Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD5

Chml, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmlQ9QZD5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ChmlQ9QZD5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ChmlQ9QZD5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ChmlQ9QZD5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ChmlQ9QZD5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ChmlQ9QZD5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ChmlQ9QZD5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ChmlQ9QZD5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ChmlQ9QZD5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ChmlQ9QZD5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ChmlQ9QZD5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ChmlQ9QZD5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ChmlQ9QZD5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ChmlQ9QZD5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ChmlQ9QZD5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ChmlQ9QZD5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ChmlQ9QZD5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ChmlQ9QZD5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ChmlQ9QZD5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ChmlQ9QZD5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ChmlQ9QZD5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ChmlQ9QZD5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ChmlQ9QZD5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ChmlQ9QZD5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ChmlQ9QZD5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ChmlQ9QZD5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ChmlQ9QZD5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ChmlQ9QZD5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ChmlQ9QZD5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ChmlQ9QZD5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ChmlQ9QZD5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ChmlQ9QZD5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ChmlQ9QZD5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ChmlQ9QZD5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ChmlQ9QZD5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ChmlQ9QZD5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ChmlQ9QZD5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ChmlQ9QZD5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ChmlQ9QZD5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ChmlQ9QZD5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ChmlQ9QZD5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ChmlQ9QZD5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ChmlQ9QZD5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ChmlQ9QZD5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ChmlQ9QZD5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ChmlQ9QZD5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ChmlQ9QZD5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ChmlQ9QZD5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ChmlQ9QZD5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ChmlQ9QZD5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ChmlQ9QZD5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ChmlQ9QZD5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ChmlQ9QZD5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ChmlQ9QZD5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ChmlQ9QZD5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ChmlQ9QZD5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ChmlQ9QZD5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ChmlQ9QZD5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ChmlQ9QZD5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ChmlQ9QZD5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ChmlQ9QZD5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ChmlQ9QZD5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ChmlQ9QZD5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ChmlQ9QZD5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ChmlQ9QZD5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ChmlQ9QZD5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ChmlQ9QZD5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ChmlQ9QZD5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ChmlQ9QZD5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ChmlQ9QZD5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ChmlQ9QZD5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ChmlQ9QZD5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ChmlQ9QZD5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ChmlQ9QZD5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ChmlQ9QZD5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ChmlQ9QZD5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ChmlQ9QZD5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ChmlQ9QZD5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ChmlQ9QZD5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ChmlQ9QZD5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ChmlQ9QZD5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ChmlQ9QZD5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ChmlQ9QZD5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ChmlQ9QZD5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ChmlQ9QZD5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ChmlQ9QZD5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ChmlQ9QZD5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ChmlQ9QZD5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ChmlQ9QZD5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ChmlQ9QZD5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ChmlQ9QZD5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ChmlQ9QZD5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ChmlQ9QZD5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ChmlQ9QZD5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ChmlQ9QZD5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ChmlQ9QZD5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ChmlQ9QZD5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ChmlQ9QZD5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ChmlQ9QZD5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ChmlQ9QZD5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms