Protein–RNA interactions for Protein: Q12309

CLF1, Pre-mRNA-splicing factor CLF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 687 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CLF1Q12309 BOI1YBL085W 2943 nt3.25□□□□□ -1.89
CLF1Q12309 MET6YER091C 2304 nt3.25□□□□□ -1.89
CLF1Q12309 NHP2YDL208W 471 nt3.24□□□□□ -1.89
CLF1Q12309 YMR158W-BYMR158W-B 321 nt3.24□□□□□ -1.89
CLF1Q12309 ROY1YMR258C 1662 nt3.24□□□□□ -1.89
CLF1Q12309 DSE4YNR067C 3354 nt3.23□□□□□ -1.89
CLF1Q12309 SLP1YOR154W 1764 nt3.23□□□□□ -1.89
CLF1Q12309 BPT1YLL015W 4680 nt3.23□□□□□ -1.89
CLF1Q12309 RRT13YER066W 558 nt3.23□□□□□ -1.89
CLF1Q12309 YAR053WYAR053W 297 nt3.23□□□□□ -1.89
CLF1Q12309 PRE8YML092C 753 nt3.23□□□□□ -1.89
CLF1Q12309 HSP10YOR020C 321 nt3.23□□□□□ -1.89
CLF1Q12309 YOR385WYOR385W 873 nt3.23□□□□□ -1.89
CLF1Q12309 YPL039WYPL039W 951 nt3.23□□□□□ -1.89
CLF1Q12309 NSL1YPL233W 651 nt3.23□□□□□ -1.89
CLF1Q12309 PRP8YHR165C 7242 nt3.23□□□□□ -1.89
CLF1Q12309 GNT1YOR320C 1476 nt3.22□□□□□ -1.89
CLF1Q12309 AYT1YLL063C 1425 nt3.22□□□□□ -1.89
CLF1Q12309 GPI14YJR013W 1212 nt3.22□□□□□ -1.89
CLF1Q12309 snR13snR13 124 nt3.22□□□□□ -1.89
CLF1Q12309 YPR203WYPR203W 309 nt3.22□□□□□ -1.89
CLF1Q12309 MKT1YNL085W 2493 nt3.21□□□□□ -1.89
CLF1Q12309 YCR081C-AYCR081C-A 237 nt3.21□□□□□ -1.9
CLF1Q12309 SIP18YMR175W 240 nt3.21□□□□□ -1.9
CLF1Q12309 YPP1YGR198W 2454 nt3.21□□□□□ -1.9
CLF1Q12309 NET1YJL076W 3570 nt3.21□□□□□ -1.9
CLF1Q12309 ALY1YKR021W 2748 nt3.2□□□□□ -1.9
CLF1Q12309 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt3.2□□□□□ -1.9
CLF1Q12309 RAD6YGL058W 519 nt3.2□□□□□ -1.9
CLF1Q12309 YHL037CYHL037C 402 nt3.2□□□□□ -1.9
CLF1Q12309 YIL012WYIL012W 342 nt3.2□□□□□ -1.9
CLF1Q12309 YKR033CYKR033C 426 nt3.2□□□□□ -1.9
CLF1Q12309 YPL080CYPL080C 327 nt3.2□□□□□ -1.9
CLF1Q12309 YLR001CYLR001C 2589 nt3.19□□□□□ -1.9
CLF1Q12309 VPS64YDR200C 1815 nt3.19□□□□□ -1.9
CLF1Q12309 GYP7YDL234C 2241 nt3.19□□□□□ -1.9
CLF1Q12309 NIC96YFR002W 2520 nt3.19□□□□□ -1.9
CLF1Q12309 YDL152WYDL152W 366 nt3.19□□□□□ -1.9
CLF1Q12309 SDC1YDR469W 528 nt3.19□□□□□ -1.9
CLF1Q12309 LAG1YHL003C 1236 nt3.19□□□□□ -1.9
CLF1Q12309 BAT1YHR208W 1182 nt3.19□□□□□ -1.9
CLF1Q12309 PET191YJR034W 327 nt3.19□□□□□ -1.9
CLF1Q12309 PHD1YKL043W 1101 nt3.19□□□□□ -1.9
CLF1Q12309 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt3.19□□□□□ -1.9
CLF1Q12309 ICY1YMR195W 384 nt3.19□□□□□ -1.9
CLF1Q12309 YBL108WYBL108W 306 nt3.19□□□□□ -1.9
CLF1Q12309 MES1YGR264C 2256 nt3.19□□□□□ -1.9
CLF1Q12309 PSY2YNL201C 2577 nt3.19□□□□□ -1.9
CLF1Q12309 PMR1YGL167C 2853 nt3.19□□□□□ -1.9
CLF1Q12309 BUB1YGR188C 3066 nt3.18□□□□□ -1.9
CLF1Q12309 YDR413CYDR413C 576 nt3.18□□□□□ -1.9
CLF1Q12309 YER097WYER097W 330 nt3.18□□□□□ -1.9
CLF1Q12309 AST2YER101C 1293 nt3.18□□□□□ -1.9
CLF1Q12309 VOA1YGR106C 798 nt3.18□□□□□ -1.9
CLF1Q12309 RPC10YHR143W-A 213 nt3.18□□□□□ -1.9
CLF1Q12309 MAM33YIL070C 801 nt3.18□□□□□ -1.9
CLF1Q12309 HEM4YOR278W 828 nt3.18□□□□□ -1.9
CLF1Q12309 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt3.18□□□□□ -1.9
CLF1Q12309 YPR014CYPR014C 330 nt3.18□□□□□ -1.9
CLF1Q12309 NFT1YKR103W 3657 nt3.18□□□□□ -1.9
CLF1Q12309 SNF12YNR023W 1701 nt3.17□□□□□ -1.9
CLF1Q12309 APC11YDL008W 498 nt3.17□□□□□ -1.9
CLF1Q12309 RPL29YFR032C-A 180 nt3.17□□□□□ -1.9
CLF1Q12309 VTI1YMR197C 654 nt3.17□□□□□ -1.9
CLF1Q12309 DGK1YOR311C 873 nt3.17□□□□□ -1.9
CLF1Q12309 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt3.17□□□□□ -1.9
CLF1Q12309 ROX1YPR065W 1107 nt3.17□□□□□ -1.9
CLF1Q12309 CAF120YNL278W 3183 nt3.17□□□□□ -1.9
CLF1Q12309 YHR078WYHR078W 1659 nt3.17□□□□□ -1.9
CLF1Q12309 YOL057WYOL057W 2136 nt3.16□□□□□ -1.9
CLF1Q12309 YML037CYML037C 1023 nt3.16□□□□□ -1.9
CLF1Q12309 RPL20AYMR242C 519 nt3.16□□□□□ -1.9
CLF1Q12309 YOR146WYOR146W 306 nt3.16□□□□□ -1.9
CLF1Q12309 UBP14YBR058C 2346 nt3.16□□□□□ -1.9
CLF1Q12309 SKT5YBL061C 2091 nt3.16□□□□□ -1.9
CLF1Q12309 BCK1YJL095W 4437 nt3.16□□□□□ -1.9
CLF1Q12309 GCD6YDR211W 2139 nt3.16□□□□□ -1.9
CLF1Q12309 TRZ1YKR079C 2517 nt3.16□□□□□ -1.9
CLF1Q12309 SPC72YAL047C 1869 nt3.16□□□□□ -1.9
CLF1Q12309 RGR1YLR071C 3249 nt3.15□□□□□ -1.9
CLF1Q12309 IRC4YDR540C 540 nt3.15□□□□□ -1.91
CLF1Q12309 YOR282WYOR282W 321 nt3.15□□□□□ -1.91
CLF1Q12309 YPR039WYPR039W 336 nt3.15□□□□□ -1.91
CLF1Q12309 FLO11YIR019C 4104 nt3.15□□□□□ -1.91
CLF1Q12309 GCD10YNL062C 1437 nt3.14□□□□□ -1.91
CLF1Q12309 YDL068WYDL068W 330 nt3.14□□□□□ -1.91
CLF1Q12309 GPI8YDR331W 1236 nt3.14□□□□□ -1.91
CLF1Q12309 HPA3YEL066W 540 nt3.14□□□□□ -1.91
CLF1Q12309 ERG28YER044C 447 nt3.14□□□□□ -1.91
CLF1Q12309 YHR214W-AYHR214W-A 486 nt3.14□□□□□ -1.91
CLF1Q12309 YJR023CYJR023C 402 nt3.14□□□□□ -1.91
CLF1Q12309 YAR068WYAR068W 486 nt3.14□□□□□ -1.91
CLF1Q12309 RPB11YOL005C 363 nt3.14□□□□□ -1.91
CLF1Q12309 EGD1YPL037C 474 nt3.14□□□□□ -1.91
CLF1Q12309 DPB11YJL090C 2295 nt3.14□□□□□ -1.91
CLF1Q12309 UTP14YML093W 2700 nt3.13□□□□□ -1.91
CLF1Q12309 IKI3YLR384C 4050 nt3.13□□□□□ -1.91
CLF1Q12309 YDR250CYDR250C 276 nt3.13□□□□□ -1.91
CLF1Q12309 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt3.13□□□□□ -1.91
CLF1Q12309 RPS7BYNL096C 573 nt3.13□□□□□ -1.91
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