Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

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Length 746 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EXT1Q16394 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EXT1Q16394 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EXT1Q16394 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EXT1Q16394 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
EXT1Q16394 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EXT1Q16394 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EXT1Q16394 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EXT1Q16394 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EXT1Q16394 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EXT1Q16394 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EXT1Q16394 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
EXT1Q16394 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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EXT1Q16394 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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