Protein–RNA interactions for Protein: Q12211

PUS1, tRNA pseudouridine synthase 1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 544 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUS1Q12211 SIN4YNL236W 2925 nt3.92□□□□□ -1.78
PUS1Q12211 YBR259WYBR259W 2067 nt3.92□□□□□ -1.78
PUS1Q12211 RPL6AYML073C 531 nt3.92□□□□□ -1.78
PUS1Q12211 RPL32YBL092W 393 nt3.92□□□□□ -1.78
PUS1Q12211 GLC3YEL011W 2115 nt3.92□□□□□ -1.78
PUS1Q12211 SPA2YLL021W 4401 nt3.92□□□□□ -1.78
PUS1Q12211 ICR1ICR1 3199 nt3.91□□□□□ -1.78
PUS1Q12211 snR68snR68 136 nt3.91□□□□□ -1.78
PUS1Q12211 YDL242WYDL242W 354 nt3.91□□□□□ -1.78
PUS1Q12211 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt3.91□□□□□ -1.78
PUS1Q12211 VPS53YJL029C 2469 nt3.91□□□□□ -1.78
PUS1Q12211 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt3.91□□□□□ -1.78
PUS1Q12211 RPN2YIL075C 2838 nt3.91□□□□□ -1.78
PUS1Q12211 OAF3YKR064W 2592 nt3.91□□□□□ -1.78
PUS1Q12211 GPI13YLL031C 3054 nt3.91□□□□□ -1.78
PUS1Q12211 NAN1YPL126W 2691 nt3.9□□□□□ -1.78
PUS1Q12211 SYO1YDL063C 1863 nt3.9□□□□□ -1.78
PUS1Q12211 ISM1YPL040C 3009 nt3.9□□□□□ -1.78
PUS1Q12211 TIM13YGR181W 318 nt3.9□□□□□ -1.79
PUS1Q12211 CSE2YNR010W 450 nt3.9□□□□□ -1.79
PUS1Q12211 YOL019W-AYOL019W-A 153 nt3.9□□□□□ -1.79
PUS1Q12211 YOL085W-AYOL085W-A 213 nt3.9□□□□□ -1.79
PUS1Q12211 DNM1YLL001W 2274 nt3.9□□□□□ -1.79
PUS1Q12211 PFK26YIL107C 2484 nt3.89□□□□□ -1.79
PUS1Q12211 HDA3YPR179C 1968 nt3.89□□□□□ -1.79
PUS1Q12211 CAF130YGR134W 3369 nt3.89□□□□□ -1.79
PUS1Q12211 FAT1YBR041W 2010 nt3.89□□□□□ -1.79
PUS1Q12211 ARF1YDL192W 546 nt3.89□□□□□ -1.79
PUS1Q12211 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt3.89□□□□□ -1.79
PUS1Q12211 YKL111CYKL111C 336 nt3.89□□□□□ -1.79
PUS1Q12211 RPL36AYMR194W 303 nt3.89□□□□□ -1.79
PUS1Q12211 YBR277CYBR277C 402 nt3.89□□□□□ -1.79
PUS1Q12211 RDS1YCR106W 2499 nt3.89□□□□□ -1.79
PUS1Q12211 PHO81YGR233C 3537 nt3.89□□□□□ -1.79
PUS1Q12211 SSP1YHR184W 1716 nt3.89□□□□□ -1.79
PUS1Q12211 DAN4YJR151C 3486 nt3.89□□□□□ -1.79
PUS1Q12211 KAP95YLR347C 2586 nt3.88□□□□□ -1.79
PUS1Q12211 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt3.88□□□□□ -1.79
PUS1Q12211 YHR212CYHR212C 336 nt3.88□□□□□ -1.79
PUS1Q12211 tV(CAC)DtV(CAC)D 73 nt3.88□□□□□ -1.79
PUS1Q12211 tV(CAC)HtV(CAC)H 73 nt3.88□□□□□ -1.79
PUS1Q12211 YAR060CYAR060C 336 nt3.88□□□□□ -1.79
PUS1Q12211 GOT1YMR292W 417 nt3.88□□□□□ -1.79
PUS1Q12211 HHT1YBR010W 411 nt3.88□□□□□ -1.79
PUS1Q12211 CCM1YGR150C 2595 nt3.88□□□□□ -1.79
PUS1Q12211 JEN1YKL217W 1851 nt3.88□□□□□ -1.79
PUS1Q12211 SSQ1YLR369W 1974 nt3.87□□□□□ -1.79
PUS1Q12211 BMS1YPL217C 3552 nt3.87□□□□□ -1.79
PUS1Q12211 TMA108YIL137C 2841 nt3.87□□□□□ -1.79
PUS1Q12211 PEX1YKL197C 3132 nt3.87□□□□□ -1.79
PUS1Q12211 PMP1YCR024C-A 123 nt3.87□□□□□ -1.79
PUS1Q12211 RPL33BYOR234C 324 nt3.87□□□□□ -1.79
PUS1Q12211 FAS1YKL182W 6156 nt3.87□□□□□ -1.79
PUS1Q12211 SLA1YBL007C 3735 nt3.86□□□□□ -1.79
PUS1Q12211 TAF1YGR274C 3201 nt3.86□□□□□ -1.79
PUS1Q12211 CDC45YLR103C 1953 nt3.86□□□□□ -1.79
PUS1Q12211 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt3.86□□□□□ -1.79
PUS1Q12211 RPL16BYNL069C 597 nt3.86□□□□□ -1.79
PUS1Q12211 RPS7AYOR096W 573 nt3.86□□□□□ -1.79
PUS1Q12211 YBR099CYBR099C 384 nt3.86□□□□□ -1.79
PUS1Q12211 SEA4YBL104C 3117 nt3.86□□□□□ -1.79
PUS1Q12211 YGR027W-BYGR027W-B 5268 nt3.86□□□□□ -1.79
PUS1Q12211 YLR227W-BYLR227W-B 5268 nt3.86□□□□□ -1.79
PUS1Q12211 YPR158C-DYPR158C-D 5268 nt3.86□□□□□ -1.79
PUS1Q12211 CPA2YJR109C 3357 nt3.86□□□□□ -1.79
PUS1Q12211 KEL2YGR238C 2649 nt3.86□□□□□ -1.79
PUS1Q12211 YDR338CYDR338C 2088 nt3.85□□□□□ -1.79
PUS1Q12211 SSM4YIL030C 3960 nt3.85□□□□□ -1.79
PUS1Q12211 YDR089WYDR089W 2610 nt3.85□□□□□ -1.79
PUS1Q12211 GSC2YGR032W 5688 nt3.85□□□□□ -1.79
PUS1Q12211 snR74snR74 88 nt3.85□□□□□ -1.79
PUS1Q12211 YER091C-AYER091C-A 222 nt3.85□□□□□ -1.79
PUS1Q12211 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt3.85□□□□□ -1.79
PUS1Q12211 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt3.85□□□□□ -1.79
PUS1Q12211 SEC5YDR166C 2916 nt3.85□□□□□ -1.79
PUS1Q12211 MDM32YOR147W 1869 nt3.85□□□□□ -1.79
PUS1Q12211 FLO9YAL063C 3969 nt3.85□□□□□ -1.79
PUS1Q12211 VPS41YDR080W 2979 nt3.84□□□□□ -1.79
PUS1Q12211 YJL022WYJL022W 309 nt3.84□□□□□ -1.79
PUS1Q12211 YKR033CYKR033C 426 nt3.84□□□□□ -1.79
PUS1Q12211 ENA5YDR038C 3276 nt3.84□□□□□ -1.79
PUS1Q12211 ENA2YDR039C 3276 nt3.84□□□□□ -1.79
PUS1Q12211 ENA1YDR040C 3276 nt3.84□□□□□ -1.79
PUS1Q12211 YPR022CYPR022C 3402 nt3.84□□□□□ -1.8
PUS1Q12211 NUP60YAR002W 1620 nt3.84□□□□□ -1.8
PUS1Q12211 JJJ2YJL162C 1752 nt3.84□□□□□ -1.8
PUS1Q12211 FRE4YNR060W 2160 nt3.83□□□□□ -1.8
PUS1Q12211 YGR250CYGR250C 2346 nt3.83□□□□□ -1.8
PUS1Q12211 PSP1YDR505C 2526 nt3.83□□□□□ -1.8
PUS1Q12211 REV1YOR346W 2958 nt3.83□□□□□ -1.8
PUS1Q12211 YDR250CYDR250C 276 nt3.83□□□□□ -1.8
PUS1Q12211 SGF11YPL047W 300 nt3.83□□□□□ -1.8
PUS1Q12211 AIM9YER080W 1884 nt3.83□□□□□ -1.8
PUS1Q12211 DPB11YJL090C 2295 nt3.83□□□□□ -1.8
PUS1Q12211 SPB1YCL054W 2526 nt3.83□□□□□ -1.8
PUS1Q12211 HUL5YGL141W 2733 nt3.83□□□□□ -1.8
PUS1Q12211 SMC3YJL074C 3693 nt3.83□□□□□ -1.8
PUS1Q12211 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt3.82□□□□□ -1.8
PUS1Q12211 YGR051CYGR051C 324 nt3.82□□□□□ -1.8
PUS1Q12211 TMA19YKL056C 504 nt3.82□□□□□ -1.8
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