Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ2

PHLDB3, Pleckstrin homology-like domain family B member 3, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDB3Q6NSJ2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PHLDB3Q6NSJ2 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PHLDB3Q6NSJ2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PHLDB3Q6NSJ2 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PHLDB3Q6NSJ2 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PHLDB3Q6NSJ2 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PHLDB3Q6NSJ2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHLDB3Q6NSJ2 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHLDB3Q6NSJ2 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHLDB3Q6NSJ2 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms