Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rnpc3Q3UZ01 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rnpc3Q3UZ01 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rnpc3Q3UZ01 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rnpc3Q3UZ01 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rnpc3Q3UZ01 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rnpc3Q3UZ01 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rnpc3Q3UZ01 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rnpc3Q3UZ01 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rnpc3Q3UZ01 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rnpc3Q3UZ01 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rnpc3Q3UZ01 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rnpc3Q3UZ01 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rnpc3Q3UZ01 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rnpc3Q3UZ01 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rnpc3Q3UZ01 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rnpc3Q3UZ01 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rnpc3Q3UZ01 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rnpc3Q3UZ01 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rnpc3Q3UZ01 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rnpc3Q3UZ01 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rnpc3Q3UZ01 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rnpc3Q3UZ01 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Rnpc3Q3UZ01 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rnpc3Q3UZ01 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Rnpc3Q3UZ01 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rnpc3Q3UZ01 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rnpc3Q3UZ01 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rnpc3Q3UZ01 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rnpc3Q3UZ01 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rnpc3Q3UZ01 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Rnpc3Q3UZ01 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rnpc3Q3UZ01 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rnpc3Q3UZ01 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rnpc3Q3UZ01 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rnpc3Q3UZ01 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rnpc3Q3UZ01 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rnpc3Q3UZ01 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rnpc3Q3UZ01 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rnpc3Q3UZ01 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rnpc3Q3UZ01 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rnpc3Q3UZ01 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rnpc3Q3UZ01 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rnpc3Q3UZ01 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Rnpc3Q3UZ01 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rnpc3Q3UZ01 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rnpc3Q3UZ01 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rnpc3Q3UZ01 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Rnpc3Q3UZ01 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Rnpc3Q3UZ01 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rnpc3Q3UZ01 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Rnpc3Q3UZ01 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Rnpc3Q3UZ01 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rnpc3Q3UZ01 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rnpc3Q3UZ01 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rnpc3Q3UZ01 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rnpc3Q3UZ01 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rnpc3Q3UZ01 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rnpc3Q3UZ01 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rnpc3Q3UZ01 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rnpc3Q3UZ01 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rnpc3Q3UZ01 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rnpc3Q3UZ01 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rnpc3Q3UZ01 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rnpc3Q3UZ01 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Rnpc3Q3UZ01 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Rnpc3Q3UZ01 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rnpc3Q3UZ01 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rnpc3Q3UZ01 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Rnpc3Q3UZ01 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rnpc3Q3UZ01 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rnpc3Q3UZ01 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rnpc3Q3UZ01 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rnpc3Q3UZ01 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rnpc3Q3UZ01 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rnpc3Q3UZ01 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rnpc3Q3UZ01 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rnpc3Q3UZ01 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rnpc3Q3UZ01 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rnpc3Q3UZ01 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rnpc3Q3UZ01 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rnpc3Q3UZ01 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rnpc3Q3UZ01 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rnpc3Q3UZ01 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rnpc3Q3UZ01 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rnpc3Q3UZ01 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rnpc3Q3UZ01 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rnpc3Q3UZ01 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rnpc3Q3UZ01 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rnpc3Q3UZ01 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rnpc3Q3UZ01 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rnpc3Q3UZ01 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rnpc3Q3UZ01 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Rnpc3Q3UZ01 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rnpc3Q3UZ01 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rnpc3Q3UZ01 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rnpc3Q3UZ01 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rnpc3Q3UZ01 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rnpc3Q3UZ01 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rnpc3Q3UZ01 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
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