Protein–RNA interactions for Protein: A2A9H6

Gm884, Predicted gene 884, mousemouse

Predictions only

Length 3,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm884A2A9H6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm884A2A9H6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Gm884A2A9H6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm884A2A9H6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm884A2A9H6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm884A2A9H6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm884A2A9H6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm884A2A9H6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm884A2A9H6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm884A2A9H6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm884A2A9H6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm884A2A9H6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm884A2A9H6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm884A2A9H6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm884A2A9H6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm884A2A9H6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gm884A2A9H6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm884A2A9H6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm884A2A9H6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm884A2A9H6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm884A2A9H6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm884A2A9H6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm884A2A9H6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm884A2A9H6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm884A2A9H6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm884A2A9H6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm884A2A9H6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm884A2A9H6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm884A2A9H6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm884A2A9H6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm884A2A9H6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm884A2A9H6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm884A2A9H6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm884A2A9H6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm884A2A9H6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm884A2A9H6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm884A2A9H6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm884A2A9H6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm884A2A9H6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm884A2A9H6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm884A2A9H6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm884A2A9H6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm884A2A9H6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm884A2A9H6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm884A2A9H6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm884A2A9H6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm884A2A9H6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm884A2A9H6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm884A2A9H6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm884A2A9H6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm884A2A9H6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm884A2A9H6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm884A2A9H6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm884A2A9H6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm884A2A9H6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm884A2A9H6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm884A2A9H6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm884A2A9H6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm884A2A9H6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm884A2A9H6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm884A2A9H6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm884A2A9H6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm884A2A9H6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm884A2A9H6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm884A2A9H6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm884A2A9H6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm884A2A9H6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm884A2A9H6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm884A2A9H6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm884A2A9H6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm884A2A9H6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm884A2A9H6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm884A2A9H6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm884A2A9H6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm884A2A9H6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm884A2A9H6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm884A2A9H6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm884A2A9H6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm884A2A9H6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm884A2A9H6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Gm884A2A9H6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Gm884A2A9H6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm884A2A9H6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm884A2A9H6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm884A2A9H6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm884A2A9H6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm884A2A9H6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm884A2A9H6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm884A2A9H6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm884A2A9H6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm884A2A9H6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm884A2A9H6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm884A2A9H6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm884A2A9H6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm884A2A9H6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm884A2A9H6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm884A2A9H6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm884A2A9H6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm884A2A9H6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm884A2A9H6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 146.7 ms