Protein–RNA interactions for Protein: P36062

AVT3, Vacuolar amino acid transporter 3, yeastyeast

Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVT3P36062 RGM1YMR182C 636 nt5.33□□□□□ -1.56
AVT3P36062 SBE22YHR103W 2559 nt5.33□□□□□ -1.56
AVT3P36062 MIT1YEL007W 2001 nt5.32□□□□□ -1.56
AVT3P36062 YHR073W-AYHR073W-A 177 nt5.32□□□□□ -1.56
AVT3P36062 RPL42AYNL162W 321 nt5.32□□□□□ -1.56
AVT3P36062 MNE1YOR350C 1992 nt5.32□□□□□ -1.56
AVT3P36062 RTT10YPL183C 3042 nt5.32□□□□□ -1.56
AVT3P36062 KAP123YER110C 3342 nt5.32□□□□□ -1.56
AVT3P36062 FRT2YAL028W 1587 nt5.32□□□□□ -1.56
AVT3P36062 YAT2YER024W 2772 nt5.32□□□□□ -1.56
AVT3P36062 YPR089WYPR089W 2667 nt5.31□□□□□ -1.56
AVT3P36062 MIS1YBR084W 2928 nt5.31□□□□□ -1.56
AVT3P36062 RCY1YJL204C 2523 nt5.31□□□□□ -1.56
AVT3P36062 ISA1YLL027W 753 nt5.3□□□□□ -1.56
AVT3P36062 PSY2YNL201C 2577 nt5.3□□□□□ -1.56
AVT3P36062 MLH2YLR035C 2088 nt5.3□□□□□ -1.56
AVT3P36062 RAD4YER162C 2265 nt5.3□□□□□ -1.56
AVT3P36062 PTP3YER075C 2787 nt5.28□□□□□ -1.56
AVT3P36062 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt5.28□□□□□ -1.56
AVT3P36062 YDL242WYDL242W 354 nt5.28□□□□□ -1.56
AVT3P36062 PHM6YDR281C 315 nt5.28□□□□□ -1.56
AVT3P36062 TMA19YKL056C 504 nt5.28□□□□□ -1.56
AVT3P36062 YPL278CYPL278C 303 nt5.28□□□□□ -1.56
AVT3P36062 PAN1YIR006C 4443 nt5.28□□□□□ -1.56
AVT3P36062 SWI5YDR146C 2130 nt5.27□□□□□ -1.57
AVT3P36062 ROG1YGL144C 2058 nt5.27□□□□□ -1.57
AVT3P36062 YLR364C-AYLR364C-A 123 nt5.27□□□□□ -1.57
AVT3P36062 PUT3YKL015W 2940 nt5.27□□□□□ -1.57
AVT3P36062 SCH9YHR205W 2475 nt5.26□□□□□ -1.57
AVT3P36062 YPK9YOR291W 4419 nt5.26□□□□□ -1.57
AVT3P36062 SMY2YBR172C 2223 nt5.25□□□□□ -1.57
AVT3P36062 YPR022CYPR022C 3402 nt5.25□□□□□ -1.57
AVT3P36062 FUN30YAL019W 3396 nt5.25□□□□□ -1.57
AVT3P36062 SUL1YBR294W 2580 nt5.24□□□□□ -1.57
AVT3P36062 YKU80YMR106C 1890 nt5.24□□□□□ -1.57
AVT3P36062 RAD2YGR258C 3096 nt5.24□□□□□ -1.57
AVT3P36062 YIL080WYIL080W 4722 nt5.24□□□□□ -1.57
AVT3P36062 SYT1YPR095C 3681 nt5.23□□□□□ -1.57
AVT3P36062 FRE2YKL220C 2136 nt5.23□□□□□ -1.57
AVT3P36062 RRP12YPL012W 3687 nt5.22□□□□□ -1.57
AVT3P36062 MNL2YLR057W 2550 nt5.22□□□□□ -1.57
AVT3P36062 NOP10YHR072W-A 177 nt5.22□□□□□ -1.57
AVT3P36062 PMC1YGL006W 3522 nt5.22□□□□□ -1.57
AVT3P36062 CHS6YJL099W 2241 nt5.21□□□□□ -1.57
AVT3P36062 SLD3YGL113W 2007 nt5.21□□□□□ -1.57
AVT3P36062 LYS14YDR034C 2373 nt5.21□□□□□ -1.58
AVT3P36062 MCM7YBR202W 2538 nt5.21□□□□□ -1.58
AVT3P36062 PDR12YPL058C 4536 nt5.2□□□□□ -1.58
AVT3P36062 FAT1YBR041W 2010 nt5.19□□□□□ -1.58
AVT3P36062 ATG2YNL242W 4779 nt5.19□□□□□ -1.58
AVT3P36062 RAD5YLR032W 3510 nt5.19□□□□□ -1.58
AVT3P36062 YCF1YDR135C 4548 nt5.18□□□□□ -1.58
AVT3P36062 PRP6YBR055C 2700 nt5.18□□□□□ -1.58
AVT3P36062 SWI3YJL176C 2478 nt5.18□□□□□ -1.58
AVT3P36062 RPL20AYMR242C 519 nt5.18□□□□□ -1.58
AVT3P36062 TSC11YER093C 4293 nt5.18□□□□□ -1.58
AVT3P36062 DNL4YOR005C 2835 nt5.18□□□□□ -1.58
AVT3P36062 tL(UAG)JtL(UAG)J 82 nt5.17□□□□□ -1.58
AVT3P36062 tL(UAG)L1tL(UAG)L1 82 nt5.17□□□□□ -1.58
AVT3P36062 tL(UAG)L2tL(UAG)L2 82 nt5.17□□□□□ -1.58
AVT3P36062 HRD3YLR207W 2502 nt5.17□□□□□ -1.58
AVT3P36062 PRP5YBR237W 2550 nt5.16□□□□□ -1.58
AVT3P36062 CRM1YGR218W 3255 nt5.15□□□□□ -1.58
AVT3P36062 MAK21YDR060W 3078 nt5.15□□□□□ -1.58
AVT3P36062 GCR1YPL075W 2358 nt5.15□□□□□ -1.58
AVT3P36062 TAE2YPL009C 3117 nt5.15□□□□□ -1.58
AVT3P36062 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt5.15□□□□□ -1.59
AVT3P36062 IRR1YIL026C 3453 nt5.15□□□□□ -1.59
AVT3P36062 YDR186CYDR186C 2634 nt5.14□□□□□ -1.59
AVT3P36062 YGL140CYGL140C 3660 nt5.13□□□□□ -1.59
AVT3P36062 YFL065CYFL065C 309 nt5.13□□□□□ -1.59
AVT3P36062 YPR203WYPR203W 309 nt5.13□□□□□ -1.59
AVT3P36062 SMC2YFR031C 3513 nt5.13□□□□□ -1.59
AVT3P36062 NET1YJL076W 3570 nt5.12□□□□□ -1.59
AVT3P36062 YNR065CYNR065C 3351 nt5.12□□□□□ -1.59
AVT3P36062 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt5.11□□□□□ -1.59
AVT3P36062 RPS30BYOR182C 192 nt5.11□□□□□ -1.59
AVT3P36062 SRO7YPR032W 3102 nt5.11□□□□□ -1.59
AVT3P36062 PEP5YMR231W 3090 nt5.1□□□□□ -1.59
AVT3P36062 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt5.1□□□□□ -1.59
AVT3P36062 ZRG8YER033C 3231 nt5.1□□□□□ -1.59
AVT3P36062 ZDS2YML109W 2829 nt5.1□□□□□ -1.59
AVT3P36062 RAD34YDR314C 2079 nt5.09□□□□□ -1.59
AVT3P36062 CHS2YBR038W 2892 nt5.09□□□□□ -1.59
AVT3P36062 AFI1YOR129C 2682 nt5.09□□□□□ -1.59
AVT3P36062 DYN2YDR424C 279 nt5.09□□□□□ -1.59
AVT3P36062 YDR545C-AYDR545C-A 480 nt5.09□□□□□ -1.59
AVT3P36062 AKL1YBR059C 3327 nt5.09□□□□□ -1.59
AVT3P36062 MSK1YNL073W 1731 nt5.09□□□□□ -1.6
AVT3P36062 KGD1YIL125W 3045 nt5.08□□□□□ -1.6
AVT3P36062 YHR080CYHR080C 4038 nt5.07□□□□□ -1.6
AVT3P36062 ROT2YBR229C 2865 nt5.06□□□□□ -1.6
AVT3P36062 SET1YHR119W 3243 nt5.06□□□□□ -1.6
AVT3P36062 ZIP2YGL249W 2115 nt5.06□□□□□ -1.6
AVT3P36062 RGA2YDR379W 3030 nt5.05□□□□□ -1.6
AVT3P36062 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt5.05□□□□□ -1.6
AVT3P36062 MET5YJR137C 4329 nt5.05□□□□□ -1.6
AVT3P36062 SET2YJL168C 2202 nt5.04□□□□□ -1.6
AVT3P36062 MMS22YLR320W 4365 nt5.04□□□□□ -1.6
AVT3P36062 SPT4YGR063C 309 nt5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 9.7 ms