Protein–RNA interactions for Protein: B2RUR8

Otud7b, OTU domain-containing protein 7B, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud7bB2RUR8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Otud7bB2RUR8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Otud7bB2RUR8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Otud7bB2RUR8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Otud7bB2RUR8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Otud7bB2RUR8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Otud7bB2RUR8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Otud7bB2RUR8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Otud7bB2RUR8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Otud7bB2RUR8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Otud7bB2RUR8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Otud7bB2RUR8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Otud7bB2RUR8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Otud7bB2RUR8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Otud7bB2RUR8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Otud7bB2RUR8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Otud7bB2RUR8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Otud7bB2RUR8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Otud7bB2RUR8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Otud7bB2RUR8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Otud7bB2RUR8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Otud7bB2RUR8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Otud7bB2RUR8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Otud7bB2RUR8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Otud7bB2RUR8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Otud7bB2RUR8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Otud7bB2RUR8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Otud7bB2RUR8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Otud7bB2RUR8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Otud7bB2RUR8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Otud7bB2RUR8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Otud7bB2RUR8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Otud7bB2RUR8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Otud7bB2RUR8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Otud7bB2RUR8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Otud7bB2RUR8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Otud7bB2RUR8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Otud7bB2RUR8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Otud7bB2RUR8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Otud7bB2RUR8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Otud7bB2RUR8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Otud7bB2RUR8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Otud7bB2RUR8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Otud7bB2RUR8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Otud7bB2RUR8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Otud7bB2RUR8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Otud7bB2RUR8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Otud7bB2RUR8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Otud7bB2RUR8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Otud7bB2RUR8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Otud7bB2RUR8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Otud7bB2RUR8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Otud7bB2RUR8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Otud7bB2RUR8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Otud7bB2RUR8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Otud7bB2RUR8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Otud7bB2RUR8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Otud7bB2RUR8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Otud7bB2RUR8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Otud7bB2RUR8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Otud7bB2RUR8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Otud7bB2RUR8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Otud7bB2RUR8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Otud7bB2RUR8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Otud7bB2RUR8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Otud7bB2RUR8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Otud7bB2RUR8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Otud7bB2RUR8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Otud7bB2RUR8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Otud7bB2RUR8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Otud7bB2RUR8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Otud7bB2RUR8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Otud7bB2RUR8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Otud7bB2RUR8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Otud7bB2RUR8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Otud7bB2RUR8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Otud7bB2RUR8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Otud7bB2RUR8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Otud7bB2RUR8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Otud7bB2RUR8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Otud7bB2RUR8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Otud7bB2RUR8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Otud7bB2RUR8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Otud7bB2RUR8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Otud7bB2RUR8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Otud7bB2RUR8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Otud7bB2RUR8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Otud7bB2RUR8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Otud7bB2RUR8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Otud7bB2RUR8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Otud7bB2RUR8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Otud7bB2RUR8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Otud7bB2RUR8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Otud7bB2RUR8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Otud7bB2RUR8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Otud7bB2RUR8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Otud7bB2RUR8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Otud7bB2RUR8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Otud7bB2RUR8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Otud7bB2RUR8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms