Protein–RNA interactions for Protein: P97386

Lig3, DNA ligase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig3P97386 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lig3P97386 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lig3P97386 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lig3P97386 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lig3P97386 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lig3P97386 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lig3P97386 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lig3P97386 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lig3P97386 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lig3P97386 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lig3P97386 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Lig3P97386 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lig3P97386 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lig3P97386 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lig3P97386 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lig3P97386 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lig3P97386 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lig3P97386 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lig3P97386 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lig3P97386 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lig3P97386 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lig3P97386 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lig3P97386 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lig3P97386 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lig3P97386 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Lig3P97386 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Lig3P97386 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lig3P97386 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Lig3P97386 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lig3P97386 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lig3P97386 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lig3P97386 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Lig3P97386 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lig3P97386 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lig3P97386 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lig3P97386 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lig3P97386 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lig3P97386 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lig3P97386 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lig3P97386 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lig3P97386 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Lig3P97386 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lig3P97386 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Lig3P97386 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Lig3P97386 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Lig3P97386 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Lig3P97386 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lig3P97386 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lig3P97386 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Lig3P97386 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Lig3P97386 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Lig3P97386 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Lig3P97386 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Lig3P97386 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lig3P97386 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lig3P97386 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lig3P97386 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Lig3P97386 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Lig3P97386 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Lig3P97386 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Lig3P97386 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lig3P97386 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lig3P97386 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lig3P97386 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lig3P97386 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lig3P97386 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lig3P97386 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lig3P97386 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lig3P97386 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lig3P97386 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lig3P97386 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lig3P97386 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Lig3P97386 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lig3P97386 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lig3P97386 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lig3P97386 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lig3P97386 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lig3P97386 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lig3P97386 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lig3P97386 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lig3P97386 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lig3P97386 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lig3P97386 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lig3P97386 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lig3P97386 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lig3P97386 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lig3P97386 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lig3P97386 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lig3P97386 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lig3P97386 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lig3P97386 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lig3P97386 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lig3P97386 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lig3P97386 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lig3P97386 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lig3P97386 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lig3P97386 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lig3P97386 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lig3P97386 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lig3P97386 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms