Protein–RNA interactions for Protein: Q12297

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, yeastyeast

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TAF3Q12297 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt2.94□□□□□ -1.94
TAF3Q12297 HYR1YIR037W 492 nt2.94□□□□□ -1.94
TAF3Q12297 AIM26YKL037W 357 nt2.94□□□□□ -1.94
TAF3Q12297 TMA10YLR327C 261 nt2.94□□□□□ -1.94
TAF3Q12297 YMR122W-AYMR122W-A 255 nt2.94□□□□□ -1.94
TAF3Q12297 YPR014CYPR014C 330 nt2.94□□□□□ -1.94
TAF3Q12297 BPT1YLL015W 4680 nt2.93□□□□□ -1.94
TAF3Q12297 YER079C-AYER079C-A 339 nt2.93□□□□□ -1.94
TAF3Q12297 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt2.93□□□□□ -1.94
TAF3Q12297 TIM12YBR091C 330 nt2.93□□□□□ -1.94
TAF3Q12297 ESL1YIL151C 3357 nt2.93□□□□□ -1.94
TAF3Q12297 MET5YJR137C 4329 nt2.93□□□□□ -1.94
TAF3Q12297 SSY1YDR160W 2559 nt2.93□□□□□ -1.94
TAF3Q12297 SOK1YDR006C 2706 nt2.92□□□□□ -1.94
TAF3Q12297 MSB2YGR014W 3921 nt2.92□□□□□ -1.94
TAF3Q12297 NET1YJL076W 3570 nt2.92□□□□□ -1.94
TAF3Q12297 YGL149WYGL149W 306 nt2.92□□□□□ -1.94
TAF3Q12297 CAF120YNL278W 3183 nt2.92□□□□□ -1.94
TAF3Q12297 TPS2YDR074W 2691 nt2.91□□□□□ -1.94
TAF3Q12297 MET6YER091C 2304 nt2.91□□□□□ -1.94
TAF3Q12297 FLO11YIR019C 4104 nt2.91□□□□□ -1.94
TAF3Q12297 YDR210W-BYDR210W-B 5313 nt2.91□□□□□ -1.94
TAF3Q12297 YDR261W-BYDR261W-B 5313 nt2.91□□□□□ -1.94
TAF3Q12297 YFL002W-AYFL002W-A 5313 nt2.91□□□□□ -1.94
TAF3Q12297 YGR161W-BYGR161W-B 5313 nt2.91□□□□□ -1.94
TAF3Q12297 YLR410W-BYLR410W-B 5313 nt2.91□□□□□ -1.94
TAF3Q12297 YCL019WYCL019W 5313 nt2.91□□□□□ -1.94
TAF3Q12297 BIT61YJL058C 1632 nt2.91□□□□□ -1.94
TAF3Q12297 YGR069WYGR069W 336 nt2.91□□□□□ -1.94
TAF3Q12297 YHL005CYHL005C 393 nt2.91□□□□□ -1.94
TAF3Q12297 RPL20AYMR242C 519 nt2.91□□□□□ -1.94
TAF3Q12297 SKT5YBL061C 2091 nt2.91□□□□□ -1.94
TAF3Q12297 NTO1YPR031W 2247 nt2.91□□□□□ -1.94
TAF3Q12297 ATP15YPL271W 189 nt2.9□□□□□ -1.95
TAF3Q12297 NAN1YPL126W 2691 nt2.9□□□□□ -1.95
TAF3Q12297 PRK1YIL095W 2433 nt2.9□□□□□ -1.95
TAF3Q12297 RKM1YPL208W 1752 nt2.89□□□□□ -1.95
TAF3Q12297 ECM21YBL101C 3354 nt2.89□□□□□ -1.95
TAF3Q12297 PSY2YNL201C 2577 nt2.89□□□□□ -1.95
TAF3Q12297 CDC36YDL165W 576 nt2.89□□□□□ -1.95
TAF3Q12297 ADK1YDR226W 669 nt2.89□□□□□ -1.95
TAF3Q12297 DAD4YDR320C-A 219 nt2.89□□□□□ -1.95
TAF3Q12297 YOR050CYOR050C 348 nt2.89□□□□□ -1.95
TAF3Q12297 TLC1TLC1 1301 nt2.89□□□□□ -1.95
TAF3Q12297 YIL169CYIL169C 2988 nt2.88□□□□□ -1.95
TAF3Q12297 SAP1YER047C 2694 nt2.88□□□□□ -1.95
TAF3Q12297 YOR296WYOR296W 3870 nt2.88□□□□□ -1.95
TAF3Q12297 MOT1YPL082C 5604 nt2.88□□□□□ -1.95
TAF3Q12297 VPS41YDR080W 2979 nt2.88□□□□□ -1.95
TAF3Q12297 HPA3YEL066W 540 nt2.88□□□□□ -1.95
TAF3Q12297 AST2YER101C 1293 nt2.88□□□□□ -1.95
TAF3Q12297 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt2.88□□□□□ -1.95
TAF3Q12297 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt2.88□□□□□ -1.95
TAF3Q12297 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt2.88□□□□□ -1.95
TAF3Q12297 tK(UUU)KtK(UUU)K 73 nt2.88□□□□□ -1.95
TAF3Q12297 tK(UUU)LtK(UUU)L 73 nt2.88□□□□□ -1.95
TAF3Q12297 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt2.88□□□□□ -1.95
TAF3Q12297 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt2.88□□□□□ -1.95
TAF3Q12297 YGL041CYGL041C 204 nt2.88□□□□□ -1.95
TAF3Q12297 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt2.88□□□□□ -1.95
TAF3Q12297 YJL016WYJL016W 1686 nt2.88□□□□□ -1.95
TAF3Q12297 MSS11YMR164C 2277 nt2.88□□□□□ -1.95
TAF3Q12297 DSE4YNR067C 3354 nt2.87□□□□□ -1.95
TAF3Q12297 REV1YOR346W 2958 nt2.87□□□□□ -1.95
TAF3Q12297 YNL034WYNL034W 1839 nt2.87□□□□□ -1.95
TAF3Q12297 RIF1YBR275C 5751 nt2.87□□□□□ -1.95
TAF3Q12297 WIP1YDR374W-A 270 nt2.87□□□□□ -1.95
TAF3Q12297 AKR1YDR264C 2295 nt2.87□□□□□ -1.95
TAF3Q12297 TFB1YDR311W 1929 nt2.87□□□□□ -1.95
TAF3Q12297 HEH2YDR458C 1992 nt2.87□□□□□ -1.95
TAF3Q12297 YCK3YER123W 1575 nt2.87□□□□□ -1.95
TAF3Q12297 YGR067CYGR067C 2415 nt2.87□□□□□ -1.95
TAF3Q12297 NFT1YKR103W 3657 nt2.86□□□□□ -1.95
TAF3Q12297 YPL216WYPL216W 3309 nt2.86□□□□□ -1.95
TAF3Q12297 RPL35AYDL191W 363 nt2.86□□□□□ -1.95
TAF3Q12297 YDR209CYDR209C 414 nt2.86□□□□□ -1.95
TAF3Q12297 COX23YHR116W 456 nt2.86□□□□□ -1.95
TAF3Q12297 YLR458WYLR458W 381 nt2.86□□□□□ -1.95
TAF3Q12297 HCH1YNL281W 462 nt2.86□□□□□ -1.95
TAF3Q12297 GYP7YDL234C 2241 nt2.86□□□□□ -1.95
TAF3Q12297 UTP14YML093W 2700 nt2.86□□□□□ -1.95
TAF3Q12297 VPS52YDR484W 1926 nt2.85□□□□□ -1.95
TAF3Q12297 RTT10YPL183C 3042 nt2.85□□□□□ -1.95
TAF3Q12297 STE23YLR389C 3084 nt2.85□□□□□ -1.95
TAF3Q12297 ECM5YMR176W 4236 nt2.85□□□□□ -1.95
TAF3Q12297 NPR1YNL183C 2373 nt2.85□□□□□ -1.95
TAF3Q12297 LEU3YLR451W 2661 nt2.85□□□□□ -1.95
TAF3Q12297 YDL011CYDL011C 324 nt2.85□□□□□ -1.95
TAF3Q12297 RPS22AYJL190C 393 nt2.85□□□□□ -1.95
TAF3Q12297 NCE101YJL205C 162 nt2.85□□□□□ -1.95
TAF3Q12297 TAR1YLR154W-C 375 nt2.85□□□□□ -1.95
TAF3Q12297 RPL6AYML073C 531 nt2.85□□□□□ -1.95
TAF3Q12297 SIP3YNL257C 3690 nt2.85□□□□□ -1.95
TAF3Q12297 PAC1YOR269W 1485 nt2.84□□□□□ -1.95
TAF3Q12297 YDL211CYDL211C 1119 nt2.84□□□□□ -1.95
TAF3Q12297 YDR344CYDR344C 444 nt2.84□□□□□ -1.95
TAF3Q12297 RPS24AYER074W 408 nt2.84□□□□□ -1.95
TAF3Q12297 GPI14YJR013W 1212 nt2.84□□□□□ -1.95
TAF3Q12297 SMA2YML066C 1110 nt2.84□□□□□ -1.95
TAF3Q12297 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt2.84□□□□□ -1.95
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