Protein–RNA interactions for Protein: P53080

EDC1, Enhancer of mRNA-decapping protein 1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
EDC1P53080 VPS74YDR372C 1038 nt-0.04□□□□□ -2.42
EDC1P53080 WIP1YDR374W-A 270 nt-0.04□□□□□ -2.42
EDC1P53080 STF2YGR008C 255 nt-0.04□□□□□ -2.42
EDC1P53080 SPO13YHR014W 876 nt-0.04□□□□□ -2.42
EDC1P53080 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt-0.04□□□□□ -2.42
EDC1P53080 CGI121YML036W 546 nt-0.04□□□□□ -2.42
EDC1P53080 MRPL24YMR193W 777 nt-0.04□□□□□ -2.42
EDC1P53080 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt-0.04□□□□□ -2.42
EDC1P53080 OCA6YDR067C 675 nt-0.05□□□□□ -2.42
EDC1P53080 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt-0.05□□□□□ -2.42
EDC1P53080 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt-0.05□□□□□ -2.42
EDC1P53080 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt-0.05□□□□□ -2.42
EDC1P53080 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt-0.05□□□□□ -2.42
EDC1P53080 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt-0.05□□□□□ -2.42
EDC1P53080 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt-0.05□□□□□ -2.42
EDC1P53080 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt-0.05□□□□□ -2.42
EDC1P53080 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt-0.05□□□□□ -2.42
EDC1P53080 ALG13YGL047W 609 nt-0.05□□□□□ -2.42
EDC1P53080 IMP3YHR148W 552 nt-0.05□□□□□ -2.42
EDC1P53080 YIL089WYIL089W 618 nt-0.05□□□□□ -2.42
EDC1P53080 COX12YLR038C 252 nt-0.05□□□□□ -2.42
EDC1P53080 YOR053WYOR053W 342 nt-0.05□□□□□ -2.42
EDC1P53080 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt-0.06□□□□□ -2.42
EDC1P53080 PAU2YEL049W 363 nt-0.06□□□□□ -2.42
EDC1P53080 SBH1YER087C-B 249 nt-0.06□□□□□ -2.42
EDC1P53080 DUO1YGL061C 744 nt-0.06□□□□□ -2.42
EDC1P53080 YLR042CYLR042C 486 nt-0.06□□□□□ -2.42
EDC1P53080 YOL024WYOL024W 519 nt-0.06□□□□□ -2.42
EDC1P53080 IES4YOR189W 351 nt-0.06□□□□□ -2.42
EDC1P53080 snR13snR13 124 nt-0.06□□□□□ -2.42
EDC1P53080 NUT2YPR168W 474 nt-0.06□□□□□ -2.42
EDC1P53080 NOT5YPR072W 1683 nt-0.06□□□□□ -2.42
EDC1P53080 AEP1YMR064W 1557 nt-0.06□□□□□ -2.42
EDC1P53080 NUP120YKL057C 3114 nt-0.07□□□□□ -2.42
EDC1P53080 YCR016WYCR016W 873 nt-0.07□□□□□ -2.42
EDC1P53080 COX6YHR051W 447 nt-0.07□□□□□ -2.42
EDC1P53080 NEJ1YLR265C 1029 nt-0.07□□□□□ -2.42
EDC1P53080 YLR311CYLR311C 348 nt-0.07□□□□□ -2.42
EDC1P53080 AIM41YOR215C 558 nt-0.07□□□□□ -2.42
EDC1P53080 SWI5YDR146C 2130 nt-0.07□□□□□ -2.42
EDC1P53080 NGG1YDR176W 2109 nt-0.07□□□□□ -2.42
EDC1P53080 VIK1YPL253C 1944 nt-0.07□□□□□ -2.42
EDC1P53080 MPT5YGL178W 2580 nt-0.08□□□□□ -2.42
EDC1P53080 RAD10YML095C 633 nt-0.08□□□□□ -2.42
EDC1P53080 RCN2YOR220W 798 nt-0.08□□□□□ -2.42
EDC1P53080 LOA1YPR139C 903 nt-0.08□□□□□ -2.42
EDC1P53080 YPR153WYPR153W 423 nt-0.08□□□□□ -2.42
EDC1P53080 PRP5YBR237W 2550 nt-0.08□□□□□ -2.42
EDC1P53080 CHS6YJL099W 2241 nt-0.09□□□□□ -2.42
EDC1P53080 GIC2YDR309C 1152 nt-0.09□□□□□ -2.42
EDC1P53080 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt-0.09□□□□□ -2.42
EDC1P53080 YGR265WYGR265W 411 nt-0.09□□□□□ -2.42
EDC1P53080 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt-0.09□□□□□ -2.42
EDC1P53080 YJL114WYJL114W 681 nt-0.09□□□□□ -2.42
EDC1P53080 YLR031WYLR031W 561 nt-0.09□□□□□ -2.42
EDC1P53080 HUG1YML058W-A 207 nt-0.09□□□□□ -2.42
EDC1P53080 IZH4YOL101C 939 nt-0.09□□□□□ -2.42
EDC1P53080 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt-0.09□□□□□ -2.42
EDC1P53080 MKT1YNL085W 2493 nt-0.09□□□□□ -2.42
EDC1P53080 THO2YNL139C 4794 nt-0.09□□□□□ -2.42
EDC1P53080 STO1YMR125W 2586 nt-0.09□□□□□ -2.42
EDC1P53080 DBP6YNR038W 1890 nt-0.1□□□□□ -2.42
EDC1P53080 YKE2YLR200W 345 nt-0.1□□□□□ -2.43
EDC1P53080 DLT1YMR126C 1029 nt-0.1□□□□□ -2.43
EDC1P53080 ATX1YNL259C 222 nt-0.1□□□□□ -2.43
EDC1P53080 MRPL50YNR022C 420 nt-0.1□□□□□ -2.43
EDC1P53080 snR190snR190 190 nt-0.1□□□□□ -2.43
EDC1P53080 BFR2YDR299W 1605 nt-0.1□□□□□ -2.43
EDC1P53080 YGL006W-AYGL006W-A 111 nt-0.11□□□□□ -2.43
EDC1P53080 YKL065W-AYKL065W-A 222 nt-0.11□□□□□ -2.43
EDC1P53080 TEX1YNL253W 1269 nt-0.11□□□□□ -2.43
EDC1P53080 YBR224WYBR224W 516 nt-0.11□□□□□ -2.43
EDC1P53080 YDR034C-CYDR034C-C 1317 nt-0.12□□□□□ -2.43
EDC1P53080 YFL002W-BYFL002W-B 1317 nt-0.12□□□□□ -2.43
EDC1P53080 YGR161W-AYGR161W-A 1317 nt-0.12□□□□□ -2.43
EDC1P53080 YLR410W-AYLR410W-A 1317 nt-0.12□□□□□ -2.43
EDC1P53080 YBL100W-AYBL100W-A 1317 nt-0.12□□□□□ -2.43
EDC1P53080 YCL020WYCL020W 1317 nt-0.12□□□□□ -2.43
EDC1P53080 SLD3YGL113W 2007 nt-0.12□□□□□ -2.43
EDC1P53080 YDR509WYDR509W 348 nt-0.12□□□□□ -2.43
EDC1P53080 GPX2YBR244W 489 nt-0.12□□□□□ -2.43
EDC1P53080 UBC9YDL064W 474 nt-0.13□□□□□ -2.43
EDC1P53080 YER046W-AYER046W-A 330 nt-0.13□□□□□ -2.43
EDC1P53080 RPL26BYGR034W 384 nt-0.13□□□□□ -2.43
EDC1P53080 YHL002C-AYHL002C-A 489 nt-0.13□□□□□ -2.43
EDC1P53080 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt-0.13□□□□□ -2.43
EDC1P53080 YLR232WYLR232W 348 nt-0.13□□□□□ -2.43
EDC1P53080 YBL068W-AYBL068W-A 237 nt-0.13□□□□□ -2.43
EDC1P53080 RTC6YPL183W-A 282 nt-0.13□□□□□ -2.43
EDC1P53080 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt-0.14□□□□□ -2.43
EDC1P53080 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt-0.14□□□□□ -2.43
EDC1P53080 TIM8YJR135W-A 264 nt-0.14□□□□□ -2.43
EDC1P53080 YOL014WYOL014W 375 nt-0.14□□□□□ -2.43
EDC1P53080 YCL046WYCL046W 324 nt-0.14□□□□□ -2.43
EDC1P53080 snR63snR63 255 nt-0.15□□□□□ -2.43
EDC1P53080 MET32YDR253C 576 nt-0.15□□□□□ -2.43
EDC1P53080 YER078W-AYER078W-A 165 nt-0.15□□□□□ -2.43
EDC1P53080 SDH2YLL041C 801 nt-0.15□□□□□ -2.43
EDC1P53080 RUF22RUF22 515 nt-0.15□□□□□ -2.43
EDC1P53080 YOL085W-AYOL085W-A 213 nt-0.15□□□□□ -2.43
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