Protein–RNA interactions for Protein: Q07084

SSK1, Osmolarity two-component system protein SSK1, yeastyeast

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Length 712 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSK1Q07084 BCK1YJL095W 4437 nt2.5□□□□□ -2.01
SSK1Q07084 JIP5YPR169W 1479 nt2.5□□□□□ -2.01
SSK1Q07084 NUM1YDR150W 8247 nt2.49□□□□□ -2.01
SSK1Q07084 YME2YMR302C 2553 nt2.49□□□□□ -2.01
SSK1Q07084 SWF1YDR126W 1011 nt2.49□□□□□ -2.01
SSK1Q07084 YDR194W-AYDR194W-A 153 nt2.49□□□□□ -2.01
SSK1Q07084 YDR209CYDR209C 414 nt2.49□□□□□ -2.01
SSK1Q07084 ADK1YDR226W 669 nt2.49□□□□□ -2.01
SSK1Q07084 YAL026C-AYAL026C-A 438 nt2.49□□□□□ -2.01
SSK1Q07084 GPI14YJR013W 1212 nt2.49□□□□□ -2.01
SSK1Q07084 RPL37AYLR185W 267 nt2.49□□□□□ -2.01
SSK1Q07084 RPS7BYNL096C 573 nt2.49□□□□□ -2.01
SSK1Q07084 SPB1YCL054W 2526 nt2.49□□□□□ -2.01
SSK1Q07084 NDD1YOR372C 1665 nt2.49□□□□□ -2.01
SSK1Q07084 YIL166CYIL166C 1629 nt2.49□□□□□ -2.01
SSK1Q07084 POM152YMR129W 4014 nt2.49□□□□□ -2.01
SSK1Q07084 AXL1YPR122W 3627 nt2.48□□□□□ -2.01
SSK1Q07084 CYR1YJL005W 6081 nt2.48□□□□□ -2.01
SSK1Q07084 HMF1YER057C 390 nt2.48□□□□□ -2.01
SSK1Q07084 RPL23BYER117W 414 nt2.48□□□□□ -2.01
SSK1Q07084 RPC10YHR143W-A 213 nt2.48□□□□□ -2.01
SSK1Q07084 JIP3YLR331C 378 nt2.48□□□□□ -2.01
SSK1Q07084 YML084WYML084W 309 nt2.48□□□□□ -2.01
SSK1Q07084 PSK1YAL017W 4071 nt2.47□□□□□ -2.01
SSK1Q07084 ECM5YMR176W 4236 nt2.47□□□□□ -2.01
SSK1Q07084 PSD2YGR170W 3417 nt2.47□□□□□ -2.01
SSK1Q07084 TRM2YKR056W 1920 nt2.47□□□□□ -2.01
SSK1Q07084 YIL082W-AYIL082W-A 4497 nt2.47□□□□□ -2.01
SSK1Q07084 YIL058WYIL058W 285 nt2.47□□□□□ -2.01
SSK1Q07084 TIM8YJR135W-A 264 nt2.47□□□□□ -2.01
SSK1Q07084 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt2.47□□□□□ -2.01
SSK1Q07084 snR13snR13 124 nt2.47□□□□□ -2.01
SSK1Q07084 TSC3YBR058C-A 243 nt2.47□□□□□ -2.01
SSK1Q07084 YBR085C-AYBR085C-A 258 nt2.47□□□□□ -2.01
SSK1Q07084 SLM6YBR266C 453 nt2.47□□□□□ -2.01
SSK1Q07084 YBR285WYBR285W 435 nt2.47□□□□□ -2.01
SSK1Q07084 PUF4YGL014W 2667 nt2.46□□□□□ -2.01
SSK1Q07084 YGR025WYGR025W 303 nt2.46□□□□□ -2.02
SSK1Q07084 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt2.46□□□□□ -2.02
SSK1Q07084 YOL134CYOL134C 390 nt2.46□□□□□ -2.02
SSK1Q07084 KEL2YGR238C 2649 nt2.45□□□□□ -2.02
SSK1Q07084 ESC1YMR219W 4977 nt2.45□□□□□ -2.02
SSK1Q07084 AI2Q0055 2565 nt2.45□□□□□ -2.02
SSK1Q07084 ATG31YDR022C 591 nt2.45□□□□□ -2.02
SSK1Q07084 IRC19YLL033W 693 nt2.45□□□□□ -2.02
SSK1Q07084 YAR047CYAR047C 321 nt2.45□□□□□ -2.02
SSK1Q07084 YOR053WYOR053W 342 nt2.45□□□□□ -2.02
SSK1Q07084 ATP15YPL271W 189 nt2.45□□□□□ -2.02
SSK1Q07084 UTP14YML093W 2700 nt2.45□□□□□ -2.02
SSK1Q07084 PES4YFR023W 1836 nt2.45□□□□□ -2.02
SSK1Q07084 PSY2YNL201C 2577 nt2.44□□□□□ -2.02
SSK1Q07084 YER188C-AYER188C-A 300 nt2.44□□□□□ -2.02
SSK1Q07084 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt2.44□□□□□ -2.02
SSK1Q07084 YHR214W-AYHR214W-A 486 nt2.44□□□□□ -2.02
SSK1Q07084 HYR1YIR037W 492 nt2.44□□□□□ -2.02
SSK1Q07084 YKL066WYKL066W 444 nt2.44□□□□□ -2.02
SSK1Q07084 YKL111CYKL111C 336 nt2.44□□□□□ -2.02
SSK1Q07084 YAR068WYAR068W 486 nt2.44□□□□□ -2.02
SSK1Q07084 ICY1YMR195W 384 nt2.44□□□□□ -2.02
SSK1Q07084 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt2.44□□□□□ -2.02
SSK1Q07084 YOR392WYOR392W 444 nt2.44□□□□□ -2.02
SSK1Q07084 YPR039WYPR039W 336 nt2.44□□□□□ -2.02
SSK1Q07084 ECM25YJL201W 1800 nt2.44□□□□□ -2.02
SSK1Q07084 PSO2YMR137C 1986 nt2.43□□□□□ -2.02
SSK1Q07084 SSE1YPL106C 2082 nt2.43□□□□□ -2.02
SSK1Q07084 SIN3YOL004W 4611 nt2.43□□□□□ -2.02
SSK1Q07084 NOP19YGR251W 591 nt2.43□□□□□ -2.02
SSK1Q07084 UBC7YMR022W 498 nt2.43□□□□□ -2.02
SSK1Q07084 MRPL33YMR286W 261 nt2.43□□□□□ -2.02
SSK1Q07084 ZEO1YOL109W 342 nt2.43□□□□□ -2.02
SSK1Q07084 ERP4YOR016C 624 nt2.43□□□□□ -2.02
SSK1Q07084 TRM7YBR061C 933 nt2.43□□□□□ -2.02
SSK1Q07084 YPL276WYPL276W 438 nt2.43□□□□□ -2.02
SSK1Q07084 SEC26YDR238C 2922 nt2.43□□□□□ -2.02
SSK1Q07084 LEU3YLR451W 2661 nt2.43□□□□□ -2.02
SSK1Q07084 YIL080WYIL080W 4722 nt2.43□□□□□ -2.02
SSK1Q07084 TOR1YJR066W 7413 nt2.42□□□□□ -2.02
SSK1Q07084 GIN4YDR507C 3429 nt2.42□□□□□ -2.02
SSK1Q07084 IKI3YLR384C 4050 nt2.42□□□□□ -2.02
SSK1Q07084 YGR121W-AYGR121W-A 216 nt2.42□□□□□ -2.02
SSK1Q07084 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt2.42□□□□□ -2.02
SSK1Q07084 NCE101YJL205C 162 nt2.42□□□□□ -2.02
SSK1Q07084 RGM1YMR182C 636 nt2.42□□□□□ -2.02
SSK1Q07084 YOR105WYOR105W 327 nt2.42□□□□□ -2.02
SSK1Q07084 YBR012CYBR012C 420 nt2.42□□□□□ -2.02
SSK1Q07084 SSY1YDR160W 2559 nt2.42□□□□□ -2.02
SSK1Q07084 SUL1YBR294W 2580 nt2.42□□□□□ -2.02
SSK1Q07084 NIC96YFR002W 2520 nt2.41□□□□□ -2.02
SSK1Q07084 ASG1YIL130W 2895 nt2.41□□□□□ -2.02
SSK1Q07084 SDH7YDR511W 402 nt2.41□□□□□ -2.02
SSK1Q07084 PET191YJR034W 327 nt2.41□□□□□ -2.02
SSK1Q07084 AIM32YML050W 936 nt2.41□□□□□ -2.02
SSK1Q07084 COX14YML129C 213 nt2.41□□□□□ -2.02
SSK1Q07084 RPL25YOL127W 429 nt2.41□□□□□ -2.02
SSK1Q07084 YOR029WYOR029W 336 nt2.41□□□□□ -2.02
SSK1Q07084 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.4□□□□□ -2.02
SSK1Q07084 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.4□□□□□ -2.02
SSK1Q07084 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.4□□□□□ -2.02
SSK1Q07084 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.4□□□□□ -2.02
SSK1Q07084 YER138CYER138C 5268 nt2.4□□□□□ -2.02
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