Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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