Protein–RNA interactions for Protein: P38842

YHR140W, UPF0641 membrane protein YHR140W, yeastyeast

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHR140WP38842 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.47□□□□□ -2.33
YHR140WP38842 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.47□□□□□ -2.33
YHR140WP38842 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.47□□□□□ -2.33
YHR140WP38842 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.47□□□□□ -2.33
YHR140WP38842 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.47□□□□□ -2.33
YHR140WP38842 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.47□□□□□ -2.33
YHR140WP38842 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.47□□□□□ -2.33
YHR140WP38842 PAM16YJL104W 450 nt0.47□□□□□ -2.33
YHR140WP38842 TMA22YJR014W 597 nt0.47□□□□□ -2.33
YHR140WP38842 CMC1YKL137W 336 nt0.47□□□□□ -2.33
YHR140WP38842 YBL068W-AYBL068W-A 237 nt0.47□□□□□ -2.33
YHR140WP38842 ATP20YPR020W 348 nt0.47□□□□□ -2.33
YHR140WP38842 MXR1YER042W 555 nt0.46□□□□□ -2.34
YHR140WP38842 CWC23YGL128C 852 nt0.46□□□□□ -2.34
YHR140WP38842 COX7YMR256C 183 nt0.46□□□□□ -2.34
YHR140WP38842 NUT2YPR168W 474 nt0.46□□□□□ -2.34
YHR140WP38842 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt0.46□□□□□ -2.34
YHR140WP38842 AIM44YPL158C 2277 nt0.46□□□□□ -2.34
YHR140WP38842 YML002WYML002W 2214 nt0.46□□□□□ -2.34
YHR140WP38842 YDL206WYDL206W 2289 nt0.45□□□□□ -2.34
YHR140WP38842 NOC3YLR002C 1992 nt0.45□□□□□ -2.34
YHR140WP38842 IRC2YDR112W 309 nt0.45□□□□□ -2.34
YHR140WP38842 POL32YJR043C 1053 nt0.45□□□□□ -2.34
YHR140WP38842 ACF4YJR083C 930 nt0.45□□□□□ -2.34
YHR140WP38842 RPL38YLR325C 237 nt0.45□□□□□ -2.34
YHR140WP38842 DAD1YDR016C 285 nt0.44□□□□□ -2.34
YHR140WP38842 RNR4YGR180C 1038 nt0.44□□□□□ -2.34
YHR140WP38842 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt0.44□□□□□ -2.34
YHR140WP38842 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt0.44□□□□□ -2.34
YHR140WP38842 YLL007CYLL007C 1998 nt0.44□□□□□ -2.34
YHR140WP38842 VPS52YDR484W 1926 nt0.44□□□□□ -2.34
YHR140WP38842 PIG1YLR273C 1947 nt0.43□□□□□ -2.34
YHR140WP38842 RRI2YOL117W 1938 nt0.43□□□□□ -2.34
YHR140WP38842 HNT1YDL125C 477 nt0.43□□□□□ -2.34
YHR140WP38842 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt0.43□□□□□ -2.34
YHR140WP38842 RPL37AYLR185W 267 nt0.43□□□□□ -2.34
YHR140WP38842 YML009C-AYML009C-A 327 nt0.43□□□□□ -2.34
YHR140WP38842 YPL080CYPL080C 327 nt0.43□□□□□ -2.34
YHR140WP38842 LTE1YAL024C 4308 nt0.42□□□□□ -2.34
YHR140WP38842 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt0.42□□□□□ -2.34
YHR140WP38842 snR79snR79 84 nt0.42□□□□□ -2.34
YHR140WP38842 SWF1YDR126W 1011 nt0.42□□□□□ -2.34
YHR140WP38842 BMT5YIL096C 1011 nt0.42□□□□□ -2.34
YHR140WP38842 SDH2YLL041C 801 nt0.42□□□□□ -2.34
YHR140WP38842 UBP3YER151C 2739 nt0.42□□□□□ -2.34
YHR140WP38842 SWI6YLR182W 2412 nt0.42□□□□□ -2.34
YHR140WP38842 SET3YKR029C 2256 nt0.41□□□□□ -2.34
YHR140WP38842 SWI5YDR146C 2130 nt0.41□□□□□ -2.34
YHR140WP38842 SAG1YJR004C 1953 nt0.41□□□□□ -2.34
YHR140WP38842 HDA3YPR179C 1968 nt0.41□□□□□ -2.34
YHR140WP38842 YDL196WYDL196W 330 nt0.41□□□□□ -2.34
YHR140WP38842 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.41□□□□□ -2.34
YHR140WP38842 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt0.41□□□□□ -2.34
YHR140WP38842 YOL106WYOL106W 354 nt0.41□□□□□ -2.34
YHR140WP38842 YOP1YPR028W 543 nt0.41□□□□□ -2.34
YHR140WP38842 FIG4YNL325C 2640 nt0.41□□□□□ -2.34
YHR140WP38842 GEA2YEL022W 4380 nt0.41□□□□□ -2.34
YHR140WP38842 SLD3YGL113W 2007 nt0.4□□□□□ -2.34
YHR140WP38842 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt0.4□□□□□ -2.35
YHR140WP38842 YNL150WYNL150W 408 nt0.4□□□□□ -2.35
YHR140WP38842 YOR199WYOR199W 330 nt0.4□□□□□ -2.35
YHR140WP38842 SLM6YBR266C 453 nt0.4□□□□□ -2.35
YHR140WP38842 MDM32YOR147W 1869 nt0.39□□□□□ -2.35
YHR140WP38842 STO1YMR125W 2586 nt0.39□□□□□ -2.35
YHR140WP38842 LIN1YHR156C 1023 nt0.39□□□□□ -2.35
YHR140WP38842 COX3Q0275 810 nt0.39□□□□□ -2.35
YHR140WP38842 YLR217WYLR217W 324 nt0.39□□□□□ -2.35
YHR140WP38842 YLR412C-AYLR412C-A 207 nt0.39□□□□□ -2.35
YHR140WP38842 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt0.39□□□□□ -2.35
YHR140WP38842 YAR009CYAR009C 3591 nt0.39□□□□□ -2.35
YHR140WP38842 ZIP1YDR285W 2628 nt0.39□□□□□ -2.35
YHR140WP38842 PXA2YKL188C 2562 nt0.39□□□□□ -2.35
YHR140WP38842 YDR220CYDR220C 294 nt0.38□□□□□ -2.35
YHR140WP38842 ALG13YGL047W 609 nt0.38□□□□□ -2.35
YHR140WP38842 ECM12YHR021W-A 456 nt0.38□□□□□ -2.35
YHR140WP38842 LRP1YHR081W 555 nt0.38□□□□□ -2.35
YHR140WP38842 CMS1YLR003C 876 nt0.38□□□□□ -2.35
YHR140WP38842 RUF22RUF22 515 nt0.38□□□□□ -2.35
YHR140WP38842 YOR364WYOR364W 369 nt0.38□□□□□ -2.35
YHR140WP38842 snR84snR84 550 nt0.37□□□□□ -2.35
YHR140WP38842 YHR054CYHR054C 1065 nt0.37□□□□□ -2.35
YHR140WP38842 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt0.37□□□□□ -2.35
YHR140WP38842 SCW11YGL028C 1629 nt0.36□□□□□ -2.35
YHR140WP38842 snR5snR5 204 nt0.36□□□□□ -2.35
YHR140WP38842 YDR509WYDR509W 348 nt0.36□□□□□ -2.35
YHR140WP38842 QCR7YDR529C 384 nt0.36□□□□□ -2.35
YHR140WP38842 YEL057CYEL057C 702 nt0.36□□□□□ -2.35
YHR140WP38842 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt0.36□□□□□ -2.35
YHR140WP38842 YKL111CYKL111C 336 nt0.36□□□□□ -2.35
YHR140WP38842 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt0.36□□□□□ -2.35
YHR140WP38842 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt0.36□□□□□ -2.35
YHR140WP38842 IES4YOR189W 351 nt0.36□□□□□ -2.35
YHR140WP38842 UBS1YBR165W 834 nt0.36□□□□□ -2.35
YHR140WP38842 KAR1YNL188W 1302 nt0.36□□□□□ -2.35
YHR140WP38842 BUD26YDR241W 288 nt0.35□□□□□ -2.35
YHR140WP38842 YER138W-AYER138W-A 105 nt0.35□□□□□ -2.35
YHR140WP38842 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.35□□□□□ -2.35
YHR140WP38842 RPC10YHR143W-A 213 nt0.35□□□□□ -2.35
YHR140WP38842 YBL107W-AYBL107W-A 105 nt0.35□□□□□ -2.35
YHR140WP38842 YPR170CYPR170C 336 nt0.35□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 93.4 ms