Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD5

Chml, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmlQ9QZD5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
ChmlQ9QZD5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
ChmlQ9QZD5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
ChmlQ9QZD5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
ChmlQ9QZD5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
ChmlQ9QZD5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
ChmlQ9QZD5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
ChmlQ9QZD5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
ChmlQ9QZD5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
ChmlQ9QZD5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
ChmlQ9QZD5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
ChmlQ9QZD5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
ChmlQ9QZD5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
ChmlQ9QZD5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ChmlQ9QZD5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
ChmlQ9QZD5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
ChmlQ9QZD5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ChmlQ9QZD5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ChmlQ9QZD5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
ChmlQ9QZD5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ChmlQ9QZD5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ChmlQ9QZD5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ChmlQ9QZD5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ChmlQ9QZD5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ChmlQ9QZD5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
ChmlQ9QZD5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
ChmlQ9QZD5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ChmlQ9QZD5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ChmlQ9QZD5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ChmlQ9QZD5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ChmlQ9QZD5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ChmlQ9QZD5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ChmlQ9QZD5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
ChmlQ9QZD5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ChmlQ9QZD5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ChmlQ9QZD5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ChmlQ9QZD5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ChmlQ9QZD5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
ChmlQ9QZD5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ChmlQ9QZD5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ChmlQ9QZD5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ChmlQ9QZD5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
ChmlQ9QZD5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ChmlQ9QZD5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ChmlQ9QZD5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ChmlQ9QZD5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ChmlQ9QZD5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
ChmlQ9QZD5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ChmlQ9QZD5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ChmlQ9QZD5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ChmlQ9QZD5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ChmlQ9QZD5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ChmlQ9QZD5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
ChmlQ9QZD5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ChmlQ9QZD5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ChmlQ9QZD5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ChmlQ9QZD5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ChmlQ9QZD5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ChmlQ9QZD5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ChmlQ9QZD5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ChmlQ9QZD5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ChmlQ9QZD5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ChmlQ9QZD5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ChmlQ9QZD5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ChmlQ9QZD5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ChmlQ9QZD5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ChmlQ9QZD5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
ChmlQ9QZD5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ChmlQ9QZD5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ChmlQ9QZD5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ChmlQ9QZD5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ChmlQ9QZD5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ChmlQ9QZD5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ChmlQ9QZD5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ChmlQ9QZD5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ChmlQ9QZD5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ChmlQ9QZD5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ChmlQ9QZD5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ChmlQ9QZD5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ChmlQ9QZD5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ChmlQ9QZD5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ChmlQ9QZD5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ChmlQ9QZD5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ChmlQ9QZD5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ChmlQ9QZD5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ChmlQ9QZD5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ChmlQ9QZD5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ChmlQ9QZD5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
ChmlQ9QZD5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ChmlQ9QZD5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ChmlQ9QZD5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ChmlQ9QZD5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ChmlQ9QZD5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ChmlQ9QZD5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ChmlQ9QZD5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ChmlQ9QZD5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ChmlQ9QZD5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ChmlQ9QZD5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ChmlQ9QZD5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ChmlQ9QZD5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 187.3 ms