -1.95
YLL054CQ12244 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt2.9□□□□□ -1.95
YLL054CQ12244 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt2.9□□□□□ -1.95
YLL054CQ12244 YLR012CYLR012C 300 nt2.9□□□□□ -1.95
YLL054CQ12244 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt2.9□□□□□ -1.95
YLL054CQ12244 SPO22YIL073C 2928 nt2.9□□□□□ -1.95
YLL054CQ12244 ISW1YBR245C 3390 nt2.9□□□□□ -1.95
YLL054CQ12244 YPR089WYPR089W 2667 nt2.89□□□□□ -1.95
YLL054CQ12244 YHL005CYHL005C 393 nt2.89□□□□□ -1.95
YLL054CQ12244 YNL114CYNL114C 372 nt2.89□□□□□ -1.95
YLL054CQ12244 RPS12YOR369C 432 nt2.89□□□□□ -1.95
YLL054CQ12244 RGR1YLR071C 3249 nt2.89□□□□□ -1.95
YLL054CQ12244 SNU13YEL026W 381 nt2.88□□□□□ -1.95
YLL054CQ12244 RGA2YDR379W 3030 nt2.88□□□□□ -1.95
YLL054CQ12244 KSP1YHR082C 3090 nt2.88□□□□□ -1.95
YLL054CQ12244 SIN3YOL004W 4611 nt2.88□□□□□ -1.95
YLL054CQ12244 RPH1YER169W 2391 nt2.87□□□□□ -1.95
YLL054CQ12244 PEP3YLR148W 2757 nt2.87□□□□□ -1.95
YLL054CQ12244 YOR218CYOR218C 420 nt2.87□□□□□ -1.95
YLL054CQ12244 YKU80YMR106C 1890 nt2.86□□□□□ -1.95
YLL054CQ12244 YEL073CYEL073C 324 nt2.86□□□□□ -1.95
YLL054CQ12244 RPL6AYML073C 531 nt2.86□□□□□ -1.95
YLL054CQ12244 TFC8YPL007C 1767 nt2.86□□□□□ -1.95
YLL054CQ12244 COS111YBR203W 2775 nt2.85□□□□□ -1.95
YLL054CQ12244 COY1YKL179C 2040 nt2.85□□□□□ -1.95
YLL054CQ12244 FMP16YDR070C 282 nt2.85□□□□□ -1.95
YLL054CQ12244 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt2.85□□□□□ -1.95
YLL054CQ12244 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt2.85□□□□□ -1.95
YLL054CQ12244 TOP2YNL088W 4287 nt2.85□□□□□ -1.95
YLL054CQ12244 SMY2YBR172C 2223 nt2.85□□□□□ -1.95
YLL054CQ12244 GIS1YDR096W 2685 nt2.85□□□□□ -1.95
YLL054CQ12244 UBP15YMR304W 3693 nt2.84□□□□□ -1.95
YLL054CQ12244 BNR1YIL159W 4128 nt2.84□□□□□ -1.95
YLL054CQ12244 SPO21YOL091W 1830 nt2.84□□□□□ -1.95
YLL054CQ12244 DBP10YDL031W 2988 nt2.84□□□□□ -1.95
YLL054CQ12244 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt2.84□□□□□ -1.95
YLL054CQ12244 RPL42BYHR141C 321 nt2.84□□□□□ -1.95
YLL054CQ12244 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt2.84□□□□□ -1.95
YLL054CQ12244 EMC6YLL014W 327 nt2.84□□□□□ -1.95
YLL054CQ12244 RPL42AYNL162W 321 nt2.84□□□□□ -1.95
YLL054CQ12244 SIR3YLR442C 2937 nt2.84□□□□□ -1.96
YLL054CQ12244 ECM21YBL101C 3354 nt2.84□□□□□ -1.96
YLL054CQ12244 PSD2YGR170W 3417 nt2.83□□□□□ -1.96
YLL054CQ12244 RPB10YOR210W 213 nt2.83□□□□□ -1.96
YLL054CQ12244 YBR174CYBR174C 315 nt2.83□□□□□ -1.96
YLL054CQ12244 snR43snR43 209 nt2.83□□□□□ -1.96
YLL054CQ12244 RFX1YLR176C 2436 nt2.83□□□□□ -1.96
YLL054CQ12244 MCM10YIL150C 1716 nt2.82□□□□□ -1.96
YLL054CQ12244 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt2.82□□□□□ -1.96
YLL054CQ12244 YIR044CYIR044C 186 nt2.82□□□□□ -1.96
YLL054CQ12244 YEF3YLR249W 3135 nt2.82□□□□□ -1.96
YLL054CQ12244 TAE2YPL009C 3117 nt2.81□□□□□ -1.96
YLL054CQ12244 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt2.81□□□□□ -1.96
YLL054CQ12244 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt2.81□□□□□ -1.96
YLL054CQ12244 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt2.81□□□□□ -1.96
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