Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim12aQ99PQ1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim12aQ99PQ1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim12aQ99PQ1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim12aQ99PQ1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim12aQ99PQ1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim12aQ99PQ1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim12aQ99PQ1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim12aQ99PQ1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim12aQ99PQ1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim12aQ99PQ1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim12aQ99PQ1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim12aQ99PQ1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim12aQ99PQ1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Trim12aQ99PQ1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim12aQ99PQ1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim12aQ99PQ1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim12aQ99PQ1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim12aQ99PQ1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim12aQ99PQ1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim12aQ99PQ1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim12aQ99PQ1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim12aQ99PQ1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim12aQ99PQ1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim12aQ99PQ1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim12aQ99PQ1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim12aQ99PQ1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim12aQ99PQ1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim12aQ99PQ1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim12aQ99PQ1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim12aQ99PQ1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim12aQ99PQ1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim12aQ99PQ1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim12aQ99PQ1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim12aQ99PQ1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim12aQ99PQ1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim12aQ99PQ1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim12aQ99PQ1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim12aQ99PQ1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim12aQ99PQ1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim12aQ99PQ1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim12aQ99PQ1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim12aQ99PQ1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim12aQ99PQ1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim12aQ99PQ1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim12aQ99PQ1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim12aQ99PQ1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim12aQ99PQ1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim12aQ99PQ1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim12aQ99PQ1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim12aQ99PQ1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim12aQ99PQ1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim12aQ99PQ1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim12aQ99PQ1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim12aQ99PQ1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim12aQ99PQ1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim12aQ99PQ1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim12aQ99PQ1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim12aQ99PQ1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim12aQ99PQ1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim12aQ99PQ1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim12aQ99PQ1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim12aQ99PQ1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim12aQ99PQ1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim12aQ99PQ1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim12aQ99PQ1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim12aQ99PQ1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim12aQ99PQ1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim12aQ99PQ1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim12aQ99PQ1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim12aQ99PQ1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim12aQ99PQ1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Trim12aQ99PQ1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim12aQ99PQ1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim12aQ99PQ1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim12aQ99PQ1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim12aQ99PQ1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim12aQ99PQ1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim12aQ99PQ1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim12aQ99PQ1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim12aQ99PQ1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim12aQ99PQ1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim12aQ99PQ1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim12aQ99PQ1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim12aQ99PQ1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim12aQ99PQ1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim12aQ99PQ1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim12aQ99PQ1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim12aQ99PQ1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trim12aQ99PQ1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim12aQ99PQ1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim12aQ99PQ1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim12aQ99PQ1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim12aQ99PQ1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim12aQ99PQ1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim12aQ99PQ1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim12aQ99PQ1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim12aQ99PQ1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim12aQ99PQ1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim12aQ99PQ1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
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