Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BHMG1C9JSJ3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms