Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0R6

Itsn2, Intersectin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,659 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itsn2Q9Z0R6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Itsn2Q9Z0R6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
Itsn2Q9Z0R6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Itsn2Q9Z0R6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Itsn2Q9Z0R6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Itsn2Q9Z0R6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Itsn2Q9Z0R6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Itsn2Q9Z0R6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Itsn2Q9Z0R6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Itsn2Q9Z0R6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Itsn2Q9Z0R6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Itsn2Q9Z0R6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Itsn2Q9Z0R6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Itsn2Q9Z0R6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Itsn2Q9Z0R6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Itsn2Q9Z0R6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
Itsn2Q9Z0R6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Itsn2Q9Z0R6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Itsn2Q9Z0R6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Itsn2Q9Z0R6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Itsn2Q9Z0R6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Itsn2Q9Z0R6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Itsn2Q9Z0R6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Itsn2Q9Z0R6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Itsn2Q9Z0R6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Itsn2Q9Z0R6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Itsn2Q9Z0R6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Itsn2Q9Z0R6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Itsn2Q9Z0R6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Itsn2Q9Z0R6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
Itsn2Q9Z0R6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
Itsn2Q9Z0R6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Itsn2Q9Z0R6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Itsn2Q9Z0R6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Itsn2Q9Z0R6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Itsn2Q9Z0R6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Itsn2Q9Z0R6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Itsn2Q9Z0R6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Itsn2Q9Z0R6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Itsn2Q9Z0R6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Itsn2Q9Z0R6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Itsn2Q9Z0R6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Itsn2Q9Z0R6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Itsn2Q9Z0R6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Itsn2Q9Z0R6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Itsn2Q9Z0R6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Itsn2Q9Z0R6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Itsn2Q9Z0R6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Itsn2Q9Z0R6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Itsn2Q9Z0R6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Itsn2Q9Z0R6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Itsn2Q9Z0R6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Itsn2Q9Z0R6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Itsn2Q9Z0R6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Itsn2Q9Z0R6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Itsn2Q9Z0R6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Itsn2Q9Z0R6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Itsn2Q9Z0R6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Itsn2Q9Z0R6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Itsn2Q9Z0R6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Itsn2Q9Z0R6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Itsn2Q9Z0R6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Itsn2Q9Z0R6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Itsn2Q9Z0R6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Itsn2Q9Z0R6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Itsn2Q9Z0R6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Itsn2Q9Z0R6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Itsn2Q9Z0R6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Itsn2Q9Z0R6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Itsn2Q9Z0R6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Itsn2Q9Z0R6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Itsn2Q9Z0R6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Itsn2Q9Z0R6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Itsn2Q9Z0R6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Itsn2Q9Z0R6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Itsn2Q9Z0R6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Itsn2Q9Z0R6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Itsn2Q9Z0R6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Itsn2Q9Z0R6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Itsn2Q9Z0R6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Itsn2Q9Z0R6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Itsn2Q9Z0R6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Itsn2Q9Z0R6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Itsn2Q9Z0R6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Itsn2Q9Z0R6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Itsn2Q9Z0R6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Itsn2Q9Z0R6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Itsn2Q9Z0R6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Itsn2Q9Z0R6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Itsn2Q9Z0R6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Itsn2Q9Z0R6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Itsn2Q9Z0R6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Itsn2Q9Z0R6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Itsn2Q9Z0R6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Itsn2Q9Z0R6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Itsn2Q9Z0R6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Itsn2Q9Z0R6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Itsn2Q9Z0R6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Itsn2Q9Z0R6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Itsn2Q9Z0R6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 146.7 ms