Protein–RNA interactions for Protein: Q08438

VHS3, Phosphopantothenoylcysteine decarboxylase subunit VHS3, yeastyeast

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VHS3Q08438 snR65snR65 100 nt2.85□□□□□ -1.95
VHS3Q08438 snR79snR79 84 nt2.85□□□□□ -1.95
VHS3Q08438 UTP30YKR060W 825 nt2.85□□□□□ -1.95
VHS3Q08438 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.84□□□□□ -1.95
VHS3Q08438 YOR296WYOR296W 3870 nt2.84□□□□□ -1.95
VHS3Q08438 RPL23BYER117W 414 nt2.84□□□□□ -1.95
VHS3Q08438 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt2.84□□□□□ -1.95
VHS3Q08438 YLR031WYLR031W 561 nt2.84□□□□□ -1.95
VHS3Q08438 RGM1YMR182C 636 nt2.84□□□□□ -1.95
VHS3Q08438 RPL25YOL127W 429 nt2.84□□□□□ -1.95
VHS3Q08438 snR76snR76 109 nt2.83□□□□□ -1.96
VHS3Q08438 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt2.83□□□□□ -1.96
VHS3Q08438 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt2.83□□□□□ -1.96
VHS3Q08438 YBL073WYBL073W 312 nt2.83□□□□□ -1.96
VHS3Q08438 BAS1YKR099W 2436 nt2.83□□□□□ -1.96
VHS3Q08438 YDL011CYDL011C 324 nt2.82□□□□□ -1.96
VHS3Q08438 HMF1YER057C 390 nt2.82□□□□□ -1.96
VHS3Q08438 YER121WYER121W 345 nt2.82□□□□□ -1.96
VHS3Q08438 YFL032WYFL032W 321 nt2.82□□□□□ -1.96
VHS3Q08438 RPS22AYJL190C 393 nt2.82□□□□□ -1.96
VHS3Q08438 IRC23YOR044W 474 nt2.82□□□□□ -1.96
VHS3Q08438 YBR197CYBR197C 654 nt2.82□□□□□ -1.96
VHS3Q08438 SAP1YER047C 2694 nt2.82□□□□□ -1.96
VHS3Q08438 SRB8YCR081W 4284 nt2.82□□□□□ -1.96
VHS3Q08438 NUP120YKL057C 3114 nt2.82□□□□□ -1.96
VHS3Q08438 ESC1YMR219W 4977 nt2.81□□□□□ -1.96
VHS3Q08438 YDR193WYDR193W 399 nt2.81□□□□□ -1.96
VHS3Q08438 YDR209CYDR209C 414 nt2.81□□□□□ -1.96
VHS3Q08438 AYR1YIL124W 894 nt2.81□□□□□ -1.96
VHS3Q08438 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt2.81□□□□□ -1.96
VHS3Q08438 SHE2YKL130C 741 nt2.81□□□□□ -1.96
VHS3Q08438 FPR1YNL135C 345 nt2.81□□□□□ -1.96
VHS3Q08438 PGA1YNL158W 597 nt2.81□□□□□ -1.96
VHS3Q08438 PCF11YDR228C 1881 nt2.81□□□□□ -1.96
VHS3Q08438 BCK1YJL095W 4437 nt2.81□□□□□ -1.96
VHS3Q08438 SIN3YOL004W 4611 nt2.81□□□□□ -1.96
VHS3Q08438 NAN1YPL126W 2691 nt2.8□□□□□ -1.96
VHS3Q08438 WIP1YDR374W-A 270 nt2.8□□□□□ -1.96
VHS3Q08438 RPL14BYHL001W 417 nt2.8□□□□□ -1.96
VHS3Q08438 RPL39YJL189W 156 nt2.8□□□□□ -1.96
VHS3Q08438 FCF2YLR051C 654 nt2.8□□□□□ -1.96
VHS3Q08438 RPL26AYLR344W 384 nt2.8□□□□□ -1.96
VHS3Q08438 ISF1YMR081C 1017 nt2.8□□□□□ -1.96
VHS3Q08438 YMR324CYMR324C 243 nt2.8□□□□□ -1.96
VHS3Q08438 snR36snR36 182 nt2.8□□□□□ -1.96
VHS3Q08438 AXL1YPR122W 3627 nt2.8□□□□□ -1.96
VHS3Q08438 TRA1YHR099W 11235 nt2.8□□□□□ -1.96
VHS3Q08438 VPS64YDR200C 1815 nt2.79□□□□□ -1.96
VHS3Q08438 PFF1YBR074W 2931 nt2.79□□□□□ -1.96
VHS3Q08438 IKI3YLR384C 4050 nt2.79□□□□□ -1.96
VHS3Q08438 SAK1YER129W 3429 nt2.79□□□□□ -1.96
VHS3Q08438 NAB3YPL190C 2409 nt2.79□□□□□ -1.96
VHS3Q08438 ERP6YGL002W 651 nt2.79□□□□□ -1.96
VHS3Q08438 YDR366CYDR366C 399 nt2.78□□□□□ -1.96
VHS3Q08438 YAR029WYAR029W 225 nt2.78□□□□□ -1.96
VHS3Q08438 MRPL33YMR286W 261 nt2.78□□□□□ -1.96
VHS3Q08438 YPL182CYPL182C 384 nt2.78□□□□□ -1.96
VHS3Q08438 YPR146CYPR146C 330 nt2.78□□□□□ -1.96
VHS3Q08438 YBP1YBR216C 2025 nt2.78□□□□□ -1.96
VHS3Q08438 SWR1YDR334W 4545 nt2.78□□□□□ -1.97
VHS3Q08438 STE5YDR103W 2754 nt2.77□□□□□ -1.97
VHS3Q08438 DAD4YDR320C-A 219 nt2.77□□□□□ -1.97
VHS3Q08438 YOR282WYOR282W 321 nt2.77□□□□□ -1.97
VHS3Q08438 YPL229WYPL229W 621 nt2.77□□□□□ -1.97
VHS3Q08438 GIN4YDR507C 3429 nt2.77□□□□□ -1.97
VHS3Q08438 ORC1YML065W 2745 nt2.77□□□□□ -1.97
VHS3Q08438 VPS41YDR080W 2979 nt2.76□□□□□ -1.97
VHS3Q08438 GEA1YJR031C 4227 nt2.76□□□□□ -1.97
VHS3Q08438 UTP14YML093W 2700 nt2.76□□□□□ -1.97
VHS3Q08438 IPT1YDR072C 1584 nt2.76□□□□□ -1.97
VHS3Q08438 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt2.76□□□□□ -1.97
VHS3Q08438 MZM1YDR493W 372 nt2.76□□□□□ -1.97
VHS3Q08438 YNL010WYNL010W 726 nt2.76□□□□□ -1.97
VHS3Q08438 RPO41YFL036W 4056 nt2.75□□□□□ -1.97
VHS3Q08438 YPL216WYPL216W 3309 nt2.75□□□□□ -1.97
VHS3Q08438 CAF120YNL278W 3183 nt2.75□□□□□ -1.97
VHS3Q08438 YJL070CYJL070C 2667 nt2.75□□□□□ -1.97
VHS3Q08438 YGL063C-AYGL063C-A 150 nt2.75□□□□□ -1.97
VHS3Q08438 LSO2YGR169C-A 279 nt2.75□□□□□ -1.97
VHS3Q08438 PSY1YKL076C 384 nt2.75□□□□□ -1.97
VHS3Q08438 RPL36AYMR194W 303 nt2.75□□□□□ -1.97
VHS3Q08438 YOL019W-AYOL019W-A 153 nt2.75□□□□□ -1.97
VHS3Q08438 YOR050CYOR050C 348 nt2.75□□□□□ -1.97
VHS3Q08438 RRP12YPL012W 3687 nt2.75□□□□□ -1.97
VHS3Q08438 SSN2YDR443C 4263 nt2.74□□□□□ -1.97
VHS3Q08438 APC9YLR102C 798 nt2.74□□□□□ -1.97
VHS3Q08438 YMR158W-BYMR158W-B 321 nt2.74□□□□□ -1.97
VHS3Q08438 LSM7YNL147W 348 nt2.74□□□□□ -1.97
VHS3Q08438 RTT10YPL183C 3042 nt2.74□□□□□ -1.97
VHS3Q08438 MPH1YIR002C 2982 nt2.73□□□□□ -1.97
VHS3Q08438 MSB2YGR014W 3921 nt2.73□□□□□ -1.97
VHS3Q08438 RLI1YDR091C 1827 nt2.73□□□□□ -1.97
VHS3Q08438 RPS24AYER074W 408 nt2.73□□□□□ -1.97
VHS3Q08438 YGL014C-AYGL014C-A 162 nt2.73□□□□□ -1.97
VHS3Q08438 YGL239CYGL239C 315 nt2.73□□□□□ -1.97
VHS3Q08438 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt2.73□□□□□ -1.97
VHS3Q08438 YML037CYML037C 1023 nt2.73□□□□□ -1.97
VHS3Q08438 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt2.73□□□□□ -1.97
VHS3Q08438 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt2.73□□□□□ -1.97
VHS3Q08438 YBR085C-AYBR085C-A 258 nt2.73□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 65 ms