Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms