Protein–RNA interactions for Protein: P25037

UBP1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, yeastyeast

Predictions only

Length 809 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBP1P25037 OXA1YER154W 1209 nt11.13□□□□□ -0.63
UBP1P25037 PRM5YIL117C 957 nt11.13□□□□□ -0.63
UBP1P25037 GND2YGR256W 1479 nt11.12□□□□□ -0.63
UBP1P25037 EAF3YPR023C 1206 nt11.12□□□□□ -0.63
UBP1P25037 MRP1YDR347W 966 nt11.11□□□□□ -0.63
UBP1P25037 TMA23YMR269W 636 nt11.1□□□□□ -0.63
UBP1P25037 PRE5YMR314W 705 nt11.09□□□□□ -0.63
UBP1P25037 YER188WYER188W 720 nt11.08□□□□□ -0.64
UBP1P25037 FSH2YMR222C 672 nt11.08□□□□□ -0.64
UBP1P25037 BET2YPR176C 978 nt11.08□□□□□ -0.64
UBP1P25037 YPL247CYPL247C 1572 nt11.07□□□□□ -0.64
UBP1P25037 RSC8YFR037C 1674 nt11.07□□□□□ -0.64
UBP1P25037 DPS1YLL018C 1674 nt11.06□□□□□ -0.64
UBP1P25037 MOB1YIL106W 945 nt11.05□□□□□ -0.64
UBP1P25037 ADH3YMR083W 1128 nt11.05□□□□□ -0.64
UBP1P25037 REG2YBR050C 1017 nt11.05□□□□□ -0.64
UBP1P25037 BAP3YDR046C 1815 nt11.05□□□□□ -0.64
UBP1P25037 FUB1YCR076C 753 nt11.04□□□□□ -0.64
UBP1P25037 SPE2YOL052C 1191 nt11.04□□□□□ -0.64
UBP1P25037 IMO32YGR031W 1029 nt11.03□□□□□ -0.64
UBP1P25037 PHB2YGR231C 933 nt11.03□□□□□ -0.64
UBP1P25037 URA6YKL024C 615 nt11.03□□□□□ -0.64
UBP1P25037 KAE1YKR038C 1161 nt11.03□□□□□ -0.64
UBP1P25037 YKR005CYKR005C 1578 nt11.03□□□□□ -0.64
UBP1P25037 FCY1YPR062W 477 nt11.02□□□□□ -0.65
UBP1P25037 EMC3YKL207W 762 nt11□□□□□ -0.65
UBP1P25037 TGA1tA(UGC)A 73 nt10.99□□□□□ -0.65
UBP1P25037 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt10.99□□□□□ -0.65
UBP1P25037 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt10.99□□□□□ -0.65
UBP1P25037 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt10.99□□□□□ -0.65
UBP1P25037 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt10.99□□□□□ -0.65
UBP1P25037 ABZ2YMR289W 1125 nt10.99□□□□□ -0.65
UBP1P25037 PAM17YKR065C 594 nt10.98□□□□□ -0.65
UBP1P25037 NAR1YNL240C 1476 nt10.98□□□□□ -0.65
UBP1P25037 DDI1YER143W 1287 nt10.97□□□□□ -0.65
UBP1P25037 YGR210CYGR210C 1236 nt10.96□□□□□ -0.65
UBP1P25037 SRP102YKL154W 735 nt10.95□□□□□ -0.66
UBP1P25037 UFO1YML088W 2007 nt10.95□□□□□ -0.66
UBP1P25037 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt10.94□□□□□ -0.66
UBP1P25037 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt10.94□□□□□ -0.66
UBP1P25037 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt10.94□□□□□ -0.66
UBP1P25037 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt10.94□□□□□ -0.66
UBP1P25037 SUP51tL(UAA)J 84 nt10.94□□□□□ -0.66
UBP1P25037 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt10.94□□□□□ -0.66
UBP1P25037 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt10.94□□□□□ -0.66
UBP1P25037 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt10.94□□□□□ -0.66
UBP1P25037 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt10.92□□□□□ -0.66
UBP1P25037 RIM2YBR192W 1134 nt10.92□□□□□ -0.66
UBP1P25037 ZRT3YKL175W 1512 nt10.92□□□□□ -0.66
UBP1P25037 LSM5YER146W 282 nt10.91□□□□□ -0.66
UBP1P25037 GDH1YOR375C 1365 nt10.9□□□□□ -0.67
UBP1P25037 OSH7YHR001W 1314 nt10.89□□□□□ -0.67
UBP1P25037 SHY1YGR112W 1170 nt10.88□□□□□ -0.67
UBP1P25037 ERO1YML130C 1692 nt10.88□□□□□ -0.67
UBP1P25037 ADE8YDR408C 645 nt10.87□□□□□ -0.67
UBP1P25037 TVP23YDR084C 600 nt10.86□□□□□ -0.67
UBP1P25037 YJL160CYJL160C 864 nt10.86□□□□□ -0.67
UBP1P25037 PET8YNL003C 855 nt10.86□□□□□ -0.67
UBP1P25037 DIG1YPL049C 1359 nt10.86□□□□□ -0.67
UBP1P25037 RRT8YOL048C 1029 nt10.85□□□□□ -0.67
UBP1P25037 YMR210WYMR210W 1350 nt10.84□□□□□ -0.67
UBP1P25037 ARA2YMR041C 1008 nt10.83□□□□□ -0.68
UBP1P25037 YPL108WYPL108W 507 nt10.83□□□□□ -0.68
UBP1P25037 SOL2YCR073W-A 948 nt10.82□□□□□ -0.68
UBP1P25037 YKR012CYKR012C 378 nt10.82□□□□□ -0.68
UBP1P25037 YLR280CYLR280C 351 nt10.82□□□□□ -0.68
UBP1P25037 YBL095WYBL095W 813 nt10.82□□□□□ -0.68
UBP1P25037 SNF1YDR477W 1902 nt10.82□□□□□ -0.68
UBP1P25037 DLD2YDL178W 1593 nt10.81□□□□□ -0.68
UBP1P25037 ENO1YGR254W 1314 nt10.81□□□□□ -0.68
UBP1P25037 ENO2YHR174W 1314 nt10.81□□□□□ -0.68
UBP1P25037 ASP3-1YLR155C 1089 nt10.8□□□□□ -0.68
UBP1P25037 ASP3-2YLR157C 1089 nt10.8□□□□□ -0.68
UBP1P25037 ASP3-3YLR158C 1089 nt10.8□□□□□ -0.68
UBP1P25037 ASP3-4YLR160C 1089 nt10.8□□□□□ -0.68
UBP1P25037 BIO5YNR056C 1686 nt10.79□□□□□ -0.68
UBP1P25037 YJR154WYJR154W 1041 nt10.76□□□□□ -0.69
UBP1P25037 COS10YNR075W 1125 nt10.76□□□□□ -0.69
UBP1P25037 TAD2YJL035C 753 nt10.74□□□□□ -0.69
UBP1P25037 TPC1YGR096W 945 nt10.73□□□□□ -0.69
UBP1P25037 SDS24YBR214W 1584 nt10.73□□□□□ -0.69
UBP1P25037 SPG1YGR236C 288 nt10.72□□□□□ -0.69
UBP1P25037 ADA2YDR448W 1305 nt10.72□□□□□ -0.69
UBP1P25037 FLR1YBR008C 1647 nt10.72□□□□□ -0.69
UBP1P25037 YLR122CYLR122C 378 nt10.71□□□□□ -0.69
UBP1P25037 AMF1YOR378W 1548 nt10.7□□□□□ -0.7
UBP1P25037 LEU2YCL018W 1095 nt10.7□□□□□ -0.7
UBP1P25037 CMP2YML057W 1815 nt10.69□□□□□ -0.7
UBP1P25037 CYT2YKL087C 675 nt10.68□□□□□ -0.7
UBP1P25037 FUS3YBL016W 1062 nt10.68□□□□□ -0.7
UBP1P25037 PET494YNR045W 1470 nt10.68□□□□□ -0.7
UBP1P25037 MFT1YML062C 1179 nt10.67□□□□□ -0.7
UBP1P25037 LSB6YJL100W 1824 nt10.67□□□□□ -0.7
UBP1P25037 YPS3YLR121C 1527 nt10.66□□□□□ -0.7
UBP1P25037 PBP1YGR178C 2169 nt10.65□□□□□ -0.71
UBP1P25037 OPI3YJR073C 621 nt10.64□□□□□ -0.71
UBP1P25037 Q0010Q0010 387 nt10.64□□□□□ -0.71
UBP1P25037 FRE6YLL051C 2139 nt10.63□□□□□ -0.71
UBP1P25037 YDR455CYDR455C 309 nt10.63□□□□□ -0.71
UBP1P25037 RPR1RPR1 369 nt10.63□□□□□ -0.71
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