Protein–RNA interactions for Protein: A2TJV2

Palm3, Paralemmin-3, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palm3A2TJV2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Palm3A2TJV2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Palm3A2TJV2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Palm3A2TJV2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Palm3A2TJV2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Palm3A2TJV2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Palm3A2TJV2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Palm3A2TJV2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Palm3A2TJV2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Palm3A2TJV2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Palm3A2TJV2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Palm3A2TJV2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Palm3A2TJV2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Palm3A2TJV2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Palm3A2TJV2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Palm3A2TJV2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Palm3A2TJV2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Palm3A2TJV2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Palm3A2TJV2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Palm3A2TJV2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Palm3A2TJV2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Palm3A2TJV2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Palm3A2TJV2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Palm3A2TJV2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Palm3A2TJV2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Palm3A2TJV2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Palm3A2TJV2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Palm3A2TJV2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Palm3A2TJV2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Palm3A2TJV2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Palm3A2TJV2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Palm3A2TJV2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Palm3A2TJV2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Palm3A2TJV2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Palm3A2TJV2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Palm3A2TJV2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Palm3A2TJV2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Palm3A2TJV2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Palm3A2TJV2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Palm3A2TJV2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Palm3A2TJV2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Palm3A2TJV2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Palm3A2TJV2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Palm3A2TJV2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Palm3A2TJV2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Palm3A2TJV2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Palm3A2TJV2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Palm3A2TJV2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Palm3A2TJV2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Palm3A2TJV2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Palm3A2TJV2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Palm3A2TJV2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Palm3A2TJV2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Palm3A2TJV2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Palm3A2TJV2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Palm3A2TJV2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Palm3A2TJV2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Palm3A2TJV2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Palm3A2TJV2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Palm3A2TJV2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Palm3A2TJV2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Palm3A2TJV2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Palm3A2TJV2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Palm3A2TJV2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Palm3A2TJV2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Palm3A2TJV2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Palm3A2TJV2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Palm3A2TJV2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Palm3A2TJV2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Palm3A2TJV2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Palm3A2TJV2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Palm3A2TJV2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Palm3A2TJV2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Palm3A2TJV2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Palm3A2TJV2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Palm3A2TJV2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Palm3A2TJV2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Palm3A2TJV2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Palm3A2TJV2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Palm3A2TJV2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Palm3A2TJV2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Palm3A2TJV2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Palm3A2TJV2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Palm3A2TJV2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Palm3A2TJV2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Palm3A2TJV2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Palm3A2TJV2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Palm3A2TJV2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Palm3A2TJV2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Palm3A2TJV2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Palm3A2TJV2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Palm3A2TJV2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Palm3A2TJV2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Palm3A2TJV2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Palm3A2TJV2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Palm3A2TJV2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Palm3A2TJV2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Palm3A2TJV2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Palm3A2TJV2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Palm3A2TJV2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms