Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
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