Protein–RNA interactions for Protein: P0CX21

YRF1-5, Y' element ATP-dependent helicase protein 1 copy 5, yeastyeast

Predictions only

Length 1,796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRF1-5P0CX21 YGL217CYGL217C 342 nt0.32□□□□□ -2.36
YRF1-5P0CX21 YAR053WYAR053W 297 nt0.32□□□□□ -2.36
YRF1-5P0CX21 AEP1YMR064W 1557 nt0.31□□□□□ -2.36
YRF1-5P0CX21 GDS1YOR355W 1569 nt0.31□□□□□ -2.36
YRF1-5P0CX21 SGO1YOR073W 1773 nt0.31□□□□□ -2.36
YRF1-5P0CX21 TMA20YER007C-A 546 nt0.31□□□□□ -2.36
YRF1-5P0CX21 EDC1YGL222C 528 nt0.31□□□□□ -2.36
YRF1-5P0CX21 YLL020CYLL020C 306 nt0.31□□□□□ -2.36
YRF1-5P0CX21 NBP1YLR457C 960 nt0.31□□□□□ -2.36
YRF1-5P0CX21 YOL150CYOL150C 312 nt0.31□□□□□ -2.36
YRF1-5P0CX21 IES4YOR189W 351 nt0.31□□□□□ -2.36
YRF1-5P0CX21 YBR224WYBR224W 516 nt0.31□□□□□ -2.36
YRF1-5P0CX21 ARP9YMR033W 1404 nt0.31□□□□□ -2.36
YRF1-5P0CX21 BPH1YCR032W 6504 nt0.31□□□□□ -2.36
YRF1-5P0CX21 NGG1YDR176W 2109 nt0.31□□□□□ -2.36
YRF1-5P0CX21 URB1YKL014C 5295 nt0.3□□□□□ -2.36
YRF1-5P0CX21 YFL012W-AYFL012W-A 375 nt0.3□□□□□ -2.36
YRF1-5P0CX21 VMA7YGR020C 357 nt0.3□□□□□ -2.36
YRF1-5P0CX21 YIR020CYIR020C 303 nt0.3□□□□□ -2.36
YRF1-5P0CX21 MFA2YNL145W 117 nt0.3□□□□□ -2.36
YRF1-5P0CX21 YNL162W-AYNL162W-A 219 nt0.3□□□□□ -2.36
YRF1-5P0CX21 MUM2YBR057C 1101 nt0.3□□□□□ -2.36
YRF1-5P0CX21 PEX34YCL056C 435 nt0.3□□□□□ -2.36
YRF1-5P0CX21 HDA3YPR179C 1968 nt0.3□□□□□ -2.36
YRF1-5P0CX21 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.3□□□□□ -2.36
YRF1-5P0CX21 VAB2YEL005C 849 nt0.29□□□□□ -2.36
YRF1-5P0CX21 POP8YBL018C 402 nt0.29□□□□□ -2.36
YRF1-5P0CX21 YET2YMR040W 483 nt0.29□□□□□ -2.36
YRF1-5P0CX21 DLT1YMR126C 1029 nt0.29□□□□□ -2.36
YRF1-5P0CX21 YMR324CYMR324C 243 nt0.29□□□□□ -2.36
YRF1-5P0CX21 RPL9BYNL067W 576 nt0.29□□□□□ -2.36
YRF1-5P0CX21 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt0.29□□□□□ -2.36
YRF1-5P0CX21 AI4Q0065 1671 nt0.28□□□□□ -2.36
YRF1-5P0CX21 OSH6YKR003W 1347 nt0.28□□□□□ -2.36
YRF1-5P0CX21 GLG1YKR058W 1851 nt0.28□□□□□ -2.36
YRF1-5P0CX21 YDR248CYDR248C 582 nt0.28□□□□□ -2.36
YRF1-5P0CX21 SLD5YDR489W 885 nt0.28□□□□□ -2.36
YRF1-5P0CX21 YKL065W-AYKL065W-A 222 nt0.28□□□□□ -2.36
YRF1-5P0CX21 SEC22YLR268W 645 nt0.28□□□□□ -2.36
YRF1-5P0CX21 YPL135C-AYPL135C-A 174 nt0.28□□□□□ -2.36
YRF1-5P0CX21 ESP1YGR098C 4893 nt0.28□□□□□ -2.36
YRF1-5P0CX21 YER046W-AYER046W-A 330 nt0.27□□□□□ -2.37
YRF1-5P0CX21 YNR021WYNR021W 1215 nt0.27□□□□□ -2.37
YRF1-5P0CX21 BRX1YOL077C 876 nt0.27□□□□□ -2.37
YRF1-5P0CX21 COG7YGL005C 840 nt0.27□□□□□ -2.37
YRF1-5P0CX21 YGR045CYGR045C 363 nt0.27□□□□□ -2.37
YRF1-5P0CX21 RPC25YKL144C 639 nt0.27□□□□□ -2.37
YRF1-5P0CX21 NTC20YBR188C 423 nt0.27□□□□□ -2.37
YRF1-5P0CX21 SLS1YLR139C 1932 nt0.26□□□□□ -2.37
YRF1-5P0CX21 NUR1YDL089W 1455 nt0.26□□□□□ -2.37
YRF1-5P0CX21 YCR043CYCR043C 384 nt0.26□□□□□ -2.37
YRF1-5P0CX21 MXR1YER042W 555 nt0.26□□□□□ -2.37
YRF1-5P0CX21 IZH4YOL101C 939 nt0.25□□□□□ -2.37
YRF1-5P0CX21 RTR1YER139C 681 nt0.24□□□□□ -2.37
YRF1-5P0CX21 MMS2YGL087C 414 nt0.24□□□□□ -2.37
YRF1-5P0CX21 GRX8YLR364W 330 nt0.24□□□□□ -2.37
YRF1-5P0CX21 VPS28YPL065W 729 nt0.24□□□□□ -2.37
YRF1-5P0CX21 YHL048C-AYHL048C-A 135 nt0.24□□□□□ -2.37
YRF1-5P0CX21 PGA1YNL158W 597 nt0.24□□□□□ -2.37
YRF1-5P0CX21 snR13snR13 124 nt0.24□□□□□ -2.37
YRF1-5P0CX21 RRP15YPR143W 753 nt0.24□□□□□ -2.37
YRF1-5P0CX21 GPX2YBR244W 489 nt0.24□□□□□ -2.37
YRF1-5P0CX21 YJL114WYJL114W 681 nt0.23□□□□□ -2.37
YRF1-5P0CX21 YLR031WYLR031W 561 nt0.23□□□□□ -2.37
YRF1-5P0CX21 CGI121YML036W 546 nt0.23□□□□□ -2.37
YRF1-5P0CX21 SUT2YPR009W 807 nt0.23□□□□□ -2.37
YRF1-5P0CX21 SPT21YMR179W 2277 nt0.23□□□□□ -2.37
YRF1-5P0CX21 TOF2YKR010C 2316 nt0.23□□□□□ -2.37
YRF1-5P0CX21 ULI1YFR026C 510 nt0.22□□□□□ -2.37
YRF1-5P0CX21 YDL196WYDL196W 330 nt0.22□□□□□ -2.37
YRF1-5P0CX21 RCN1YKL159C 636 nt0.21□□□□□ -2.38
YRF1-5P0CX21 YAL064WYAL064W 285 nt0.21□□□□□ -2.38
YRF1-5P0CX21 YER147C-AYER147C-A 411 nt0.2□□□□□ -2.38
YRF1-5P0CX21 YKE2YLR200W 345 nt0.2□□□□□ -2.38
YRF1-5P0CX21 YDL206WYDL206W 2289 nt0.2□□□□□ -2.38
YRF1-5P0CX21 MAM1YER106W 909 nt0.19□□□□□ -2.38
YRF1-5P0CX21 NEJ1YLR265C 1029 nt0.19□□□□□ -2.38
YRF1-5P0CX21 SPC2YML055W 537 nt0.19□□□□□ -2.38
YRF1-5P0CX21 YBR012CYBR012C 420 nt0.19□□□□□ -2.38
YRF1-5P0CX21 UTP10YJL109C 5310 nt0.19□□□□□ -2.38
YRF1-5P0CX21 MPT5YGL178W 2580 nt0.19□□□□□ -2.38
YRF1-5P0CX21 snR63snR63 255 nt0.19□□□□□ -2.38
YRF1-5P0CX21 YDR262WYDR262W 819 nt0.19□□□□□ -2.38
YRF1-5P0CX21 DUO1YGL061C 744 nt0.19□□□□□ -2.38
YRF1-5P0CX21 YOL024WYOL024W 519 nt0.19□□□□□ -2.38
YRF1-5P0CX21 YPL034WYPL034W 498 nt0.19□□□□□ -2.38
YRF1-5P0CX21 YOR053WYOR053W 342 nt0.18□□□□□ -2.38
YRF1-5P0CX21 NUT1YGL151W 3399 nt0.18□□□□□ -2.38
YRF1-5P0CX21 NDD1YOR372C 1665 nt0.17□□□□□ -2.38
YRF1-5P0CX21 YDR509WYDR509W 348 nt0.17□□□□□ -2.38
YRF1-5P0CX21 BMT5YIL096C 1011 nt0.17□□□□□ -2.38
YRF1-5P0CX21 YOL085W-AYOL085W-A 213 nt0.17□□□□□ -2.38
YRF1-5P0CX21 YCR016WYCR016W 873 nt0.17□□□□□ -2.38
YRF1-5P0CX21 SWF1YDR126W 1011 nt0.17□□□□□ -2.38
YRF1-5P0CX21 GMC2YLR445W 567 nt0.17□□□□□ -2.38
YRF1-5P0CX21 CYC7YEL039C 342 nt0.16□□□□□ -2.38
YRF1-5P0CX21 MRPL50YNR022C 420 nt0.16□□□□□ -2.38
YRF1-5P0CX21 YPR142CYPR142C 564 nt0.16□□□□□ -2.38
YRF1-5P0CX21 NUT2YPR168W 474 nt0.16□□□□□ -2.38
YRF1-5P0CX21 YBP2YGL060W 1926 nt0.15□□□□□ -2.39
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 24.4 ms