Protein–RNA interactions for Protein: Q07105

Gdf9, Growth/differentiation factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf9Q07105 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gdf9Q07105 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gdf9Q07105 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gdf9Q07105 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Gdf9Q07105 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gdf9Q07105 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gdf9Q07105 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gdf9Q07105 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gdf9Q07105 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Gdf9Q07105 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gdf9Q07105 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gdf9Q07105 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gdf9Q07105 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gdf9Q07105 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gdf9Q07105 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Gdf9Q07105 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gdf9Q07105 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gdf9Q07105 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gdf9Q07105 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gdf9Q07105 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gdf9Q07105 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gdf9Q07105 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gdf9Q07105 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gdf9Q07105 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gdf9Q07105 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gdf9Q07105 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gdf9Q07105 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gdf9Q07105 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gdf9Q07105 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gdf9Q07105 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gdf9Q07105 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Gdf9Q07105 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gdf9Q07105 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gdf9Q07105 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gdf9Q07105 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gdf9Q07105 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gdf9Q07105 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gdf9Q07105 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gdf9Q07105 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gdf9Q07105 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gdf9Q07105 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gdf9Q07105 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gdf9Q07105 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gdf9Q07105 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gdf9Q07105 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gdf9Q07105 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gdf9Q07105 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gdf9Q07105 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gdf9Q07105 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gdf9Q07105 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gdf9Q07105 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Gdf9Q07105 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gdf9Q07105 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gdf9Q07105 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Gdf9Q07105 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gdf9Q07105 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gdf9Q07105 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gdf9Q07105 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gdf9Q07105 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gdf9Q07105 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gdf9Q07105 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gdf9Q07105 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gdf9Q07105 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gdf9Q07105 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Gdf9Q07105 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gdf9Q07105 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gdf9Q07105 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gdf9Q07105 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gdf9Q07105 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gdf9Q07105 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gdf9Q07105 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gdf9Q07105 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gdf9Q07105 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gdf9Q07105 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gdf9Q07105 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gdf9Q07105 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gdf9Q07105 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gdf9Q07105 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gdf9Q07105 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gdf9Q07105 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gdf9Q07105 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gdf9Q07105 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gdf9Q07105 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gdf9Q07105 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gdf9Q07105 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gdf9Q07105 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gdf9Q07105 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gdf9Q07105 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gdf9Q07105 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gdf9Q07105 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gdf9Q07105 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gdf9Q07105 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gdf9Q07105 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gdf9Q07105 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gdf9Q07105 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Gdf9Q07105 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gdf9Q07105 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gdf9Q07105 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gdf9Q07105 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gdf9Q07105 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms