Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
TNIKQ9UKE5 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
TNIKQ9UKE5 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
TNIKQ9UKE5 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
TNIKQ9UKE5 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
TNIKQ9UKE5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC33.46■■■□□ 2.95
TNIKQ9UKE5 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
TNIKQ9UKE5 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
TNIKQ9UKE5 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
TNIKQ9UKE5 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
TNIKQ9UKE5 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
TNIKQ9UKE5 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
TNIKQ9UKE5 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
TNIKQ9UKE5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
TNIKQ9UKE5 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
TNIKQ9UKE5 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
TNIKQ9UKE5 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.94
TNIKQ9UKE5 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
TNIKQ9UKE5 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TNIKQ9UKE5 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
TNIKQ9UKE5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TNIKQ9UKE5 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
TNIKQ9UKE5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TNIKQ9UKE5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TNIKQ9UKE5 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TNIKQ9UKE5 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
TNIKQ9UKE5 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
TNIKQ9UKE5 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
TNIKQ9UKE5 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
TNIKQ9UKE5 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
TNIKQ9UKE5 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
TNIKQ9UKE5 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
TNIKQ9UKE5 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.44■■■□□ 2.94
TNIKQ9UKE5 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TNIKQ9UKE5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TNIKQ9UKE5 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
TNIKQ9UKE5 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
TNIKQ9UKE5 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
TNIKQ9UKE5 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
TNIKQ9UKE5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
TNIKQ9UKE5 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
TNIKQ9UKE5 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC33.43■■■□□ 2.94
TNIKQ9UKE5 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
TNIKQ9UKE5 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
TNIKQ9UKE5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
TNIKQ9UKE5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
TNIKQ9UKE5 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
TNIKQ9UKE5 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
TNIKQ9UKE5 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
TNIKQ9UKE5 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
TNIKQ9UKE5 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
TNIKQ9UKE5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
TNIKQ9UKE5 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
TNIKQ9UKE5 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
TNIKQ9UKE5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
TNIKQ9UKE5 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
TNIKQ9UKE5 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
TNIKQ9UKE5 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
TNIKQ9UKE5 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
TNIKQ9UKE5 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
TNIKQ9UKE5 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
TNIKQ9UKE5 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
TNIKQ9UKE5 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
TNIKQ9UKE5 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
TNIKQ9UKE5 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
TNIKQ9UKE5 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
TNIKQ9UKE5 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
TNIKQ9UKE5 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
TNIKQ9UKE5 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
TNIKQ9UKE5 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
TNIKQ9UKE5 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
TNIKQ9UKE5 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
TNIKQ9UKE5 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
TNIKQ9UKE5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
TNIKQ9UKE5 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
TNIKQ9UKE5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
TNIKQ9UKE5 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
TNIKQ9UKE5 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
TNIKQ9UKE5 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
TNIKQ9UKE5 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
TNIKQ9UKE5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
TNIKQ9UKE5 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
TNIKQ9UKE5 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
TNIKQ9UKE5 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
TNIKQ9UKE5 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
TNIKQ9UKE5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
TNIKQ9UKE5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
TNIKQ9UKE5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
TNIKQ9UKE5 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
TNIKQ9UKE5 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
TNIKQ9UKE5 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
TNIKQ9UKE5 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
TNIKQ9UKE5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
TNIKQ9UKE5 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TNIKQ9UKE5 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TNIKQ9UKE5 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TNIKQ9UKE5 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TNIKQ9UKE5 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TNIKQ9UKE5 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TNIKQ9UKE5 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms