Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0S6

Rasip1, Ras-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasip1Q3U0S6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rasip1Q3U0S6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rasip1Q3U0S6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rasip1Q3U0S6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rasip1Q3U0S6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
Rasip1Q3U0S6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Rasip1Q3U0S6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rasip1Q3U0S6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rasip1Q3U0S6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rasip1Q3U0S6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rasip1Q3U0S6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rasip1Q3U0S6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rasip1Q3U0S6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rasip1Q3U0S6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rasip1Q3U0S6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rasip1Q3U0S6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rasip1Q3U0S6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rasip1Q3U0S6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rasip1Q3U0S6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Rasip1Q3U0S6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rasip1Q3U0S6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rasip1Q3U0S6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rasip1Q3U0S6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rasip1Q3U0S6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Rasip1Q3U0S6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rasip1Q3U0S6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rasip1Q3U0S6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rasip1Q3U0S6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rasip1Q3U0S6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rasip1Q3U0S6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rasip1Q3U0S6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rasip1Q3U0S6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rasip1Q3U0S6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rasip1Q3U0S6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rasip1Q3U0S6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rasip1Q3U0S6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rasip1Q3U0S6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rasip1Q3U0S6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rasip1Q3U0S6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rasip1Q3U0S6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rasip1Q3U0S6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rasip1Q3U0S6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rasip1Q3U0S6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rasip1Q3U0S6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rasip1Q3U0S6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Rasip1Q3U0S6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rasip1Q3U0S6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Rasip1Q3U0S6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Rasip1Q3U0S6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Rasip1Q3U0S6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rasip1Q3U0S6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Rasip1Q3U0S6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rasip1Q3U0S6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rasip1Q3U0S6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Rasip1Q3U0S6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rasip1Q3U0S6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Rasip1Q3U0S6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rasip1Q3U0S6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rasip1Q3U0S6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Rasip1Q3U0S6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rasip1Q3U0S6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rasip1Q3U0S6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rasip1Q3U0S6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rasip1Q3U0S6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rasip1Q3U0S6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rasip1Q3U0S6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Rasip1Q3U0S6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Rasip1Q3U0S6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Rasip1Q3U0S6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rasip1Q3U0S6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rasip1Q3U0S6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rasip1Q3U0S6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rasip1Q3U0S6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rasip1Q3U0S6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rasip1Q3U0S6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rasip1Q3U0S6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rasip1Q3U0S6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rasip1Q3U0S6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rasip1Q3U0S6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rasip1Q3U0S6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rasip1Q3U0S6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rasip1Q3U0S6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rasip1Q3U0S6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rasip1Q3U0S6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rasip1Q3U0S6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rasip1Q3U0S6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rasip1Q3U0S6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rasip1Q3U0S6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rasip1Q3U0S6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rasip1Q3U0S6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rasip1Q3U0S6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rasip1Q3U0S6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rasip1Q3U0S6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rasip1Q3U0S6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rasip1Q3U0S6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rasip1Q3U0S6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rasip1Q3U0S6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rasip1Q3U0S6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rasip1Q3U0S6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rasip1Q3U0S6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms