Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZA1

Cdk13, Cyclin-dependent kinase 13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk13Q69ZA1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Cdk13Q69ZA1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Cdk13Q69ZA1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Cdk13Q69ZA1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
Cdk13Q69ZA1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Cdk13Q69ZA1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Cdk13Q69ZA1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
Cdk13Q69ZA1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Cdk13Q69ZA1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Cdk13Q69ZA1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Cdk13Q69ZA1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Cdk13Q69ZA1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Cdk13Q69ZA1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Cdk13Q69ZA1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Cdk13Q69ZA1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Cdk13Q69ZA1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.22
Cdk13Q69ZA1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Cdk13Q69ZA1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Cdk13Q69ZA1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Cdk13Q69ZA1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Cdk13Q69ZA1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Cdk13Q69ZA1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
Cdk13Q69ZA1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
Cdk13Q69ZA1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Cdk13Q69ZA1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Cdk13Q69ZA1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Cdk13Q69ZA1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Cdk13Q69ZA1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Cdk13Q69ZA1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Cdk13Q69ZA1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Cdk13Q69ZA1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Cdk13Q69ZA1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Cdk13Q69ZA1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Cdk13Q69ZA1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Cdk13Q69ZA1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Cdk13Q69ZA1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Cdk13Q69ZA1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Cdk13Q69ZA1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Cdk13Q69ZA1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Cdk13Q69ZA1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Cdk13Q69ZA1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Cdk13Q69ZA1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Cdk13Q69ZA1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
Cdk13Q69ZA1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Cdk13Q69ZA1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Cdk13Q69ZA1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Cdk13Q69ZA1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Cdk13Q69ZA1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Cdk13Q69ZA1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Cdk13Q69ZA1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Cdk13Q69ZA1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Cdk13Q69ZA1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC34.95■■■■□ 3.19
Cdk13Q69ZA1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Cdk13Q69ZA1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Cdk13Q69ZA1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Cdk13Q69ZA1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
Cdk13Q69ZA1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Cdk13Q69ZA1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Cdk13Q69ZA1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Cdk13Q69ZA1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Cdk13Q69ZA1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Cdk13Q69ZA1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Cdk13Q69ZA1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Cdk13Q69ZA1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Cdk13Q69ZA1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
Cdk13Q69ZA1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Cdk13Q69ZA1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Cdk13Q69ZA1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Cdk13Q69ZA1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Cdk13Q69ZA1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Cdk13Q69ZA1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Cdk13Q69ZA1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Cdk13Q69ZA1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Cdk13Q69ZA1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.76■■■■□ 3.16
Cdk13Q69ZA1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Cdk13Q69ZA1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Cdk13Q69ZA1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Cdk13Q69ZA1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Cdk13Q69ZA1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Cdk13Q69ZA1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Cdk13Q69ZA1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Cdk13Q69ZA1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Cdk13Q69ZA1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Cdk13Q69ZA1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.14
Cdk13Q69ZA1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Cdk13Q69ZA1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Cdk13Q69ZA1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Cdk13Q69ZA1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Cdk13Q69ZA1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Cdk13Q69ZA1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Cdk13Q69ZA1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Cdk13Q69ZA1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Cdk13Q69ZA1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Cdk13Q69ZA1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Cdk13Q69ZA1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Cdk13Q69ZA1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Cdk13Q69ZA1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Cdk13Q69ZA1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Cdk13Q69ZA1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Cdk13Q69ZA1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 235.5 ms