Protein–RNA interactions for Protein: Q02863

UBP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, yeastyeast

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBP16Q02863 RDN25-2RDN25-2 3396 nt10.65□□□□□ -0.71
UBP16Q02863 YAT1YAR035W 2064 nt10.64□□□□□ -0.71
UBP16Q02863 CWC15YDR163W 528 nt10.63□□□□□ -0.71
UBP16Q02863 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt10.63□□□□□ -0.71
UBP16Q02863 LYS20YDL182W 1287 nt10.62□□□□□ -0.71
UBP16Q02863 IMO32YGR031W 1029 nt10.62□□□□□ -0.71
UBP16Q02863 SPS100YHR139C 981 nt10.62□□□□□ -0.71
UBP16Q02863 BUD20YLR074C 501 nt10.62□□□□□ -0.71
UBP16Q02863 SWM1YDR260C 513 nt10.58□□□□□ -0.72
UBP16Q02863 FLX1YIL134W 936 nt10.53□□□□□ -0.72
UBP16Q02863 SPE2YOL052C 1191 nt10.53□□□□□ -0.72
UBP16Q02863 ERG13YML126C 1476 nt10.52□□□□□ -0.73
UBP16Q02863 MCH5YOR306C 1566 nt10.51□□□□□ -0.73
UBP16Q02863 ADE8YDR408C 645 nt10.49□□□□□ -0.73
UBP16Q02863 ASP3-1YLR155C 1089 nt10.49□□□□□ -0.73
UBP16Q02863 ASP3-2YLR157C 1089 nt10.49□□□□□ -0.73
UBP16Q02863 ASP3-3YLR158C 1089 nt10.49□□□□□ -0.73
UBP16Q02863 ASP3-4YLR160C 1089 nt10.49□□□□□ -0.73
UBP16Q02863 ABZ2YMR289W 1125 nt10.49□□□□□ -0.73
UBP16Q02863 RPC82YPR190C 1965 nt10.48□□□□□ -0.73
UBP16Q02863 ADH3YMR083W 1128 nt10.48□□□□□ -0.73
UBP16Q02863 RRT8YOL048C 1029 nt10.48□□□□□ -0.73
UBP16Q02863 VPS62YGR141W 1404 nt10.48□□□□□ -0.73
UBP16Q02863 THP3YPR045C 1413 nt10.47□□□□□ -0.73
UBP16Q02863 PHB2YGR231C 933 nt10.46□□□□□ -0.73
UBP16Q02863 YOR325WYOR325W 474 nt10.46□□□□□ -0.73
UBP16Q02863 YMR007WYMR007W 381 nt10.44□□□□□ -0.74
UBP16Q02863 INA1YLR413W 2028 nt10.42□□□□□ -0.74
UBP16Q02863 SER2YGR208W 930 nt10.42□□□□□ -0.74
UBP16Q02863 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt10.42□□□□□ -0.74
UBP16Q02863 OPI3YJR073C 621 nt10.42□□□□□ -0.74
UBP16Q02863 AIM1YAL046C 357 nt10.42□□□□□ -0.74
UBP16Q02863 SAC7YDR389W 1965 nt10.42□□□□□ -0.74
UBP16Q02863 TVP23YDR084C 600 nt10.41□□□□□ -0.74
UBP16Q02863 MOB1YIL106W 945 nt10.41□□□□□ -0.74
UBP16Q02863 YDL086WYDL086W 822 nt10.39□□□□□ -0.75
UBP16Q02863 CCT2YIL142W 1584 nt10.37□□□□□ -0.75
UBP16Q02863 RCR1YBR005W 642 nt10.37□□□□□ -0.75
UBP16Q02863 YOR343CYOR343C 327 nt10.37□□□□□ -0.75
UBP16Q02863 PAU21YOR394W 495 nt10.37□□□□□ -0.75
UBP16Q02863 PAU22YPL282C 495 nt10.37□□□□□ -0.75
UBP16Q02863 TGA1tA(UGC)A 73 nt10.36□□□□□ -0.75
UBP16Q02863 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt10.36□□□□□ -0.75
UBP16Q02863 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt10.36□□□□□ -0.75
UBP16Q02863 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt10.36□□□□□ -0.75
UBP16Q02863 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt10.36□□□□□ -0.75
UBP16Q02863 TPC1YGR096W 945 nt10.36□□□□□ -0.75
UBP16Q02863 ENO2YHR174W 1314 nt10.35□□□□□ -0.75
UBP16Q02863 UME6YDR207C 2511 nt10.34□□□□□ -0.75
UBP16Q02863 CYC3YAL039C 810 nt10.34□□□□□ -0.75
UBP16Q02863 FSH2YMR222C 672 nt10.34□□□□□ -0.75
UBP16Q02863 BET2YPR176C 978 nt10.34□□□□□ -0.75
UBP16Q02863 LSB6YJL100W 1824 nt10.33□□□□□ -0.76
UBP16Q02863 PCP1YGR101W 1041 nt10.33□□□□□ -0.76
UBP16Q02863 HTS1YPR033C 1641 nt10.33□□□□□ -0.76
UBP16Q02863 FCY1YPR062W 477 nt10.31□□□□□ -0.76
UBP16Q02863 ILV3YJR016C 1758 nt10.31□□□□□ -0.76
UBP16Q02863 RPL12BYDR418W 498 nt10.3□□□□□ -0.76
UBP16Q02863 YKR012CYKR012C 378 nt10.3□□□□□ -0.76
UBP16Q02863 OPI10YOL032W 741 nt10.3□□□□□ -0.76
UBP16Q02863 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt10.29□□□□□ -0.76
UBP16Q02863 GRH1YDR517W 1119 nt10.28□□□□□ -0.76
UBP16Q02863 AMF1YOR378W 1548 nt10.27□□□□□ -0.77
UBP16Q02863 DIG1YPL049C 1359 nt10.26□□□□□ -0.77
UBP16Q02863 HRA1HRA1 564 nt10.26□□□□□ -0.77
UBP16Q02863 YGR210CYGR210C 1236 nt10.25□□□□□ -0.77
UBP16Q02863 ELO1YJL196C 933 nt10.25□□□□□ -0.77
UBP16Q02863 YNR064CYNR064C 873 nt10.25□□□□□ -0.77
UBP16Q02863 ITR2YOL103W 1830 nt10.22□□□□□ -0.77
UBP16Q02863 SPT20YOL148C 1815 nt10.22□□□□□ -0.77
UBP16Q02863 YLR046CYLR046C 813 nt10.22□□□□□ -0.77
UBP16Q02863 SFL1YOR140W 2301 nt10.21□□□□□ -0.77
UBP16Q02863 ENT4YLL038C 744 nt10.21□□□□□ -0.77
UBP16Q02863 ERO1YML130C 1692 nt10.21□□□□□ -0.78
UBP16Q02863 YLR280CYLR280C 351 nt10.2□□□□□ -0.78
UBP16Q02863 YOR268CYOR268C 399 nt10.2□□□□□ -0.78
UBP16Q02863 SDS24YBR214W 1584 nt10.2□□□□□ -0.78
UBP16Q02863 NAM8YHR086W 1572 nt10.19□□□□□ -0.78
UBP16Q02863 ARO8YGL202W 1503 nt10.19□□□□□ -0.78
UBP16Q02863 SRP102YKL154W 735 nt10.19□□□□□ -0.78
UBP16Q02863 EMC3YKL207W 762 nt10.19□□□□□ -0.78
UBP16Q02863 LEU2YCL018W 1095 nt10.19□□□□□ -0.78
UBP16Q02863 MUP1YGR055W 1725 nt10.18□□□□□ -0.78
UBP16Q02863 ENO1YGR254W 1314 nt10.17□□□□□ -0.78
UBP16Q02863 SWT21YNL187W 1074 nt10.17□□□□□ -0.78
UBP16Q02863 DLD3YEL071W 1491 nt10.16□□□□□ -0.78
UBP16Q02863 KAE1YKR038C 1161 nt10.15□□□□□ -0.78
UBP16Q02863 MFG1YDL233W 1377 nt10.14□□□□□ -0.79
UBP16Q02863 YJL160CYJL160C 864 nt10.13□□□□□ -0.79
UBP16Q02863 VBA3YCL069W 1377 nt10.13□□□□□ -0.79
UBP16Q02863 GID8YMR135C 1368 nt10.13□□□□□ -0.79
UBP16Q02863 SUV3YPL029W 2214 nt10.13□□□□□ -0.79
UBP16Q02863 MET1YKR069W 1782 nt10.12□□□□□ -0.79
UBP16Q02863 YKL053WYKL053W 375 nt10.12□□□□□ -0.79
UBP16Q02863 YHR219WYHR219W 1875 nt10.12□□□□□ -0.79
UBP16Q02863 YPL108WYPL108W 507 nt10.11□□□□□ -0.79
UBP16Q02863 KEL3YPL263C 1956 nt10.11□□□□□ -0.79
UBP16Q02863 LSR1LSR1 1175 nt10.1□□□□□ -0.79
UBP16Q02863 HOL1YNR055C 1761 nt10.1□□□□□ -0.79
UBP16Q02863 YMR210WYMR210W 1350 nt10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 92.7 ms