Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

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Length 73 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
J3KRW8 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
J3KRW8 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
J3KRW8 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
J3KRW8 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
J3KRW8 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
J3KRW8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
J3KRW8 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
J3KRW8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
J3KRW8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
J3KRW8 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
J3KRW8 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
J3KRW8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
J3KRW8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
J3KRW8 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
J3KRW8 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
J3KRW8 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
J3KRW8 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
J3KRW8 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
J3KRW8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
J3KRW8 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
J3KRW8 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
J3KRW8 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
J3KRW8 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
J3KRW8 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
J3KRW8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
J3KRW8 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
J3KRW8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
J3KRW8 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
J3KRW8 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
J3KRW8 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
J3KRW8 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
J3KRW8 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
J3KRW8 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
J3KRW8 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
J3KRW8 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
J3KRW8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
J3KRW8 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
J3KRW8 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
J3KRW8 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
J3KRW8 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
J3KRW8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
J3KRW8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
J3KRW8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
J3KRW8 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
J3KRW8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
J3KRW8 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
J3KRW8 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
J3KRW8 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
J3KRW8 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
J3KRW8 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
J3KRW8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
J3KRW8 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
J3KRW8 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
J3KRW8 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
J3KRW8 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
J3KRW8 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
J3KRW8 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
J3KRW8 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
J3KRW8 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
J3KRW8 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
J3KRW8 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
J3KRW8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
J3KRW8 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
J3KRW8 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
J3KRW8 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
J3KRW8 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
J3KRW8 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
J3KRW8 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
J3KRW8 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
J3KRW8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
J3KRW8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
J3KRW8 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
J3KRW8 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
J3KRW8 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
J3KRW8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
J3KRW8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
J3KRW8 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
J3KRW8 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
J3KRW8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
J3KRW8 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
J3KRW8 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
J3KRW8 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
J3KRW8 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
J3KRW8 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
J3KRW8 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
J3KRW8 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
J3KRW8 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
J3KRW8 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
J3KRW8 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
J3KRW8 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
J3KRW8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
J3KRW8 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
J3KRW8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
J3KRW8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
J3KRW8 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
J3KRW8 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
J3KRW8 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
J3KRW8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
J3KRW8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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